拍了花宝贝

母乳寡糖影响婴儿期双歧杆菌群落的构建？

肠道菌群在婴儿健康和发育中发挥着重要作用，但决定肠道菌群落构建的生态过程知之甚少。根据生态学理论，微生物物种到达生态系统的时间和顺序会影响微生物群落构建，这种现象称为优先效应。双歧杆菌是婴儿肠道中含量丰富的早期定植菌，能够选择性地利用母乳中的母乳寡糖（HMO），然而优先效应在双歧杆菌群落构建中的作用仍不清楚。近日，发表在ISME Journal上的这篇文章，发现双歧杆菌亚群的到达顺序和母乳中HMO的决定性作用决定婴儿肠道中双歧杆菌群落构建。

结肠炎

Cell子刊：结肠炎中，创伤愈合可导致创始祖细胞的克隆扩张

癌症是炎症性肠病的常见结果，可能源于上皮损伤和愈合的反复循环。Developmental Cell近期发表的文章，通过研究急性小鼠结肠炎和正常愈合，发现在特化的伤口相关隐窝结构中，观察到高度增殖的上皮祖细胞群体的出现和大规模克隆扩增。

结肠炎创始祖细胞

兰州大学：宿主遗传和瘤胃菌群对胡羊体重的影响

可遗传瘤胃菌群是反刍动物生长性能的重要调节剂，然而目前尚无关于宿主遗传学-瘤胃菌群相互作用及其与绵羊表型的关联信息。近日，兰州大学李发弟、王维民团队在Microbiome上发表文章，对1150只胡羊羊羔的基因组、瘤胃菌群和体重进行了测定并关联分析，以探索体重表型的遗传型及驱动因素，发现雄性胡羔羊180天龄时体重具有39%的遗传率，而瘤胃菌群结构也存在遗传性，通过微生物特征为性状的全基因组关联研究（GWAS）确定了411个位点-类群的显著关联，其中瘤胃菌群对体重表型的影响可解释20%的体重表型变异性，这项研究揭示了宿主遗传变异、瘤胃微生物群和胡羊羔羊体重性状之间相互影响的关系。

炎症性肠病

多层面审视炎症性肠病愈合（综述）

内镜下粘膜愈合已成为炎症性肠病（IBD）包括克罗恩病（CD）和溃疡性结肠炎（UC）患者治疗的关键预后参数，这种类型的粘膜愈合的结构基础是肠道炎症的逐步消退，伴随溃疡的愈合和上皮屏障功能的改善。近期关于IBD不同层次愈合的综述发表于Gut，本综述讨论了各种类型愈合的定义，特别是内镜下粘膜愈合和组织学愈合，此外，本文还描述了各种治疗方法对IBD愈合的影响，以及粘膜愈合对IBD患者临床治疗的意义。最后，本文还讨论了用于评估愈合的技术，并介绍了新型愈合类型，如跨壁愈合和屏障愈合。

炎症性肠病

念珠菌

人体中念珠菌与细菌的相互作用（综述）

虽然白色念珠菌是健康人常见的定植菌，但它也会引起粘膜感染和严重的侵袭性疾病。研究人员一直致力于理解白色念珠菌是如何同时作为良性共生菌和侵袭性病原体存在的。发表在Trends in Microbiology上的一篇综述文章总结了白色念珠菌与细菌的相互作用如何影响宿主的微生物群落结构、免疫应答以及疾病机制。同时，也讨论了肠道菌群失调如何导致白色念珠菌感染的发生，加深了对其机会性致病机制的理解。

念珠菌真菌-细菌相互作用微生物-疾病

益生菌源的外膜囊泡

纳米益生菌用于治疗IBD

包括溃疡性结肠炎和克罗恩氏病在内的炎症性肠病是典型的慢性肠道炎症（IBD）。传统的抗炎治疗伴随很多副作用且疗效有限，因此亟需开发具有特异性的、新的治疗手段。肠道菌群紊乱是IBD的典型特征，因此改善肠道菌群是治疗IBD的重要的研究方向。目前已经形成粪菌移植和添加益生菌等治疗方法。尽管上述方法有一定的效果，但是粪菌移植依然存在较高的风险，因此开发低风险的菌群干预方法非常的迫切。近期沈阳药科大学孙进和浙江大学顾臻团队联合在Nano Letters上发表了其针对IBD治疗开发的最新方法。作者通过构建益生菌来源的外膜囊泡包封二氧化锰纳米酶，从而形成纳米益生菌的方法用于IBD的治疗，取得了良好的效果。相比较粪菌移植等细菌疗法，该方法具有更好的安全性。

