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文章数：112篇

造血干细胞移植

造血干细胞移植前的肠道菌群多样性可预测儿童死亡率

Blood上发表的一项队列研究结果，在90名接受同种异体造血干细胞移植的儿童中发现，移植前较高的肠道菌群多样性与较高的总生存率、较低的急性移植物抗宿主病（aGvHD）发生率相关。

造血干细胞移植研究论文队列研究

肠道菌群与新冠严重程度间存在强关联（荟萃分析）

多项研究已经报道个体患者队列中肠道微生物组与新冠疾病严重程度间的关联，但其生物标志物在国际队列中的稳健性仍然存在问题。近日，科克大学研究人员在Gut Microbes发表最新研究，对新冠患者的8项宏基因组和23项16S研究进行荟萃分析，发现肠菌结构改变在感染后7-30天会达到高峰，并鉴定出较准确的新冠患者微生物组生物标志物，构建了预测模型，值得关注。

新冠肠道菌群荟萃分析基础研究宏基因组

粪菌移植或用于治疗胃肠道移植物抗宿主病

严重的胃肠道急性移植物抗宿主病（GI-aGvHD）是同种异体造血细胞移植预后不良和死亡的重要原因。仅有不到一般的患者在接受一线皮质类固醇治疗后完全缓解，而其他类固醇难治性患者死亡率很高，因此亟需寻找有效的二线疗法。已知造血细胞移植会显著改变患者的肠道菌群，而肠道菌群的紊乱可能是导致GI-aGvHD发生的重要因素。初步研究也已经表明粪菌移植（FMT）有助于改善GI-aGvHD患者的腹泻等胃肠道症状。近日，EClinicalMedicine发表了一项2期临床试验结果，证实了混合异体粪便菌群MaaT013移植在类固醇难治性GI-aGvHD患者当中的安全性和治疗有效性，有望为GI-aGvHD二线治疗方案提供新的选择。

Nature Reviews：抗生素对肠道菌群的广泛影响（综述）

抗生素引发的肠道菌群紊乱与多种胃肠道感染性和自身免疫性疾病有关。然而，由于肠道菌群是一个复杂的微生物生态网络，抗生素的作用可能具有高度可变性。随着用于微生物群落系统水平分析的多种方法的出现，人们开始识别在抗生素暴露和随后恢复期间影响微生物组动态的微生物组内和微生物组外因素。一项发表在Nature Reviews Microbiology上的综述文章讨论了影响抗生素暴露时肠道微生物组重建的因素，并概述了目前抗生素治疗引起的微生物群落变化的复杂情况，同时还强调了未来在进行抗生素特异性治疗时应考虑的基本因素。

抗生素肠道菌群药物-菌群-宿主互作

脊柱关节炎

脊柱关节炎及其伴随疾病的肠道菌群特征

脊柱关节炎（Spondyloarthritides，SpA）是一组具有共同临床和遗传特征的慢性炎症性疾病，常伴随指炎、葡萄膜炎、牛皮癣、炎症性肠病（IBD）等。该疾病具有家族聚集现象，并与HLA-B27基因相关。近期在《Arthritis & Rheumatology》上发表的一项研究发现，患有克罗恩病（CD）、急性前葡萄膜炎（AAU）和脊柱关节炎（SpA）的患者存在相似且特定的肠道菌群组成。研究还发现Fusicatenibacter属细菌与炎症性疾病密切相关，但该细菌在相关疾病中的作用仍需进一步研究。

脊柱关节炎肠道菌群自身免疫疾病

中山大学：微生物组+科赫法则解释疾病与病原体因果

这是发表在Microbiome上的一份工作，由中山大学的何建国团队完成。他们通过对白肌综合征(WMS)的拟穴青蟹进行菌群分析，鉴定疾病指示菌，又通培养组学获得疾病组织中的细菌和真菌。通过结合微生物组和培养组学，基于科赫法则对两者鉴定的菌株进行了回归感染实验验证，从而解释疾病的致病病原体。

