David J Gonzalez

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David J Gonzalez

文章数：5篇

多组学尺度研究克罗恩病的位置特异性特征

克罗恩病（CD）可在单独的疾病部位（如回肠或结肠），也可在多个部位（回结肠），目前单独的CD亚型如何影响CD的分子谱至今未知。近日发表在Microbiome的文章，利用宏蛋白质组学、鸟枪宏基因组学、16S rRNA 测序、代谢组学和宿主遗传学等多组学方法并配和临床内镜评估，以区分CD亚型。研究表明不同CD亚型具有显著差异且存在不同的位置特异性的病理特征，利用多组学方法有助于IBD生物标志物的发现。

克罗恩病肠道菌群多组学炎症性肠病

溃疡性结肠炎(UC)

Nature子刊：多组学分析揭示促结肠炎的肠菌酶

本研究中，作者有效地收集了溃疡性结肠炎（UC）患者的广泛宏组学特征并将其转化为具有生物学和治疗价值的假设。除了体外和体内验证外，通过整合粪便宏蛋白质组学、代谢组学、16S基因扩增子测序、鸟枪宏基因组测序、宏蛋白组学和血清蛋白质组学，作者证明了某些菌群成员，如普通拟杆菌（Bacteroides vulgatus）可能通过蛋白酶活性加剧UC疾病的活性。此外，鉴于作者的体外和体内实验的前景，本研究为进一步研究拟杆菌属蛋白酶抑制作为UC的治疗方法奠定了基础。总的来说，该研究突出了关于蛋白水解在拟杆菌中的作用的有前景的研究领域，并证明了源自普通拟杆菌的蛋白水解可能与UC病理学和治疗有关。

溃疡性结肠炎(UC) 肠道菌群多组学分析蛋白酶无菌小鼠

器官水平蛋白网络可作为微生物的宿主效应的参考

探索微生物群落对宿主影响的机理研究通常是由无菌小鼠完成。《Genome Research》的这篇文章为探索微生物定殖于肠道内外时不同蛋白的作用，使用蛋白质组学的方法分析鉴定小鼠不同器官的蛋白、建立蛋白网络并将其3D视化，使菌群研究者由此深入探究宿主-微生物互作下特定器官和生物体内的变化。

蛋白网络 microbiota Tandem Mass Tags Organ Proteomics gnotobiotic mice

低聚果糖（FOS）

Cell：可溶性膳食纤维+坏菌群，可引发小鼠肝癌！

菊粉、果胶和低聚果糖等可溶膳食纤维，经肠道菌群发酵为短链脂肪酸（SCFA），被认为有广泛的促进健康功效，比如缓解代谢综合征等疾病。然而Cell发表的最新研究再次敲响警钟，提醒人们这类有益纤维，在特定情况下（比如肠道生态失调），可能对健康有害。该研究发现，在肠道菌群失调的小鼠中，长期吃大量可溶性纤维，可诱导小鼠发生胆汁淤积、肝脏炎症和肝癌，这种作用一定程度上由SCFA介导。未来需对可溶纤维的健康功效进行更全面的分析，不仅关注其有益的一面，也要注意特定条件下的潜在害处，充分检测不同情况下的安全用量，为个性化使用膳食纤维以改善健康，铺平道路。

低聚果糖（FOS）菊粉研究论文啮齿动物（小鼠）细胞系实验

可溶性膳食纤维

Cell：可溶性膳食纤维+坏菌群，可引发小鼠肝癌！

菊粉、果胶和低聚果糖等可溶膳食纤维，经肠道菌群发酵为短链脂肪酸（SCFA），被认为有广泛的促进健康功效，比如缓解代谢综合征等疾病。然而Cell发表的最新研究再次敲响警钟，提醒人们这类有益纤维，在特定情况下（比如肠道生态失调），可能对健康有害。该研究发现，在肠道菌群失调的小鼠中，长期吃大量可溶性纤维，可诱导小鼠发生胆汁淤积、肝脏炎症和肝癌，这种作用一定程度上由SCFA介导。未来需对可溶纤维的健康功效进行更全面的分析，不仅关注其有益的一面，也要注意特定条件下的潜在害处，充分检测不同情况下的安全用量，为个性化使用膳食纤维以改善健康，铺平道路。

可溶性膳食纤维肠道菌群失调胆汁淤积性肝癌短链脂肪酸产短链脂肪酸细菌