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文章数：105篇

Nature子刊：细菌的宿主适应性进化中c-di-GMP的作用

这是发表在Nature Microbiology上的一份工作，作者通过十次实验进化，发现浅黄色假单胞菌在秀丽隐杆线虫体内的突变体出现褶皱形态（Rugose），并表现出生物膜增强及宿主体内持久性提高。通过全基因组测序发现突变体中环鸟苷二磷酸(c-di-GMP)水平都显著上调，其中突变发生在wspE、wspF和rph基因上，这些基因的突变导致了c-di-GMP增加。通过基因与临床患者分离频率观测到c-di-GMP与细菌和宿主适应性之间的关联。

用合生制剂更好地调节局部和系统性微生物代谢物

双歧杆菌是人类重要的肠道共生菌，尤其是在生命第一年的初始微生物组组装过程中。双歧杆菌的富集是通过利用母乳低聚糖（HMO）介导的，因为类似物种具有专门的基因组位点来运输和代谢这些聚糖，同时发酵产物释放到肠腔中，可能为宿主提供生理益处。益生菌物种与同源益生元的共生配对提供了竞争优势，因为益生元提供了营养生态位。Microbiome近期发表了文章，研究强化了共生微生物在肠道的定植并不能保证特定的功能输出，还需要考虑益生菌与益生元的联用，以达到最好的治疗效果。

合生元假小链双歧杆菌代谢物

Nature子刊：抗生素如何促进耐碳青霉烯肠杆菌科在肠道的生长

肠道是耐碳青霉烯肠杆菌（CRE）的主要定植位点，CRE可引起侵袭性感染（如血液感染）。广谱抗生素破坏肠道微生物群介导的定植抵抗，促进CRE在肠道内的扩张。Nature Communications近期发表的文章，发现抗生素处理导致一些肠道共生菌减少，通过富集营养和删除微生物代谢物，促进CRE的定植。

抗生素耐碳青霉烯肠杆菌

粪菌移植（FMT）

Gut：用粪菌移植治疗IBD的首个国际共识

目前，应用粪菌移植（FMT）治疗炎症性肠病（IBD）已经被报道，但是大部分试验设计均不同。本文拟就FMT治疗IBD达成一项共识，以使其更标准化。共25位来自不同专业领域的专家，基于现有证据，就FMT应用于IBD的发病机制和基本原理、供体选择和生物银行、FMT操作和未来研究考虑等方面达成相关共识，值得相关人士阅读。

粪菌移植（FMT）炎性肠疾病（IBD）

国内团队：筛选粪菌移植供体，警惕耐药菌！

香港中文大学Margaret Ip团队近期在Gut发表短文，总结了目前全球多个共识和指南文件中关于粪菌移植（FMT）供体筛选的举措，特别关注了对多药耐药菌的筛选。

粪菌移植供体筛选

卢元+郑浩：外加光/磁以控制熊蜂肠内工程菌的蛋白表达

这是发表在Small上的一份工作，由清华大学卢元与中国农业大学郑浩教授及团队完成。他们设计了两种纳米换能器，分别有光和磁控制产热。将两种换能器递送给熊蜂肠内，在体外施用磁场或者光照80min左右，可实现肠内热能显著上升。通过温敏型大肠杆菌工程菌株在体内验证了这种调控模式，并实现了工程菌产生目标蛋白产量的变化。该材料生物安全性较好，工程菌也能够稳定在熊蜂体内定植，因此可作为一套拓展用于肠道寄生虫病治疗和消除农药残留等问题的解决方案。

工程菌熊蜂

早发性结直肠癌

曹崟等：早发性结直肠癌或增加产妇的先兆子痫、剖腹产及早产风险

圣路易斯华盛顿大学曹崟与团队在EClinicalMedicine上发表的一项病例-对照研究，纳入149名早发性结直肠癌女性生育的207名新生儿，及1015名无结直肠癌女性生育的1019名新生儿，发现早发性结直肠癌与先兆子痫、剖腹产、紧急剖腹产、医学指示性早产的风险增加相关。