肠易激综合征（IBS）

粪便中β-防御素-3分泌改变是肠道菌群紊乱的标志物

Gut Microbes近期发表的文章，利用混合抗菌素、高脂高糖饮食、高盐饮食和轻度束缚应激4种方法诱导小鼠肠易激及肠菌紊乱，分析发现饮食变化或抗生素暴露（这两种公认的IBS恶化因素）都诱导了显著的微生态失调，并伴有粪便β-防御素-3水平的变化。对粪便β-防御素的连续监测或可作为微生态失调的标志，并有助于识别那些可能受益于菌群干预治疗的IBS患者。

肠易激综合征（IBS） β-防御素-3

肠道菌群中的一些“口腔菌”与亚临床冠状动脉粥样硬化相关

肠道微生物群与动脉粥样硬化疾病有关，但它们与亚临床冠状动脉粥样硬化的关系尚不清楚。近日，瑞典乌普萨拉大学研究人员在Circulation发表最新研究，纳入8973名无明显冠状动脉粥样硬化的受试者，分析冠状动脉粥样硬化与肠道菌群的关联，发现肠道微生物群组成与冠状动脉粥样硬化和全身性炎症标志物间存在强关联，其特征是某些链球菌和其他常见口腔物种的丰度显著富集，值得关注。

口腔菌群冠状动脉粥样硬化研究论文基础研究肠道菌群

上海交大：补充罗伊氏乳杆菌或可缓解PCOS引起的血脂异常

多囊卵巢综合征（PCOS）是生育年龄妇女常见的一种复杂的内分泌及代谢异常所致的疾病，以慢性无排卵和高雄激素血症为主要特征。近日，上海交通大学医学院附属仁济医院杜艳芝、陈子江及团队在NPJ Biofilms and Microbiomes发表最新研究，通过长期黑暗治疗大鼠模型模拟昼夜节律失常引起的多囊卵巢综合征，发现补充罗伊氏乳杆菌可通过调节癸酸和GALR1信号传导缓解多囊卵巢综合征引起的血脂异常，值得关注。

益生菌血脂异常研究论文基础研究肠道菌群

影响婴儿肠道菌群组成的关键因素有哪些？

尽管婴儿肠道微生物群已被广泛研究，但尚未在大型婴儿队列中对包括技术变量在内的微生物群决定因素进行全面评估。近日，芬兰赫尔辛基大学研究人员在EBioMedicine发表最新研究，纳入985例婴儿（顺产824例，剖腹产161例），评估109个变量对其出生后2年内肠道菌群的影响，发现DNA提取批次、分娩方式、围产期暴露、排便频率和胎次/兄弟姐妹等因素会影响婴儿肠道菌群多样性和组成，但其影响重要性比例依次递减，值得关注。

肠道菌群婴儿研究论文基础研究围产期因素

调节菌群的营养食品改善2型糖尿病的血脂异常

Diabetes/Metabolism Research and Reviews近期发表的文章，对研究合生元对脂质分布影响的临床试验进行搜索，并进行了系统综述、荟萃分析和元回归。结果显示，补充益生菌、益生元、合生元能够改善糖尿病患者的血脂异常，并可降低心血管疾病风险。

2型糖尿病菌群调节系统综述与荟萃分析

限时饮食与热量限制饮食具有相同的减肥效果

肥胖是一个严重的健康问题，需要采取有效的减肥方法。传统的减肥饮食方法通常需要计算卡路里摄入量，即限制热量摄入（calorie restriction，CR），但这种方法不仅麻烦而且可能不准确。不计算卡路里的限时饮食（TRE）已经成为一种流行的减肥策略，因为它简单易行。然而，目前尚不清楚这种方法是否能够有效地产生减重效果，尤其是长期效果。最近发表在《Annals of Internal Medicine》上的一项随机对照实验显示，TRE可以达到与CR相同的减重效果。这项研究表明，通过限制进食的时间窗口，例如每天只在8小时内进食，可以有效地减少体重。尽管如此，仍需要更多的研究来验证其长期效果和安全性。

限时饮食肥胖随机对照临床研究

国内团队：肠道菌群和膳食成分摄入与新冠间有何关联？

越来越多的证据表明，肠道菌群和膳食摄入营养质量的改变与COVID-19有关。这些关联是否反映了因果关系尚不清楚。近日，成都大学附属医院Hanyu Zhang及团队在Clinical Nutrition发表最新研究，开展了一项双样本孟德尔随机化分析，发现肠道菌群和膳食成分摄入与新冠间有潜在关联，值得关注。