益生菌源的外膜囊泡二氧化锰纳米酶纳米益生菌 IBD 研究论文

他汀类药物可降低IBD患者的大肠癌风险

炎症性肠病（IBD）患者更易罹患结直肠癌（CRC），控制肠道炎症能够降低CRC风险。目前，多数指南建议使用5-氨基水杨酸作为化学预防手段。他汀类药物也具有抗炎作用，已被证实能够降低克罗恩病风险，也与晚期结直肠腺瘤风险降低有关，但他汀类药物对CRC风险的影响尚不明确。近日，EClinicalMedicine发表研究，在瑞典全国性队列的5273对IBD患者及其匹配对照的队列中，确认他汀类药物的使用与较低的CRC发生率、CRC相关死亡率和全因死亡率相关，且用药时间越长，获益程度越大。本研究表明他汀类药物可能是IBD患者控制炎症以预防CRC的新的用药选择。

花生过敏发展中的肠道菌群和代谢组的纵向动态研究

花生过敏率的上升促使人们对其发展进行研究以预防和治疗提供信息，菌群及其代谢物决定食物过敏的风险。近日，发表在Journal of Allergy and Clinical Immunology上的这篇文章，深入了解花生过敏发展中的肠道菌群和代谢组动态，发现花生过敏的儿童幼儿期肠道菌群和代谢组的时间动态是不同的，为潜在预防花生过敏机制和策略提供了依据。

结直肠癌

Cell子刊：高脂饮食促大肠癌进展的新机制

Cell Reports近期发表的文章，发现高脂肪饮食是结直肠癌小鼠模型中盲肠微生物组和代谢组的主要决定因素，并提示微生物产生的特定结合型胆汁酸是疾病进展的潜在驱动因素。

结直肠癌胆汁酸高脂饮食

3-苯基丙酸

华中农业大学：肠菌衍生的3-苯基丙酸或可增强肠上皮屏障功能

肠上皮屏障可保护肠道免受病原体入侵、食物抗原和毒素的侵害。越来越多的研究将肠道菌群与肠上皮屏障功能联系起来。因此，挖掘促进肠上皮屏障功能的肠道菌群是迫切需要的。近日，华中农业大学晏向华及团队在Microbiome发表最新研究，利用宏基因组和16S测序评估7个猪品种的肠道菌群景观，通过粪菌移植发现中国本土江香猪肠菌中脆弱拟杆菌衍生的3-苯基丙酸通过激活芳烃受体（AhR）信号传导促进肠上皮屏障，值得关注。

3-苯基丙酸肠上皮屏障研究论文基础研究肠道菌群

饮食模式

浙江大学：健康饮食模式或可增加中年人的脑容量

浙江大学的刘足云团队在American Journal of Clinical Nutrition上发表的一项最新研究结果，在涉及近11.5万名中年参与者的前瞻性研究中，健康饮食模式表现出了对痴呆的非显著的保护作用；在包含1.8万多名中年参与者的横断面研究中，健康饮食模式与区域脑容量增加相关。

饮食模式研究论文前瞻性队列研究痴呆横断面队列研究

膳食多酚

国内团队：膳食多酚摄入或可降低高血压风险

华中科技大学同济医学院的应晨江团队与Chong Tian团队在American Journal of Clinical Nutrition上发表的一项队列研究结果，对1.1万名中国参与者进行多年随访，较高的膳食多酚摄入量与较低的高血压风险相关。

膳食多酚研究论文队列研究高血压

细菌性血流感染

Science子刊：早产儿的血流感染或源于肠道菌群

细菌性血流感染（BSI）导致晚发性败血症，影响多达一半的极早产儿，并具有显著的发病率和死亡率。新生儿重症监护室（NICU）中与BSI相关的细菌种类通常定植于早产儿肠道。Science Translational Medicine近期发表的文章，新生儿重症监护室中，BSI相关的病原体在肠道定植先于血流感染。

细菌性血流感染新生儿重症监护室肠道

宏基因组组装基因组 (MAGs)