早发性结直肠癌研究论文病例-对照研究妊娠母婴

肠道疾病治疗

同济大学：开发可口服的益生菌纳米药物

益生菌的口服给药通常用于临床治疗肠道疾病，但益生菌在胃受到强酸性攻击，且裸益生菌的肠道定植效率较低。用合成材料包裹活的益生菌已被证明能够有效地使细菌适应胃肠道环境，但可能会使益生菌无法有效启动治疗反应。同济大学的林翰和施剑林团队合作在Nano Letters上发表文章，利用二维H-硅烯纳米材料（SiH@TPGS-PEI）构建益生菌保护层，保护益生菌抵抗胃酸性环境，提高肠道定植效果。

肠道疾病治疗纳米药物益生菌

张和平+张文羿：鼠李糖乳杆菌Probio-M9对肠道菌群和免疫的影响

益生菌在全球市场正在爆炸性增长，但目前关于食用益生菌是否对非患者有益仍存在争议。近日，内蒙古农业大学张和平团队联合张文羿团队在Microbiology spectrum上发表文章，发现鼠李糖乳杆菌Probio-M9可以收紧免疫与肠道菌群间的联系，并稳定肠道菌群的遗传变异。本研究揭示益生菌消费的影响被严重低估，为全面了解和评估益生菌的疗效提供了新的视角。

肠道菌群将疾病与人类基因组进化联系起来（观点）

这是发表在Trends in Genetics上的一篇观点文章，由华中农业大学张红雨及其团队完成。他们主要介绍了人类基因组上的特殊区域人类加速区（HARs）在特定疾病（如免疫、精神类疾病）发生发展上的重要作用，同时肠道菌群与HARs存在共同进化关系，HARs可调节肠道菌群的结构。作者也列举了一些HARs调节的肠道微生物参与特定疾病的研究结果，暗示肠道菌群可能作为疾病与人类基因组进化之间的重要介质。

吉林农大：母鸡自产卵起，便影响着后代的肠道发育与免疫？

营养物质会促进动物的免疫功能，母体良好的免疫也有利于后代健康。但母亲的免疫优势是如何转移给她们的后代，受益方式是什么？仍需深入探究。近日，吉林农业大学郑鑫及团队在Microbiome发表最新研究，将486只蛋鸡分为对照组和营养干预组，发现禽类肠道在胚胎期便开始微生物定植，这些微生物大多数溯源于母体生殖道，并且自胚胎期便影响着肠道的基因表达与发育。总之，该研究提出了生殖道菌群是改善动物健康的潜在资源之一，启发了禽类健康养殖的新方向，值得关注。

动物菌群母体效应肠道免疫肠道发育家禽

限制磷酸盐或可预防衰老引起的肌肉减少症

肌少症又称肌肉减少症，是指因持续骨骼肌量流失、强度和功能下降而引起的综合症。除了抗阻力运动外，目前缺少有效的治疗方法来预防肌少症。西班牙阿尔卡拉大学Gemma Olmos团队过去发现衰老相关的高磷血症与肌少症有关，近日该团队又在Journal of Cachexia, Sarcopenia and Muscle上发表最新文章，探究了衰老动物模型中限制磷酸盐饮食是否可以改善肌肉功能和结构，发现老年小鼠饮食中限制磷酸盐可以改善肌肉数量和质量、肌肉强度和身体机能。

衰老骨骼肌高磷酸盐血症肌少症研究论文

胆汁酸代谢

肠道菌群的胆汁酸调节及其与疾病的关联（综述）

Gastroenterology上发表的一篇综述，详细介绍了肠道菌群的胆汁酸代谢产物（尤其是短链脂肪酸）如何调控宿主的生理过程，并讨论了肠道菌群的胆汁酸代谢与多种疾病（非酒精性脂肪性肝病、IBS、结直肠癌、神经炎症、衰老等）的关联及背后机制。