肠道菌群饮食成分研究论文基础研究孟德尔随机化

呼吸道病毒感染

国内团队：肠道菌群如何帮助宿主抵抗呼吸道病毒感染？

流行病学证据表明，有心理压力的人群感染甲型流感病毒（IAV）和SARS-CoV-2的可能性增加。浙江树人大学的史丽云和浙江大学的徐峰合作在Journal of Advanced Research发表文章，报道慢性束缚应激导致小鼠对流感病毒更敏感，这与肠道菌群失衡、血清GABA水平下降有关。机制上，肠道菌群产生GABA作用于肺部巨噬细胞（AM），维持AM稳态，帮助抵抗病毒感染。

呼吸道病毒感染肠道菌群 GABA

肠道微生物如何通过必需氨基酸与宿主互作？（综述）

近日发表在Annual Review of Microbiology上的综述总结了支链氨基酸（缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸）和色氨酸在宿主与肠道菌群间的互作方式，他们主要总结了微生物生产者从葡萄糖代谢产生三种支链氨基酸的具体途径，比较了目前支链氨基酸生产菌和消耗菌对宿主疾病发生发展的影响，包括胰岛素抵抗、肥胖、多囊卵巢综合征等，总结了色氨酸参与的犬尿氨酸途径、5-羟色胺途径和吲哚相关途径代谢通路，以及其如何串联宿主与肠道微生物。

黄曦+于君等：肥胖相关肠道菌群促进结直肠癌

肥胖是结直肠癌的危险因素，肠道菌群在介导肥胖促癌作用中的作用尚不清楚。香港中文大学黄曦、于君、Joseph J. Y. Sung与团队在EBioMedicine发表最新文章，研究发现肥胖人群的肠道菌群可促进结直肠癌的发生，该工作提示肥胖个体的菌群调节可能作为预防或治疗肥胖相关癌症（包括结直肠癌）的新方法。

肥胖结直肠癌研究论文基础研究肠道菌群

菌群代谢物

菌群发酵产生的氢气如何影响产丁酸菌？

这是发表在Microbiome上的一份工作，作者通过氢化酶有无的三株丁酸盐产生细菌，在添加氢气或者氢化酶抑制剂一氧化碳的条件下观察其发酵产物。他们发现氢气或一氧化碳会抑制有氢化酶活性丁酸盐生产者的乙酸盐和氢气发酵途径，同时促进丁酸盐、乳酸盐和甲酸盐发酵途径，而无氢化酶活性的丁酸盐生产者则无此表型。通过向人工菌群里引入甲烷生产者，发现了顶空氢气浓度与丁酸盐产物浓度的关系，同时也影响了丁酸盐生产者的适应性。他们同时在补充抗性淀粉的人群阵列数据中验证了这一结论。

菌群代谢物肠道菌群产丁酸菌

粪便菌群移植 (FMT)

FMT影响NAFLD患者肝脏DNA甲基化

患有非酒精性脂肪肝病（NAFLD）患者不仅肠道菌群发生变化，并且肝脏DNA甲基化可能发生改变。Gut Microbes最新研究性文章通过粪菌移植实验，揭示研究肠道菌群组成的变化与NAFLD中肝脏DNA甲基化改变是否有关。

粪便菌群移植 (FMT) DNA甲基化研究论文基础研究非酒精性脂肪肝病（NAFLD）

Nature Reviews：维持肝脏健康，肠道菌群有何关键作用？（综述）

肠道菌群是人体健康的重要调节因素，肠道菌群失衡可能导致疾病。肠道菌群、肝脏和免疫系统之间存在共生关系。环境因素，如高脂肪饮食和饮酒，可能破坏和改变肠道菌群，进而导致肠道屏障功能失调、菌群易位到肝脏以及肝病的发展或恶化。肠道微生物产生的代谢物的变化也可能导致肝脏疾病。发表在Nature Reviews Microbiology上的一项综述讨论了肠道菌群在维持健康方面的重要性，以及导致肝病的微生物介质的改变，并提出调控肠道菌群和/或其代谢物的策略，作为肝病的潜在治疗方法。

