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仁济医院洪洁/蒋怡等Cell Metab：肠菌酶重编程巨噬细胞，提高抗TNF治肠炎效果

针对炎症性肠病抗TNF治疗原发性无应答的困境，结合宏基因组分析、小鼠模型及前瞻性临床试验，探究了肠道菌群功能酶的干预机制。

西北农林科大刘学波团队：高脂饮食打乱结肠炎症节律，低聚果糖通过菌群调控谷胱甘肽代谢“拨乱反正”

针对肥胖破坏肠道菌群及结肠炎症昼夜节律的问题，利用高脂饮食肥胖小鼠模型结合低聚果糖干预、时序多组学和结肠特异性基因敲低展开探索。

上海交大仁济医院刘尽尧团队NC：穿上肠细胞膜外衣的丁酸纳米药，修复肠道屏障抑制肿瘤

针对肠道屏障损伤促进消化系统肿瘤进展的问题，构建了仿肠上皮细胞膜包裹的丁酸酯纳米颗粒（EMBNs），并在葡聚糖硫酸钠诱导的雄性小鼠肿瘤模型中评估了干预效果。

青岛大学苏晓泉团队：跨越队列鸿沟，AI助力肠道微生态早期预警大肠癌

针对肠道微生物组在结直肠癌及癌前腺瘤跨队列检测中泛化性差的挑战，系统分析了15个全球队列的2053份宏基因组样本。

上海药物所丁侃/彭俊峰等：胰腺癌耐药元凶，一种瘤内细菌如何让吉西他滨失效？

针对胰腺导管腺癌吉西他滨耐药机制不明的问题，利用测序、培养组学及小鼠模型绘制了肿瘤内活菌图谱。

南方医院吴芃团队：肠胃不适伴随尿频，AKK菌或是推手

针对膀胱过度活动症与肠易激综合征共病机制不明的问题，整合人类队列与小鼠模型，利用逆行追踪、多组学及粪菌移植解析了肠-膀胱轴互作网络。

西北农林科技大武圣儒团队：缺失的好菌与胆汁酸，犊牛冠状病毒肠炎免疫紊乱的肠道微生态机制

为探究牛冠状病毒感染犊牛肠道免疫紊乱机制，对患病及健康对照犊牛空肠黏膜进行多组学整合分析。

沈阳药科大学孙孟驰团队Cell子刊：游动微藻搭载溶瘤病毒，吸入式微生物疗法狙击肺癌

可吸入微生物病毒联合体由聚乙二醇化腺病毒经点击化学偶联至运动性聚球藻Synechococcus WH8102构建，旨在克服肺癌溶瘤病毒疗法的物理屏障与免疫抑制难题。

陕西师大施琳团队：唾液联合乳杆菌XA1416调节肠肝轴代谢抵抗肥胖

为探寻抗肥胖益生菌，通过高通量筛选从健康人粪便获得高胆汁盐水解酶活性的唾液联合乳杆菌XA1416，并综合小鼠模型、细胞实验、人类遗传学与队列数据解析其机制。

南昌大学李剑团队：B细胞淋巴瘤化疗，罗伊氏粘液乳杆菌如何增效减毒？

针对弥漫性大B细胞淋巴瘤化疗耐药与毒性问题，利用临床队列、小鼠异种移植模型及多组学技术揭示了肠道菌群介导的化疗增敏机制。

南方医院张文娣/沈槟海等：Akk菌代谢物5-MIAA，调控结肠上皮信号，抑制肠炎癌变

针对嗜黏蛋白阿克曼氏菌（Akk）在结肠炎相关结直肠癌（CAC）中作用不明的问题，利用AOM/DSS小鼠模型、代谢组学及条件性基因敲除技术探索了其抑癌机制。

中国药科大学劳兴珍/封硕等NC：药物扰乱肠道菌群的“同源竞争”新机制，益生菌或成解药

为阐明非抗生素药物影响菌群的直接机制，通过计算预测细菌源性药物靶标蛋白同源物（BDTPHs），并进行了多尺度实验验证。

港中大黄秀娟/苏奇等Cell子刊：AI优化匹配供受体，粪菌移植疗效提升近半

针对粪菌移植（FMT）疗效个体差异大的问题，整合30个队列、12种疾病的515例FMT宏基因组数据，开发了基于多维特征的供受体匹配人工智能框架MOZAIC。

复旦焦娜团队Nature子刊：大语言模型DeepSeMS，破译海洋微生物组的巨大生物合成潜力

开发大型语言模型DeepSeMS，利用功能域序列表示和特征对齐的数据增强策略，解决了从生物合成基因簇（BGCs）直接翻译预测次级代谢产物（SMs）化学结构的难题。

陆军军医大学庄园团队：幽门螺杆菌“劫持”胃黏膜蛋白PPFIA4，促进定植与胃炎

针对幽门螺杆菌逃避免疫清除并驱动胃炎的机制，利用患者及小鼠模型探究了胃上皮细胞源性PPFIA4的病理功能。

南方医院陈烨团队：肠道蛋白巧用糖链喂养有益菌，为IBD治疗提供新靶点

针对炎症性肠病中肠上皮蛋白聚糖Syndecan-1（SDC1）维持黏膜稳态的机制不明问题，利用小鼠模型及多组学技术解析了宿主-菌群互作网络。

江南大学翟齐啸团队：辣椒素控糖新通路，肠道菌群是关键帮手

针对辣椒素降糖机制不明的问题，利用无菌小鼠、辣椒素受体TRPV1敲除模型及多组学技术解析了肠道菌群的介导作用。

华中科技大学宁康团队Nature子刊：肠菌产生硫酸化胆汁酸，缓解儿科脓毒症

为探究儿科脓毒症的肠道菌群-胆汁酸轴机制，整合队列多组学分析与小鼠、类器官功能实验。

南昌大学聂少平/谢俊华等Cell子刊：肠道益生菌囊泡跨越血脑屏障，或可改善阿尔茨海默病

针对肠道菌群失调驱动阿尔茨海默病（AD）机制不明的问题，利用APP/PS1小鼠模型及多组学技术解析了益生菌大肠杆菌Nissle 1917及其外膜囊泡的神经保护作用。

南方医院邓凡/胡敬娟等：肠菌代谢物ICA或是脓毒症风暴关键“刹车”分子

针对脓毒症器官损伤机制不明的问题，整合临床队列、Chac1-/-小鼠、粪菌移植及巨噬细胞实验探究了CHAC1的病理功能。