胆汁酸代谢综述

具核梭杆菌

国内团队：具核梭杆菌感染通过产生腐胺会诱导食管癌加重？

食管鳞状细胞癌（ESCC）是一种上消化道恶性肿瘤，其发病机制和病因尚不清楚。由于肠道菌群通常会影响结直肠癌的进展、转移和免疫治疗反应，食管微生物群在ESCC中的作用逐渐引起人们的关注。先前多项研究发现具核梭杆菌（Fn）也会影响ESCC的预后。然而，其潜在机制尚不清楚。近日，山西医科大学崔永萍、北京大学肿瘤医院张维敏及团队在Microbiology spectrum发表最新研究，纳入73例ESCC样本，证实了Fn可以侵入ESCC细胞影响多胺代谢，从而促进其增殖，这表明食管微生物可能在临床环境中影响ESCC的进展，值得关注。

具核梭杆菌食管鳞状细胞癌研究论文基础研究多胺代谢

胰腺癌：流行病学、风险评估、早期发现和预防的新方法（综述）

胰腺癌通常导致生存率低，治疗选择有限，因为大多数受影响的个体表现为晚期疾病。早期发现侵袭前胰腺瘤和确定分子治疗靶点为延长生存提供了机会。虽然目前不建议对普通人群进行胰腺癌筛查，但新出现的证据表明，胰腺监测可以改善某些高危人群的预后。胰腺癌流行病学的变化、胰腺监测的经验和新型生物标志物的发现为胰腺癌风险评估、早期发现和预防的新策略提供了路线图

胆盐水解酶

Nature子刊：脆弱拟杆菌的胆盐水解酶或可促进结直肠癌发展

产肠毒素的脆弱拟杆菌（ETBF）被认为是结直肠癌（CRC）的主要微生物驱动因素之一，然而相比健康对照人群，CRC患者体内脆弱拟杆菌肠毒素的编码基因含量并未发生变化。有趣的是，不产肠毒素的脆弱拟杆菌（NTBF）在息肉粘膜中大量存在，似乎也与CRC发生发展相关。在NTBF中，胆盐水解酶（BSH）被认为是治疗代谢紊乱的有效靶点，但其在结肠肿瘤中的作用仍然未知。北京大学第三医院张志鹏团队与合作者，近期Nature Communications发表最新研究文章，揭示NTBF的BSH在结肠肿瘤发生中的促癌作用，并将BSH认定为CRC的潜在治疗靶点。

胆盐水解酶结直肠癌研究论文基础研究拟杆菌

早发性胃肠道癌

关注年轻人群的早发性胃肠道癌症（综述）

传统上，癌症被认为是老年人的疾病。然而近些年来，年轻人群中早发性胃肠道癌症的发病率显著上升。Cancer Discovery近期发表综述文章，从胃癌、结直肠癌和胰腺癌等三个方面对早发性胃肠道癌症的流行病学、遗传和环境因素、分子特征等特点进行了详细归纳，总结了早发性胃肠道癌症的手术及其他治疗方式对患者的长期影响，并对未来防治、筛查早发性结直肠癌的策略进行了展望。

早发性胃肠道癌综述胃癌结直肠癌胰腺癌

Cell子刊：婴儿早期体重或与肠道真菌有关

与细菌微生物组不同，早期肠道真菌在宿主代谢和儿童肥胖发展中的作用仍然不明确。近日，加拿大卡尔加里大学研究人在Cell Reports Medicine发表最新研究，评估了加拿大健康婴儿纵向发展队列中的100名婴儿肠道真菌与其出生5年间的体重指数Z评分（(BMIz）的相关性，发现生命早期和母体因素可能会共同影响生命前5年的生长动态，且与真菌群落的成熟模式和特定的真菌分类有关。总之，该研究表明肠道真菌可能对儿童早期发育产生重要影响，也强调未来需要更多研究重点关注肠道真菌在生命早期对人类健康的作用。

生命早期真菌组研究论文基础研究体重指数

国内团队：乳酸菌对不同纳米塑料的吸附性能及机制研究

纳米塑料（NPs）是一种广泛存在于各种水环境的新型污染物，易从食品包装、盐分、饮用水中摄入，对人类健康构成威胁，因此，目前迫切需要开发一种有效的方法从饮食中去除NPs或减轻其危害。河南师范大学杨清香团队在Chemosphere发表文章，评估了人类益生菌乳酸菌作为吸收剂将NPs从食物中去除的潜能，为开发肠道环境中去除NPs提供了新策略。

