综述

如何将人类发展从对化石能源的开采、利用、排废的方式转变为利用生物的可持续性发展方式一致以来都是微生物代谢工程关注的热点。在过去二十年间，人们更多的投入到利用细菌和酵母等微生物进行工程改造，而使得其生产高价值产品方面，而随着工业革命带来的温室效应、化石能源耗竭等问题使得人类不得不考虑如何能实现整个生态系统的可持续发展上，但是目前对于工业生产所带来的废弃物如何循环在利用，特别是生物利用的研究明显滞后。近期一篇发表在Nature子刊，Nature Reviews Bioengineering的综述，总结介绍了针对一碳废物、园艺废物、食物废物和动物农业废物利用的一些新型微生物工程技术和应用，讨论了利用合成生物学和多组学来提高工程微生物废物利用的最新策略，对废物原料增值的未来的提出了一些观点。

生物质废物利用可持续发展不同废物质利用技术废物利用技术开发策略发展的关键问题

发酵乳

孙志宏等：发酵乳生态系统中乳酸菌间存在怎样的共生关系？（综述）

乳酸菌和乳制品产业在保障人类健康中发挥着重要作用，是承载人类营养和健康的民生产业。发酵食品中的微生物互作使得发酵过程中各菌群的相对丰度不断变化，进而提高食品的稳定性、安全性、风味和营养价值。近日，内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室张和平团队孙志宏研究员及团队在Critical Reviews in Food Science and Nutrition上发表综述，总结了近年来乳酸菌发酵剂在牛奶发酵生态系统中共生关系的研究进展，介绍了乳酸菌在发酵乳制品中的应用，并从代谢水平上的营养相互供给、种内与种间的群体感应等角度探讨了乳酸菌发酵剂在乳中的共生机制，并提供了发酵乳生态系统中微生物互作的最新信息和知识，值得关注和精读。

发酵乳乳酸菌综述基础研究发酵剂

肠神经系统

Nature Reviews：肠神经系统的建成、维持和修复（年度回顾）

肠道作为人体内最为重要的器官之一，其功能的实现以及与机体其他器官间的相互作用的调节的关键之一是肠神经系统。肠神经系统紊乱与很多肠道相关疾病有着密切的关系，因此在临床治疗中如何有效恢复和重建肠神经系统非常重要。近期一篇发表在Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology的综述回顾总结了2023年以来在肠神经系统建立、维持以及修复中的研究进展。

肠神经系统综述基础研究综述文章

植物乳杆菌

植物乳杆菌缓解神经系统疾病的潜力如何？（综述）

肠道生态失调与神经系统疾病有关，植物乳杆菌是一种具有广泛安全使用历史的乳酸菌，其作为精神生物的作用已被成功探索。近日，圣卡塔琳娜州联邦大学研究人员在Critical Reviews in Food Science and Nutrition发表最新综述，强调了肠道微生物群在大脑和肠道间的双向交流的重要作用。论述了精神生物制剂可以改善肠道环境，合成或刺激神经递质、SCFAs、抗炎激素和细胞因子的合成，证明其在精神障碍可发挥有益作用，并提示肠-脑-微生物群轴在心理障碍中具有巨大的探索潜力，值得关注。

植物乳杆菌神经系统疾病综述基础研究肠道菌群

饮食干预

一文读懂饮食与免疫互作对健康的影响（观点）

营养正在成为一种有前途的治疗工具来调节健康和疾病中的免疫系统，饮食干预的早期阶段是调节免疫和优化癌症治疗的关键时间窗口。近日，汉堡-埃彭多夫大学医学中心研究人员在Trends in Immunology发表最新综述，通过靶向肠道菌群及其衍生的代谢产物（色氨酸衍生物、短链脂肪酸等），剖析了短期的饮食干预与免疫间的互作如何影响宿主健康，值得关注。

饮食干预免疫综述基础研究营养物质

肠道菌群

孙志宏等：靶向肠菌或有助于治疗阿尔茨海默病？（综述）

尽管含β-淀粉样蛋白的细胞外斑块和含tau蛋白的细胞内神经原纤维缠结的积累是阿尔兹海默病的两个主要病理特征，但是其确切的发病机制仍然是不清晰。近日，内蒙古农业大学孙志宏及团队在Gut Microbes发表最新综述，概述了肠道菌群失调和AD间的联系和因果关系，论述了肠道微生物群驱动AD发展的机制，以及在AD的预防和/或治疗性临床前和临床干预研究中实施现有肠道微生物群靶向疗法（包括益生菌、益生元、合生元、后生元和粪菌移植）的成功和挑战，值得关注。