肠道菌群肝病菌群-肠-肝轴肠菌代谢

肠道噬菌体

影响人体肠道噬菌体变化的影响因素（综述）

肠道微生物组是人体消化道中密集且活跃的微生物和病毒的集合体。其中，细菌和噬菌体是最丰富的成员。相比于肠道细菌，肠道噬菌体的研究处于初步阶段。肠道噬菌体可能与肠道疾病的发生和发展有关。为了了解它们在人类健康和疾病中的作用，研究它们的生物学特性和相互作用非常重要。一篇发表在《Annual Review of Microbiology》上的综述总结了近期在研究肠道噬菌体群的分类结构和生态功能方面取得的进展。进一步研究肠道噬菌体的功能和机制，有助于深入了解肠道微生物与宿主之间的相互作用，为预防和治疗肠道相关疾病提供新的思路和方法。

肠道噬菌体肠道微生物噬菌体-菌群-宿主互作

浙江大学：新冠患者呼吸道和肠道抗生素耐药组的动态变化

抗生素抗性组是个体中存在的所有抗生素抗性基因（ARGs）的集合。浙江大学的陈瑜团队在Gut Microbes发表文章，对COVID-19不同进展时期的呼吸道、肠道的抗生素耐药基因进行分析，首次揭示了呼吸道和肠道抗生素耐药性在新冠肺炎进展和疾病严重程度中的动态变化，有助于更好地了解这种疾病如何影响不同的患者群体，有助于更好的诊断和治疗方案。

COVID‐19 抗生素耐药组呼吸道肠道

南开大学Cell子刊：致病性大肠杆菌感知烟酰胺，增强毒力、定植肠道

这是发表在Cell reports上的一份工作，由南开大学杨斌教授团队完成。他们发现了烟酰胺处理促进肠出血性大肠杆菌（EHEC）致病基因（LEE）的表达以及对宿主细胞的粘附，结合转录组测序发现双组份系统evgSA显著响应烟酰胺，通过基因敲除证明了evgSA在响应烟酰胺后激活毒力基因LEE表达和增加粘附的作用。其中EvgA直接结合ler基因的启动子并促其表达，并激活LEE毒力岛其他基因表达。烟酰胺可在小鼠体内帮助EHEC实现在大肠内的定植。

陈琦+陈廷涛等：肠菌失调如何促卵巢癌？

上皮性卵巢癌（EOC）是最致命的妇科癌症之一，严重威胁各年龄段的女性健康。肿瘤细胞减灭术联合辅助化疗是EOC的一线治疗方案，但由于发病隐匿，进展迅速，临床疗效并不显著。因此，探索EOC进展的潜在分子机制对于开发新的治疗方法具有重要意义。南昌大学第二附属医院陈琦、南昌大学陈廷涛与团队在Gut Microbes发表研究文章，阐明了EOC患者肠道菌群多样性和丰度的改变，并通过小鼠模型揭示了GM紊乱通过激活TLR4/NF-κB信号通路介导的Hh信号通路来促进EOC进展的机制，为EOC的评估和临床治疗提供了新思路，未来改善GM紊乱可能成为延缓EOC进展的有效途径，对EOC患者具有重要意义。

卵巢癌肠道菌群

显微镜下结肠炎

显微镜下结肠炎患者更易发生重大心血管不良事件

显微镜下结肠炎（MC）是一种结肠炎症性疾病，主要影响老年人尤其是女性，临床表现为水样腹泻，其发病率几乎达到其他慢性炎症性肠病水平。MC的治疗方案包括布地奈德作为诱导和维持疗法以及免疫调节剂，其诊断需要结肠活检和随后的组织病理学分析。虽然炎症性疾病与发生主要不良心血管事件（MACE）的风险增加有关。然而，在以人群为基础的MC的组织病理学队列中缺乏MACE的数据。Clinical Gastroenterology and Hepatology上的一项配对队列研究，旨在评估组织病理学确诊的MC患者中发生MACE的风险。结果表明，MC患者发生MACE的风险更高，每13名MC患者随访10年，就有一例额外的MACE病例发生。