动态复杂网络模型

深圳先进院：动态网络模型助力研究阿尔茨海默病的肠道菌群干预

多项研究发现，肠道菌群和多种神经退行性疾病间密切相关，但是，肠道菌群是个复杂的微生态系统，除了组成和丰度的变化，如何进一步解析肠道细菌之间的复杂相互作用，探索不同健康状态下肠道菌群互作关系的变化，并推导可用于肠道菌群调控的枢纽细菌，值得深入研究。近日，深圳先进院陈宇及团队在Gut Microbes发表最新研究，基于阿尔茨海默病（AD）小鼠的肠道菌群，采用图论的方法构建了一套用于解析肠道菌群干预窗口期和推测肠道菌群干预靶点的动态复杂网络算法模型。利用肠道菌群及其功能分析，推断了对AD小鼠进行肠道菌群干预的窗口期和候选靶细菌。总之，该研究构建了一种基于肠道菌群数据的动态复杂网络评估模型，值得关注和推广。

动态复杂网络模型阿尔茨海默病研究论文基础研究图论法

Nature子刊：宿主-微生物如何共代谢产生马尿酸

人体肠道菌群产生数十种小分子，这些小分子在血液中循环，积累到与药物相当的水平，可影响宿主生理。尽管这些代谢产物对人类健康和疾病具有重要意义，但这些分子的来源及其在宿主中的命运仍然基本未知。Nature Communications近期发表的文章，揭示了一种宿主-微生物共代谢途径，以产生马尿酸，而马尿酸是哺乳动物尿液中最丰富的有机酸之一。即肠道细菌将苯丙氨酸还原为苯丙酸，宿主通过中链酰基辅酶a脱氢酶(MCAD)对苯丙酸进行β氧化产生马尿酸。

宿主-菌群代谢马尿酸

结直肠肿瘤

一文读懂大肠癌进化模式的最新见解（综述）

癌变仍然主要是一个进化过程，在这个过程中，基因组和表观遗传变化是先天获得的，其有助于在肿瘤微环境中选择有利的细胞表型以增加细胞适应度。发表在Gastroenterology上的一篇review以结直肠癌(CRC)为模型回顾了肿瘤测序对肿瘤进化的一些见解。表明CRCs对于驱动突变通常是细胞克隆存在，尽管它们对于拷贝数变化可能是异质的，但肿瘤在该阶段的进化可能是中性的，没有或非常弱的选择。另外，即使在选择确实起作用的地方，它也并不总是具有优势，而且可能被后天形成的基因组不稳定性所影响，这种不稳定性可以导致主驱动基因中微弱优势的体细胞突变以相对较高的频率产生。了解这些肿瘤进化模式对治疗CRCs以及理解其发展具有重要意义。

结直肠肿瘤前景展望突变结肠癌（CRC）肿瘤进化

Cell子刊：抗微生物预防性疫苗用于癌症预防

约15%的癌症（即每年200万例）是由微生物感染引起的，97%与幽门螺杆菌、人乳突病毒（HPV）、乙肝病毒（HBV）、丙肝病毒（HCV）、EBV相关。Cell Host and Microbe上发表的一篇评论文章，介绍了针对HBV、HPV及EBV的预防性疫苗在减少相关疾病及癌症中的作用，并展望了HCV及幽门螺杆菌的预防性疫苗开发工作。

肿瘤疫苗其他预防性疫苗

Cell子刊：针对结直肠癌开发具核梭杆菌疫苗

越来越多的证据表明，宿主-微生物互作与癌症的发生及进展相关，尤其是具核梭杆菌在结直肠癌的发生发展中发挥了重要作用。Cell Host and Microbe上发表的一篇评论文章，介绍了可用于结直肠癌治疗的几种肿瘤微生物疫苗，重点讨论了具核梭杆菌疫苗的开发。