陈卫华+赵兴明等：利用基因组分辨肠道宏基因组学计算策略的调查（综述）

恢复高质量宏基因组组装基因组对于探索微生物组成和微生物表型关联至关重要。但目前用于此目的的多种测序平台和计算工具可能会使研究人员感到困惑，因此需要进行广泛的评估。近日，复旦大学赵兴明、华中科技大学陈卫华及团队在Briefings in Bioinformatics发表最新综述，利用4种测序技术（mNGS、PacBio、Nanopore和metaHiC），在三个数据集上评估多种用于基因组解析宏基因组学的计算工具和测序平台，通过多个性能进而确定组装和分箱最佳工具，发现混合组装和基于metaHiC分箱组合的性能表现最好，其次是混合和长读长组装。

宏基因组组装基因组 (MAGs) 测序技术综述基础研究混合组装

抗生素

Nature子刊：资源竞争如何调节抗生素对微生物群落的影响？

抗生素治疗会对人类肠道微生物群产生重大影响，但目前还缺乏对抗生素如何影响群落多样性的定量了解。Nature Communications发表的研究，以资源竞争的经典生态模型为基础，研究群落对抗生素活动或其他生长抑制因素（如噬菌体）诱导的物种特异性死亡率的反应。结果发现，连续使用多种抗生素的顺序会对最终的群落结构产生质的影响，而抗生素组合的处理也会在群落多样性水平上产生协同或拮抗作用。这些现象完全源于资源竞争，与其他生物机制无关。重要的是，即使在物种众多的群落中，当存在代谢交叉供食的情况下，这些现象也普遍存在，这表明它们可能通常发生在微生物群落中。

抗生素资源竞争微生物生态学

复发性艰难梭菌感染

粪菌移植对IBD患者复发性艰难梭菌感染的疗效（荟萃分析）

炎症性肠病（IBD）显著增加患者发生艰难梭菌感染（CDI）的风险，且IBD患者的CDI治疗难度和复发风险均高于非IBD患者。粪便微生物群移植（FMT）已被证明可有效治疗复发性艰难梭菌感染（rCDI），也有研究表明其对IBD患者的rCDI有效，但尚缺少对相关临床益处的总体性评估。意大利天主教圣心大学研究人员近日在Journal of Autoimmunity发表文章，对15项涉及FMT治疗IBD患者rCDI的研究进行系统性综述和荟萃分析，发现FMT可在IBD患者中实现较高的rCDI治愈率，与在无IBD患者中观察到的数据类似，且多次FMT比单次FMT有更显著的疗效，支持FMT作为IBD患者rCDI的治疗方法。此外，这些研究中FMT后严重不良事件发生率高于无IBD人群，建议术后应对患者状况进行密切监测。

复发性艰难梭菌感染荟萃分析炎症性肠病（IBD）粪菌移植治疗效果

新方法鉴定影响肠道菌群β多样性的宿主遗传因素

Microbiome发表的这项研究建立了一个创新的全基因组关联分析方法——KRV框架，用于揭示影响肠道微生物组多样性的宿主遗传变异，相关发现现实免疫相关基因在塑造肠道微生物组成中具有重要作用。

RExMap

RExMap或可助力识别人类肠道核心物种？

RExMap 核心物种研究论文基础研究数据库

菌群定植

代谢独立性高的细菌更易在肠道定植

Genome Biology近期发表的文章，发现具有氨基酸、核苷酸和必需的微量元素的生物合成能力的高代谢独立性的细菌更易定植，这可能解释了为什么健康肠道微生物群中广泛存在但通常低丰度的成员可以在炎症条件下占主导地位，而与疾病没有任何因果关系。

菌群定植粪便菌群移植 (FMT) 代谢独立性

结肠炎

中科院：CsPbBr3钙钛矿纳米颗粒引起结肠炎样症状

铅基钙钛矿纳米粒子（Pb-PNP）具有优异的光电特性，是下一代光伏材料的潜在替代品。这引起了人们对其在生物系统中潜在的暴露毒性的极大关注。但到目前为止，其对胃肠道系统的不良影响，尚不清楚。中科院的谷战军团队在Small发表文章，发现CsPbBr3钙钛矿纳米颗粒(CPB PNPs)通过影响肠道屏障损伤和肠道微生物群失调引起结肠炎样症状。

结肠炎光伏肠道菌群

炎症性肠病（IBD）

感染瘤胃球菌的温和噬菌体

瘤胃球菌是一种常见的肠道微生物，在炎症性肠病（IBD）患者中丰度更高。Gut Microbes近期发表的文章，鉴定出感染瘤胃球菌的温和噬菌体，该噬菌体可与肠道细菌共存，在IBD患者肠道丰度也更高。