肠道菌群阿尔茨海默病综述基础研究代谢物

IBD指南

整合RCT和REW数据指导IBD临床治疗（综述）

炎症性肠病（IBD）是一种慢性免疫调节紊乱。临床上对其治疗通常需要长期的生物或者小分子药物治疗以期达到疾病的稳定缓解。对于疾病病理机制研究的深入以及相应的新干预技术的开发，对于该疾病的有效治疗有着巨大的推动作用。但是目前存在的问题是，治疗指南通常需要基于临床证据，一方面指南很难及时将最新的研究技术很快地整合进入常规治疗方案中，另一方面在指南在整合临床实践数据方面具有明显的短板。近期一篇发表在Gastroenterology上的综述通过对临床研究数据以及临床实践数据的回顾分析，为临床医生和研究人员提供了多种新的数据整合模式，以便于其了解证据来源的关键差异，以及如何应用不同的方法来比较新干预技术的有效性，进一步如何使用这些证据来更好地整合当前临床指南。

IBD指南新型治疗技术随机临床实验临床实践数据数据整合模式

蜜蜂-被子植物

蜜蜂-被子植物-微生物共生系统（综述）

共生关系是生态系统中不同物种生存和可持续进化的基础。自然界中蜜蜂和被子植物共生是一种稳定的共生关系，但这种稳定的共生关系中，除蜜蜂和被子植物外，微生物在其共生关系中发挥着非常重要的作用，因此此共生关系更多的应理解为蜜蜂-被子植物-微生物三方的共生关系，而微生物在这种共生关系中发挥中非常重要的作用。近期一篇发表在Trends in Ecology and Ecolution的综述对微生物在蜜蜂-被子植物共生和进化中的作用进行了总结和归纳，进一步明确了微生物在各种共生关系中的重要作用。

蜜蜂-被子植物共生关系微生物互惠作用综述

益生菌药物

刘双江+李祥锴+焦作义等：Probacine，“益生菌药物”新概念被提出！

大量的临床前研究已经证明了益生菌的疾病治疗机制和有效性。近日，兰州大学李祥锴、兰大二院焦作义、中科院刘双江及团队在MedComm发表最新研究，系统性分析了益生菌、益生元和后生元在健康和疾病领域的研究突破和有效性。首次将益生菌维持健康和治疗疾病的机制总结为“加法”和“减法”机制，并基于目前益生菌领域的研究成果、发展趋势和药物定义，前瞻性的提出“益生菌药物”（Probacine）这一全新的学术概念，值得关注。

益生菌药物健康综述基础研究肠道菌群

粪菌移植（FMT）

张发明团队：粪菌移植的未来发展（综述）

人类的肠道微生物包含一个复杂的微生物群体，其中有细菌、古细菌、病毒、真菌、寄生虫以及原生动物等。随着研究的深入，肠道菌群在维持人体健康的作用得到了广泛的认可。因而催生了粪菌移植（FMT）治疗生物群落紊乱相关疾病的临床应用方法。从2011至2021年间，临床报道FMT可以应用在85种疾病的治疗中。尽管FMT是一种有效的治疗手段，但是在由于移植供体粪便的成分非常复杂，导致了FMT临床应用和结果的高度的异质性，显著限制了其在临床的应用。基于此，科学家在不断开发和优化新型的FMT的模式，例如今年来出现的移植清洗过的粪便细菌群落或者粪便菌群的孢子移植，同时针对病毒在肠道微生态中的作用，也开发出了新的粪病毒移植方法。近期一篇南京医科大学第二附属医院张发明课题组发表在Advanced Science上发表了一篇关于粪菌移植的综述，回顾了临床发展历史，安全性以及法规相关内容，对于FMT面临的挑战和新兴方法学进行了讨论，为FMT未来的发展提出了新观点。

粪菌移植（FMT）历史安全性和法规存在问题新型技术

土壤菌群

Nature子刊：设计微生物组，改善土壤生态系统（综述）

人类活动对自然和管理下的土壤生态系统造成的压力越来越大，这促使人们研究减少这些负面环境影响的替代方法。近日，美国太平洋西北国家实验室研究人员在Nature Biotechnology发表最新综述，强调了采用跨学科方法来了解有益土壤微生物群的组成、动态和部署的必要性，以便通过恢复和保护健康的土壤生态系统来减轻或扭转对环境的破坏，值得关注。