肿瘤疫苗其他

肿瘤免疫治疗

国内团队：PD-1单抗用于局部错配修复缺陷结直肠癌的新辅助治疗

中山大学肿瘤防治中心的丁培荣团队、张晓实团队、潘志忠团队与云南省肿瘤医院的李云峰团队在Journal of the National Comprehensive Cancer Network : JNCCN上发表的一项最新研究结果，在73名局部错配修复缺陷结直肠癌患者中，基于PD-1单抗的新辅助治疗可诱导85%的客观应答，在接受手术或实现完全应答的患者中，2年无复发且总生存率100%，安全性良好。

肿瘤免疫治疗新辅助治疗研究论文医学研究以人为对象的临床试验

国内团队：大规模基因组监测揭示中国蜜蜂病毒的流行和进化特征

近年来，蜜蜂的经济和环境价值受到全球蜂群崩溃的严重挑战，这些崩溃通常是由传染病爆发引起。然而，由于缺乏全球范围内的大规模和纵向基因组监测，研究人员对蜜蜂病毒多样性、流行性和传播性的了解在很大程度上是模糊的。近日，中国农业科学院蜜蜂研究所徐书法、山东第一医科大学史卫峰及团队在Microbiome发表最新研究，通过宏转录组测序对中国不同地区有临床症状（爬行或颤抖等）东、西部蜜蜂及体外寄生虫螨约2000样本进行了详细表征，强调了中国两种主要蜜蜂物种中已知致病性蜜蜂病毒的广泛多样性和高流行性和遗传多样性，还鉴别到多种新的病毒并命名，对于未来使用合理干预手段减轻蜜蜂的病毒性传染病非常重要，值得关注。

蜜蜂病毒组研究论文基础研究全基因组

Nature子刊：特定益生元或可降血压

多项研究报道较高水平的纤维摄入量可促进健康，有利于降低血压、全因和心血管疾病死亡率。近日，澳大利亚蒙纳士大学研究人员在Nature cardiovascular research发表最新研究，开展了一项II期随机、安慰剂对照、双盲交叉试验的结果，20名未接受治疗的高血压患者被随机分配到每天40g克益生元乙酰化和丁基化高直链玉米淀粉（HAMSAB）或安慰剂组，每组完成3周，两组间有3周的洗脱期。发现接受HAMSAB治疗的患者24小时收缩压、动态收缩压和总血管阻力降低，无任何不良反应。HAMSAB干预还增加了乙酸和丁酸盐的水平，改变了肠道菌群结构，并提高了产SCFAs菌丰度。总之，该研究表明在原发性高血压患者中，使用HAMSAB进行益生元干预可能是一种有前途的策略，值得关注。

高血压

室内粉尘菌群与儿童的认知功能及行为相关

Microbiome上发表的一项最新研究结果，对172名学龄前儿童的住所粉尘菌群（包括细菌及真菌）进行分析，并评估其行为及认知功能，发现较高的室内真菌多样性与更好的行为及认知功能相关，而较高的室内微生物载量与较差的行为及认知功能相关。

室内菌群认知功能行为研究论文基础研究

翟齐啸团队：特异性多酚通过尿苷调控Akk菌

大量研究发现多酚影响肠道菌群，然而具有各种结构的多酚对菌群的影响及其作用机制仍不清楚。近日，江南大学翟齐啸团队在Food Chemistry上发表文章，探索四种不同结构的多酚对健康小鼠菌群和代谢物的不同调节作用。本研究突出探索外源性代谢物的重要性，并揭示多酚对菌群和代谢物影响的相似性。

AKK菌多酚

如何平衡长期使用FMT的有效性、安全性和创新性？（综述）

FMT（粪便菌群移植）是用健康个体的有益菌群重建患者菌群失调的手段，近年来发展颇为迅速。目前利用FMT治疗复发性艰难梭菌感染的效果非常积极，但依然存在一些并发症。近期发表在American Journal of Gastroenterology杂志上的一篇综述讨论了FMT的并发症，和在整个生命周期都将使用FMT治疗的儿童、成年人和老年人所涉及到的有效性、安全性和创新性，以及临床医生、研究人员和监管机构在推进FMT疗法时应该考虑如何平衡以上三者的关系，从而更好更长远地帮助相关疾病的患者。

粪菌移植复发性艰难梭菌感染有效性药物安全性创新性