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中国科学院微生物研究所王军团队：肠菌暗藏“细胞因子”，或成抗癌新武器

为探索肠道菌群的新型免疫调节分子，使用隐马尔可夫模型（HMM）系统挖掘含细胞因子基序的细菌蛋白（CMCPs），并在Apcmin/+小鼠模型中通过工程菌EcN递送进行功能验证。

仁济医院洪洁团队Cell子刊：肠菌如何“教唆”免疫细胞，驱动IBD肠神经损伤？

针对炎症性肠病中肠神经元丢失的微生物驱动机制，整合患者多组学队列、小鼠结肠炎模型及细胞体系展开探究。

港中大黄子隽/于君等：肠癌耐药新机制，tRNA修饰酶成新靶点

为探究tRNA修饰在结直肠癌（CRC）中的作用，利用LC-MS、多组学测序、基因编辑及多种小鼠模型系统揭示tRNA腺苷到肌苷（A-to-I）修饰酶ADAT2的功能与机制。

肖敏凤/杜智华等NC：蛋白质语言模型照亮噬菌体“宿主暗物质”

针对环境中病毒暗物质宿主难以鉴定的问题，整合蛋白质语言模型与视觉变换器开发了VirHost Hunter计算框架，利用噬菌体尾部蛋白和裂解酶序列进行宿主预测。

浙大蒋超团队：塑料餐盒与食用油一同加热，释放海量纳米塑料直击肠屏障

为评估食用油加剧塑料容器释放微纳米塑料（MNPs）的健康风险，综合体外毒性、小鼠口服暴露及暴露建模，系统分析聚丙烯和聚乙烯容器的MNPs释放、毒性及安全阈值。

杨瑞馥/常宇骁等：从菌株到分子，一种细菌酶借力表观遗传促肠癌

微小微单胞菌（P. micra）促结直肠癌（CRC）的菌株特异性及毒力机制尚不明确，基于培养组学分离的99株临床菌株及APCMin/+小鼠模型构成了探究其致病机制的核心研究体系。

深圳先进院马迎飞/袁盛建等Cell子刊：肠道噬菌体的反击，解锁新型抗CRISPR蛋白家族

为探索人类肠道噬菌体抗CRISPR（Acr）蛋白的多样性，结合生物信息学与高通量功能筛选，挖掘靶向II型CRISPR系统的Acrs。

中科大王育才/汪沁等Science：菌群-肠-肝对话决定药物全身递送效果

针对体内递送系统（IDS）易被肝脏清除而削弱疗效的问题，利用抗生素耗竭、条件性基因敲除小鼠及活体成像技术，探究肠道菌群对肝脏库普弗细胞（KCs）吞噬功能的调控机制。

武汉协和医院蔺蓉/施慧英等：修复肠道神经，BMSC微囊泡为糖尿病胃肠病变提供新方案

针对糖尿病肠神经病变（ENS）缺乏根治手段的问题，利用糖尿病患者样本、小鼠模型及原代肠神经前体细胞（ENPCs）评估骨髓间充质干细胞微囊泡（BMSC-MVs）的疗效。

南农大韦中/李根等NC：土壤线虫如何重塑菌群守护作物健康

探究食细菌线虫作为捕食者如何驱动根际微生物组组装并抑制土传病害，结合野外调查、合成菌群及温室实验进行多尺度验证。

梁丽娴/戴磊等：高产c-di-AMP的肠道益生菌，激活STING抑制肿瘤

针对肠道共生菌产生环二腺苷酸（c-di-AMP）特征不明的问题，利用液相色谱-质谱联用技术及非小细胞肺癌小鼠模型，系统分析了51种人源肠道菌的代谢表型与抗肿瘤免疫效应。

天津医科大学房中则团队NC：环境毒素4-OHPhe如何损伤菌群加剧肥胖？

综合人群队列数据、小鼠模型及多组学技术，解析了环境污染物4-羟基菲（4-OHPhe）暴露加剧肥胖的代谢扰动机制。

谢鹏/谢晶等：补充约氏乳杆菌提升IPA水平，改善神经炎症和抑郁

为探究肠道菌群代谢物在抑郁症中的作用，研究利用慢性社会挫败应激（CSDS）小鼠模型，结合微生物组学、代谢组学及药理学干预。

中国农大王金锋/赵凤翔等：高脂vs多糖，饮食如何影响肠道病毒组及噬菌体-细菌互作？

为探究饮食对肠道病毒组及噬菌体-细菌互作的影响，整合6932个人类宏基因组数据进行荟萃分析，并结合高脂与褐藻多糖交替干预小鼠模型研究。

西农王禹/王伟等：瘤胃菌群与宿主上皮细胞如何联手，优化奶牛能量转化？

挥发性脂肪酸（VFAs）是反刍动物重要能量来源，为解析瘤胃VFAs的宿主-微生物共调控机制，对530头荷斯坦公牛进行基因组、转录组、微生物组和VFAs浓度的多组学整合分析。

郑大一附院任志刚/饶本臣等：肠道菌群助胆管癌无创诊断，一种双歧杆菌具抑癌潜力

针对胆管癌（CCA）缺乏无创诊断工具的临床难题，对中国三地共785例受试者进行宏基因组测序，构建并验证了基于肠道菌群的诊断模型。

南昌大学黄小林/李萍等：工程菌微机器人智能释药递送IL-2，爆破“冷”肿瘤

针对IL-2系统性毒性与靶向性缺陷，利用分泌IL-2变体的E. coli Nissle 1917构建仿生矿化微机器人，其沸石咪唑酯骨架外壳共载聚集诱导发光光敏剂与过氧化氢酶。

西湖大学郭天南/梁爽等Cell Metab：千人肠道宏蛋白质组，揭示衰老与代谢病背后的菌群功能转变

为解析肠道菌群蛋白质功能与宿主健康的关联，对1399名中老年人的1967份粪便样本进行了基于diaPASEF的大规模宏蛋白质组学分析。

上海十院蔚青/毕德玺等NC：新方法全面重塑梭杆菌属物种图谱

针对梭杆菌属分类学模糊性问题，本研究对540个梭杆菌基因组进行平均核苷酸一致性及系统发育分析，旨在建立统一分类框架。

中科院微生物所李明/赵会伟等：毒素抗毒素联手CRISPR，为工程菌添加安全锁

针对工程微生物生物防控的遗传不稳定难题，基于I-F型CRISPR-Cas及其关联毒素-抗毒素系统（CreTA），开发了双开关策略ATTACH。