显微镜下结肠炎流行病学配对队列研究医学研究 Cox比例风险模型

丁酸盐干预

丁酸如何通过调节巨噬细胞缓解NASH？

非酒精性脂肪性肝炎（NASH）的主要特征为脂肪变性和肝脏促炎免疫细胞浸润。包括肠道菌群失调在内的肠-肝轴不良症状已成为NASH的一个关键病因，并且肠道菌群代谢产物（比如短链脂肪酸）可通过多种机制调节NASH发病。然而，其中短链脂肪酸丁酸调节NASH的分子基础仍未完全阐明。Cell Death and Disease最新研究表明，丁酸钠通过抑制巨噬细胞分解代谢和吞噬作用，改变巨噬细胞极化表型，诱导促炎性巨噬细胞死亡，进而缓解NASH，其或可成为NASH的潜在治疗剂和预防剂。

丁酸盐干预非酒精性脂肪性肝炎（NASH）研究论文基础研究巨噬细胞

国内团队：胃酸响应性的ROS纳米生成器可有效治疗幽门螺杆菌感染

幽门螺杆菌感染可引起胃炎、胃溃疡、胃癌等多种胃病，且胃酸对抗生素的降解以及抗生素耐药菌株的流行降低了标准三联疗法的疗效，因此，目前迫切需要有效治疗幽门螺杆菌感染的策略。近日，中山大学丁鑫、袁佩妍团队联合新加坡国立大学杨义燕团队在Advanced Science发表文章，成功开发胃酸响应性的ROS纳米生成器可有效治疗幽门螺杆菌感染而不破坏肠道菌群稳态。

Nature子刊：微生物组检测中样本不同保存方式会引起较大偏差？

准确测量肠道菌群对于了解肠道微生物群与人类健康间的关系至关重要，但在样品处理中的偏差，从样品保存到文库制备，都会影响测量精度。近日，斯坦福大学研究人员在Nature Biotechnology发表最新研究，采集10名受试者粪便用直接冻存、OMNIgene和Zymo保护液3种方式保存后测序，发现样品储存可能会导致观察到的微生物测量值存在显著差异，其中OMNIgene保存液对样本DNA降解最小，还产生最高的总微生物载量估计值，推荐用于长时间运输或暴露在高温下的大型队列研究和绝对定量试验，而Zymo试剂盒可能更适合收集后立即冷冻的样品或用于计划评估宏转录组的研究，值得关注。

菌群定量误差研究论文基础研究标准化

Lancet子刊：胃肠道病原体综合分子即时检测助力肠胃炎快速诊断

腹泻是胃肠道常见病，可有多种病原体引起，也可由许多其他疾病和药物引起。因此，准确诊断腹泻病因有助于患者的治疗以及潜在传染风险的控制。基于粪便样本的胃肠道病原体检测耗时较长，而直肠拭子结合综合分子即时检测（mPOCT）或可快速得到诊断结果。英国南安普顿大学研究人员近日在The Lancet Infectious Diseases发表了GastroPOC试验的结果，表明与传统检测相比，mPOCT能够更快返回疑似肠胃炎患者的胃肠道病原体检测结果，可减少单人隔离病房的使用时间。本研究还发现mPOCT增加了抗生素的总体使用量，未来需要进一步研究以评估其影响。

国内团队：菌群标志物或可用于肝细胞癌的临床前诊断？

肠道菌群已被证明与肝癌的发生发展有关，最近多项研究也发现肠道菌群有作为肝癌诊断标志物的潜力。近日，温州医科大学第一附属医院陈钢、温州医科大学王怡及团队在Gut Microbes发表最新研究，通过回顾性队列和前瞻性队列证明了口腔菌群联合肠道菌群特征物种可作为肝癌诊断的有效手段，并从口腔、肠道及肿瘤组织多个生态位表征了肝癌患者微生物群的分布特点，值得关注。

菌群特征早期诊断研究论文基础研究随机森林

光声扫描成像技术体内评估结肠炎严重度

这是发表在Advanced Science上的一份工作，作者基于光栅扫描结合经腹吸收的液体室开发了一套可体内进行结肠血管系统成像的技术系统（TAG-RSOM），可识别结肠壁厚度、血容量和光学成像信号强度。文章中以小鼠模型为例，检验了TAG-RSOM的灵敏性以及其信号与疾病的相关性，发现TAG-RSOM检测到的结肠壁厚度与内镜和组织学疾病评估密切相关，表现出良好的形态学一致性。该技术或可与内窥镜中的光学成像系统结合，以期进入临床应用场景。

医学成像炎症性肠病结肠炎