土壤菌群微生物组工程综述基础研究土壤健康

自杀

Lancet子刊：童年诸多因素影响自杀风险（综述）

本综述总结了诸多自杀的危险因素，其中儿童时期的经历、父母死于自杀等，都可能增加其未来自杀的风险。本综述为未来进一步开展研究提供了重要的线索。

自杀综述危险因素

锯齿状结直肠癌

锯齿状结直肠癌的临床前研究（综述）

Trends in Cancer上发表的一篇综述文章，详细介绍了锯齿状结直肠癌的临床及分子特征、临床前模型、相关的基因突变及通路，并讨论了炎症相关信号及肠道菌群在其中的作用。

锯齿状结直肠癌综述

乳糜泻

一文了解乳糜泻最新研究进展（综述）

乳糜泻是一种由膳食麸质引起的自身免疫性疾病，影响世界约1%的人口，目前暂无治疗药物，只能依赖于饮食疗法缓解症状。Trends in Pharmacological Sciences最新综述总结了关于乳糜泻发病机制的最新研究进展，同时归纳了新兴非饮食疗法的开发现状。

乳糜泻综述

儿童哮喘

儿童哮喘与呼吸道微生物知多少（综述）

本综述系统介绍了微生物与儿童哮喘发生之间的关联，以及年龄和微生物生态位在其中的作用，对进一步开展相关研究具有重要的借鉴意义。

儿童哮喘综述微生物呼吸道菌群失调菌群

植物微生物组

Cell：植物微生物组科学面临的突破、挑战和机遇（综述）

跨物种和跨生态系统的植物微生物群的基本定义，加上还原论实验模型的开发以及利用微生物对植物表型的操纵，激发了人们将其应用于农业的兴趣。然而，绝大多数在实验室和温室中表现出植物生产力特征的微生物在田间都失败了。近日，北卡罗来纳大学教堂山分校研究人员在Cell发表最新综述，论述了将有益微生物从实验室转化到田间地头的最新突破、挑战和机遇，值得关注。

植物微生物组互作综述植物免疫系统多菌株

微生物癌症疗法

Cell子刊：“build-a-bug”-创新癌症疗法（综述）

许多全身施用的癌症疗法和药物都会表现出剂量限制性毒性，从而降低其有效性。Cell Host and Microbe发表的综述提出了“build-a-bug”新概念，旨在探讨如何利用细菌的基因组和合成生物学来提高癌症治疗的有效性和安全性。

微生物癌症疗法合成生物学综述

IBD

Lancet子刊：IBD临床试验的多样性（综述）

Lancet Gastroenterology & Hepatology上发表的一篇系统性综述，总结了627项随机对照试验（共涉及近11万名IBD患者），分析了IBD临床试验对多样性（包括种族、民族、年龄、地理区域、治疗药物、赞助商）的报道。

IBD 综述

细菌疗法

Nature Reviews：一文读懂细菌疗法和纳米颗粒在治疗领域的应用（综述）

微生物合成生物学和纳米医学领域在过去20年中取得的进展，使工程师得以设计和编程复杂度前所未有的细菌。这些工程细菌已在临床前研究中显示出成为潜在生物药物的可能性，尽管只有少数几种已进入高级临床试验并获得FDA批准。近日，哥伦比亚大学研究人员在Nature Reviews Bioengineering发表最新综述，强调了解决临床试验中的挑战，并讨论了细菌疗法与纳米医学的整合策略，以及如何改进细菌的传递和细菌行为的动态调节。此外，还指出了细菌来源的纳米颗粒和细菌用于生物诊断的潜在应用。最后，作者提到细菌疗法在临床开发和监管批准方面的挑战，值得关注。

细菌疗法纳米医学综述基础研究合成生物学

2型免疫反应

Naure Reviews：ILC2s和TH2细胞协同肠道驱虫的机理（观点）

Nature Reviews Immunology发表的观点性文章探讨了在肠道寄生虫感染中ILC2和TH2细胞相互协作驱虫的机制，并提出了感染中不同时期两类细胞互作的模型。

2型免疫反应肠道寄生虫感染综述

胰腺癌

Nature Reviews：胰腺癌的治疗进展（综述）

Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology上发表的一篇综述，总结了胰腺导管腺癌的现有治疗方案，包括化疗及靶向疗法，并讨论了正在进行中的临床研究。

胰腺癌综述

结直肠癌

Nature Reviews：一文读懂肠道菌群与结直肠癌的关系（综述）

结直肠癌（CRC）的发病率呈上升趋势，已是全球癌症相关死亡的第二大原因，迫切需要改进预防和治疗策略。肠道内数万亿计的微生物构成了肠道微生物群，已被证实与CRC的发生和进展有密切关系。近日，Nature Reviews Microbiology发表综述文章，总结近期关于CRC患者肠道微生物群整体扰动和特定微生物与CRC之间关联的研究证据，阐述了微生物驱动CRC发生的潜在机制以及复杂微生物群落在CRC发病机制中的可能作用，并展望了针对微生物的CRC预防和治疗策略的临床应用前景。