炎症性肠病（IBD）瘤胃球菌噬菌体

肥胖

Science：肥胖改变免疫代谢导致自身免疫（观点）

脂肪组织是一种免疫活性器官，通过产生脂肪细胞因子影响全身免疫反应，反之，免疫细胞通过产生促炎和抗炎细胞因子影响脂肪细胞稳态和代谢。近期发表于Science的观点性综述文章，讨论了肥胖引起的代谢超负荷如何影响免疫代谢增加自身免疫性疾病的易感性，以及如何干预免疫代谢来调控免疫耐受和自身免疫。

肥胖自身免疫观点 1型糖尿病（T1D）多发性硬化症（MS）

肉类加工

肉类加工及其对质量的影响（综述）

肉中含有丰富的脂质和蛋白质，两种物质极易在加工过程中氧化变质，从而影响肉制品质量和营养。本文系统综述了肉制品加工过程中的分子变化，以及进而产生的对肉制品质量的品质的影响。

肉类加工

野生蓝莓可以提升老年人的脑功能和降低血压

American Journal of Clinical Nutrition近期发表的文章，发现健康老年人每天摄入野生蓝莓（WBB）粉末（相当于178克新鲜野生蓝莓），可以改善血管和认知功能，并降低24小时动态收缩压。这表明，WBB（聚）酚可以降低老年人未来患心血管疾病的风险，并可能改善老年人认知能力下降的情景记忆过程和执行功能。

国内团队Nature子刊：用磁场操控工程菌，助力精准肿瘤免疫治疗

基于细菌的微纳生物机器人在肿瘤诊断和治疗方面具有巨大的潜力，以防药物在健康组织中释放和不良毒性，需要开发策略时空控制细菌基因表达和药物释放。近日，中国科学院纳米科学卓越创新中心聂广军、赵潇与团队在Nature Communications上发表文章，成功开发模块化设计的工程细菌，通过磁场时空操纵进行精准肿瘤免疫治疗。

牙周炎

上海九院：牙周炎如何促进动脉粥样硬化

牙周炎动脉粥样硬化具核梭杆菌研究论文基础研究

社交回避

Nature子刊：肠道T细胞如何影响心理应激反应？

肠道免疫系统与共生菌群相互作用以维持肠道稳态。压力可导致菌群组成改变，可能进一步促进大脑功能受损；然而，肠道免疫系统如何介导这些肠-脑轴效应尚待揭示。Nature Immunology近期发表文章，发现结肠γδ T细胞能通过dectin-1信号，调节对慢性社会压力的心理应激反应。这些发现或能为预防和治疗压力相关精神疾病（如抑郁症）提供新的干预思路。

社交回避结肠γδ T细胞 Dectin-1

鱼菌群

揭示鱼类相关微生物群中的核心物种

Microbiome近期发表的文章，通过将鳗鱼养殖池的微生物群作为模型系统，重建了9605种细菌和303种古菌在128天内的种群动态。同时通过整合微生物学、群落生态学和网络科学，探索鱼类相关微生物群复杂动力学中的关键物种和相互作用。

鱼菌群核心物种

临床前类风湿性关节炎

国内团队：肠道菌群管理预防类风湿关节炎（综述）

类风湿关节炎(RA)是一种慢性自身免疫性疾病，临床前RA阶段是RA治疗和预防的关键时期。肠道菌群可通过多种机制在诱导全身炎症，因此肠道菌群紊乱是RA进展的重要因素。而临床前RA的肠道菌群管理在改变持续炎症，成功治疗甚至预防RA具有很好的前景。近期华西医院牛倩课题组在Journal of Autoimmunity发表了一篇综述，详细总结了RA进展过程中肠道菌群的发病机制及治疗策略，为临床前RA的管理和预防关节炎进展提供了新的思路。

临床前类风湿性关节炎肠道菌群肠道菌群管理综述医学研究

饮食-菌群-宿主互作

NEMoE：基于饮食-微生物组-宿主互作的一种新型营养-生态专家混合模型

研究饮食-菌群-宿主健康间的互作可以促进个体的精准化医疗以及精准营养的发展。常规的方法通常根据饮食对患者进行分类再进行分析。Microbiome上发表的方法类文章，提出一种新型的营养-生态专家混合模型（NEMoE），同时考虑到饮食特异性与个体异质性，或能更真实反映菌群与宿主健康之间的关系。

饮食-菌群-宿主互作营养-生态专家混合模型研究论文