Andre Franke

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Andre Franke

文章数：13篇

Nature子刊：人类遗传因素与皮肤菌群互作

Nature Communications近期发表的文章，阐述了宿主遗传因素和皮肤菌群的紧密关系。提示皮肤菌群可能是预防和治疗相关炎症性疾病的潜在靶点。

皮肤菌群宿主遗传因素研究论文

缓解期IBD患者的肠道菌群失调

Microbiology spectrum上发表的一项横断面队列研究结果，对比了缓解期IBD患者与健康对照的肠道菌群多样性及组成差异，发现IBD患者中的类黄酮降解菌富集，且鉴定出与克罗恩病相关的肠杆菌科可能导致慢性炎症。

IBD 研究论文横断面队列研究

肠道菌Parasutterella在肥胖和糖尿病中扮演什么角色？

最近研究表明，除了Akkermansia，Parasutterella sp.在2型糖尿病和肥胖症的发展中很重要。Gut Microbes,发表的文章，纳入1544名受试者，进行肠道菌群分析，探讨Parasutterella的特征，同时也在一个独立的队列（n = 438）中进行了主要验证。结果发现，Parasutterella与人类肥胖症和2型糖尿病有关，并可能涉及到一个新的饮食碳水化合物-微生物群-宿主代谢轴。其中对L-半胱氨酸的代谢可能与2型糖尿病的发展有关，而与脂肪酸生物合成途径的联系则与肥胖症发展中富含碳水化合物饮食的体重增加有关。

Parasutterella 肥胖 2型糖尿病脂肪合成代谢轴半胱氨酸

克罗恩病患者中富集的一种新型T细胞

来自Gut上发表的一项最新研究，鉴定出了一种新型T细胞群，表现出类似先天性免疫细胞的表型，以及非传统T细胞（黏膜相关恒定T细胞、NKT细胞）类似的基因表达，但具有独特的TCR（半恒定的TCR-α链），这类T细胞在克罗恩病患者的血液中富集。

克罗恩病 T细胞研究论文基础研究

近百万人的GWAS分析揭示痔疮的风险基因

来自Gut上发表的一项最新研究，对近百万人（包括超过20万名痔疮患者）进行GWAS分析，鉴定出了102个痔疮相关风险基因位点，发现痔疮与神经肌肉运动性、平滑肌收缩及胞外基质组织受损相关，而基于风险基因位点计算的痔疮多基因风险评分可鉴别出严重痔疮的高危人群。

痔疮研究论文基础研究全基因组关联分析（GWAS）风险基因

遗传-菌群互作

Nature子刊：近9000人的微生物组GWAS，发现血型影响肠菌

Nature Genetics最新发表的另一项微生物组全基因组关联研究，纳入了德国近9000人数据，鉴定出38个遗传-肠菌关联，包括ABO血型对特定肠道细菌的影响，并通过孟德尔随机化分析挖掘了潜在的肠道菌群与疾病间的因果效应。

遗传-菌群互作 Genetic association study Genetics genome-wide association studies INFLAMMATORY BOWEL DISEASE

原发性硬化性胆管炎（PSC）

原发性硬化性胆管炎中功能微生物组学的变化

原发性硬化性胆管炎（PSC）病人的肠道菌群组成发生变化，同时伴随着功能的改变。Gastroenterology近期发表的文章，对PSC（58%患有IBD）、健康对照、炎症性肠病患者（IBD）的粪便菌群进行宏基因组测序分析，发现PSC患者的肠道菌群发生变化，包括必需营养——维生素B6和支链氨基酸合成相关基因显著减少，同时血浆中代谢物的检测也验证这一表型。此外，代谢物的变化和疾病过程具有相关性，功能微生物或参与PSC的疾病进展。

原发性硬化性胆管炎（PSC）宏基因组维生素B6 支链氨基酸营养代谢

肠道菌群稳定性

Gut：肠道菌群的长期不稳定性与代谢疾病关系密切

疾病通常伴随着肠道菌群的组成和功能多样性的降低，但影响菌群长期稳定性的因素仍不清楚。Gut近期发表的一项德国队列研究，追踪分析了1282名参与者在研究开始时和5年后的肠道菌群变化，揭示了与菌群稳定性和不稳定性有关的多种因素和特征。该研究表明，脂肪肝病、糖尿病等代谢疾病和相关表型与菌群变得不稳定密切相关，提示这些疾病的患者可能更易罹患菌群失调相关疾病。恢复菌群稳定性是否有助于改善这些代谢疾病，有待进一步研究检验。

肠道菌群稳定性代谢性疾病脂肪肝疾病糖尿病机会致病菌

锌如何影响猪的肠道菌群组成和功能

ISME Journal近期发表的一项研究，分析了不同浓度和化学形式的膳食锌，对仔猪结肠菌群的组成和功能的影响。

锌猪肠道菌群

Cell子刊：高糖饮食促早死，嘌呤代谢或是关键

Cell Metabolism的这篇文章发现高糖饮食对果蝇高死亡率的影响是通过自然代谢废物---尿酸的累积造成的，并非传统认为的通过肥胖、血糖和血脂等因素，随后作者也利用人体实验数据证明人类饮食中的高糖成分与血液中的高嘌呤成分浓度高相关。该研究的亮点在于实验设计，高糖喂养果蝇后进行水份补充，发现死亡率降低但肥胖等代谢紊乱症不受影响，因此成功将高糖饮食造成的高死亡率和肥胖等代谢紊乱症分离，保证了实验结论的准确性。

高糖饮食嘌呤代谢 aging high-sugar diet Obesity

低丰度物种

PLoS CB：成功分析菌群中低丰度物种互作的新方法！

绝大多数的菌群研究关心高丰度物种，而事实上，低丰度物种不仅种类繁多，数量也不可小觑，对低丰度物种互作的分析，非常必要。新的运作方法，一定程度解决了低丰度物种分析的问题。特别推荐！

低丰度物种布尔运算

Nature子刊：低温诱导胆固醇转为胆汁酸，改变菌群并促进产热

这是最近一项非常重要的研究，强烈推荐认真阅读。

低温适应性产热胆汁酸胆固醇 Dyslipidaemias

BACTERIAL INTERACTIONS

Gut：IBD患者的粘膜菌群、转录组及RNA剪接的关联被破坏

粘膜菌群、宿主基因表达调节及宿主粘膜转录组剪接，这三者间存在着紧密的疾病相关的关联，而与健康人相比，IBD患者的这种关联被破坏。近期发表在Gut的这篇文章值得一读。

BACTERIAL INTERACTIONS CROHN'S DISEASE GENE EXPRESSION INFLAMMATORY BOWEL DISEASE INTESTINAL GENE REGULATION