结直肠癌综述肠道菌群

mIBD

Nature Reviews：mIBD精准医疗报告标准（综述）

炎症性肠病通常认为为多因素导致。但随着基因组学研究的不断深入，现在已经有研究认为单个基因缺失与IBD有着密切关系，这种由于单个基因变异而引起的IBD称之为mIBD。mIBD由于其病因为单基因变异引起，因此可以进行针对性较强的靶向精准治疗，且临床上已经有各种不同的靶向精准治疗应用于mIBD的治疗。但是，目前对于mIBD的精准治疗尚缺乏统一的标准或者明确的专家共识。近期一篇发表在Nature子刊，Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology上的专家建议，回顾了近年来mIBD的精准治疗临床实践，提出了关于mIBD精准治疗的拟议标准。

mIBD 精准医疗报告标准综述医学研究

肠道菌群

Nature Reviews：生物地理学解析肠道菌群（综述）

生物地理学是宏观角度探究不同地域生物种群分布和进化的研究。随着近年来对肠道菌群研究的不断深入，以及转录组和单细胞技术的应用，使得人们已经可以在肠道这个微管环境中进一步明确不同种群在肠道中的分布，因此生物地理学的手段已经在肠道菌群的研究中开展应用。近期一篇发表在Nature Reviews Microbiology上的综述对近年来的肠道生物地理学研究进行了详细的回顾和总结，对于基于肠道生物地理学的肠道菌群与疾病的研究进行了展望。

肠道菌群生物地理学综述基础研究

溃疡性结肠炎（UC）

JAMA：一文读懂溃疡性结肠炎（综述）

溃疡性结肠炎（UC）是一种慢性结肠炎症，与遗传和环境因素有关，其在全球的发病率呈升高趋势。UC尚不可治愈，目前的治疗目标是缓解症状、改善生活质量并预防和治疗并发症。近日，JAMA发表综述文章，对UC的流行病学、病理生理学、临床症状、诊断、疾病的分层和治疗、患者管理和预后等方面进行了详细阐述，重点介绍了多种治疗药物的临床试验情况。

溃疡性结肠炎（UC）综述

结直肠癌

JAMA子刊：新辅助免疫检查点抑制剂，可改善大肠癌治疗（综述）

约15%的结直肠癌以错配修复缺陷（dMMR）为特征，导致微卫星不稳定性、高肿瘤突变负担和突变来源的新抗原增加。dMMR与免疫检查点抑制剂（ICIs）反应性相关，且新辅助ICIs治疗已在转移性dMMR结直肠癌中表现出良好的应答率。近日，JAMA Oncology发表综述文章，详细介绍了新辅助ICIs用于治疗局部dMMR结直肠癌的相关前瞻性临床试验和回顾性研究结果，展示了其在临床应答率和减轻不良反应以及改善器官保留方面的良好效果，同时介绍了新辅助ICIs应用于局部dMMR治疗尚需回答的问题。

结直肠癌综述 DNA错配修复缺陷(dMMR) 局部结直肠癌新辅助免疫治疗

更年期

全面认识更年期（综述）

本综述总结了有关女性更年期发生的机制、结果、护理和治疗等各方面的认识，第指导临床上开展更年期干预提供依据。

更年期综述

代谢紊乱

母亲代谢紊乱如何影响胎儿神经管缺陷的发生（综述）

随着代谢组学的研究火热，越来越多的研究者关注到母亲代谢系统疾病与胎儿发育之间的关联。本综述总结了母亲因饮食或疾病导致母体代谢水平紊乱导致胎儿神经管缺陷之间的潜在机制，为进一步开展相关研究提供基础。

代谢紊乱综述神经管缺陷

遗传风险评分

1型糖尿病的遗传风险评分研究（综述）

本综述总结了遗传风险评分工具在儿童1型糖尿病中的应用情况，指明了存在局限性和未来面临的挑战，为进一步开展研究工作提供了重要的理论依据。

遗传风险评分综述 1型糖尿病

食品脂质

食品脂质到食品脂质组学（综述）

诸多证据表明脂质对人类健康有益，这改变了消费者和营养学家对脂质在健康饮食中作用的普遍看法。但是，食品脂质是一个庞大且复杂的群体。为了更好的认识脂质，食品脂质组学被需要。本文先后综述了食品中常见的脂质及其特点，食品加工等对脂质的影响，食品脂质组学的发展现状等，又对食品脂质组学在未来脂质分析中的趋势做出预测。

食品脂质 authenticity computational methods food food quality