Aitor Blanco-Miguez

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Aitor Blanco-Miguez

文章数：7篇

Cell子刊：解析Segatella copri菌遗传多样性

Segatella copri菌（原名普雷沃氏菌）复合体 (ScC) 是人类肠道菌群的关键成员之一，目前其遗传多样性尚不清楚，严重限制对其在肠道菌群中的作用机制研究。近日，发表在Cell Host and Microbe上的这篇文章，通过大规模宏基因组分析并结合靶向分离以解决ScC内多样性问题，本研究揭示ScC内的基因组多样性，有助于更好地表征人类菌群。

Cell 子刊：新方法挖掘饮食相关肠道菌群变化

小鼠是研究菌群-机体互作的关键模型。但是，传统的基因枪法对肠道菌群的鉴定有限。本文提出一种宏基因组分析方法metaphan 4，利用小鼠的22718个宏基因组组装的基因组，改进小鼠肠道菌群分析，并基于8个公共数据集数据进行验证。研究结果显示，metaphan 4可以更好的挖掘小鼠饮食相关肠道菌群。

肠道菌群宏基因组

Nature子刊：MetaPhlAn再度更新，这次有何新特征？

MetaPhlAn是针对宏基因组数据进行微生物分类分析最常用的工具之一，近年来也逐渐更新扩展到第三版。近日，意大利特伦托大学研究人员在Nature Biotechnology发表最新研究释放了MetaPhlAn4版本，MetaPhlAn4整合了来自分离株和宏基因组组装的基因组的信息，可以在SGBs水平对物种进行鉴定和丰度定量，此外，MetaPhlAn4在分析灵敏度、特异性、微生物多样性以及未知物种与疾病和饮食标记物相关性等方面都进行了显著扩展，值得相关人员进一步测试。

MetaPhlAn 宏基因组研究论文基础研究微生物物种

晚期黑色素瘤

Nature子刊：肠道菌群与免疫检查点抑制剂的临床反应相关

肠道微生物组的组成与免疫检查点抑制剂（ICI）治疗的临床反应有关，但是与ICI临床益处相关的特定微生物组特征还缺乏认知。Nature Medicine近期发表的文章，通过对晚期黑色素瘤患者接受ICI治疗前的粪便样本进行测序分析，同时整合之前发表的数据集，发现肠道微生物组的组成与ICI的临床反应具有相关性，但是呈现队列之间的差异性，没有一个物种在所有队列中是完全一致的。

晚期黑色素瘤肠道菌群人群队列数据

约2700年前欧洲小镇已食用奶酪和啤酒

哈尔施塔特镇（Hallstatt）是奥地利的一个古镇，“Hall”可能源自于古克尔特语的“盐”，得名于村庄附近的盐矿，这里又被称作“世界上最美的小镇”或“世界最古老的盐都”，“著名爱情打卡地”。近期发表于Current Biology的一项研究表明哈尔施塔特矿工在铁器时代已食用蓝纹奶酪和啤酒，并在巴洛克时期之前保留了类似现代非西式饮食人群的肠道微生物群特征。

挖掘人肠道中的Akk菌多样性

嗜粘蛋白阿克曼菌（Akkermansia muciniphila）在调节肠道和宿主健康中有重要作用，但人们对这种细菌及其近缘种的基因组多样性仍所知有限。Genome Biology近期发表研究，通过对人源的阿克曼菌属（Akk菌）的分离菌基因组和宏基因组组装基因组进行大规模分析，揭示了Akk菌的系统发育和功能多样性，为未来进一步研究Akk菌的功能机制和转化应用打下基础。

AKK菌

粪菌移植有效缓解TKI治疗引起的腹泻

口服酪氨酸激酶抑制剂（TKI）可显著改善转移性肾细胞癌（mRCC），但TKI治疗引起的腹泻会影响药物疗效和患者恢复。Nature Communications上发表的一项随机双盲对照试验，在20名接受TKI治疗的mRCC患者中发现，来自健康供体的粪菌移植可有效缓解患者的腹泻。

粪菌移植酪氨酸激酶抑制剂（TKI）转移性肾细胞癌腹泻研究论文