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Qi Su
文章数:9篇
微生态干预
黄秀娟团队Lancet子刊:SIM01合生制剂可改善长新冠
全球约有6500万人受长新冠(PACS,COVID-19急性期后综合征)影响,但目前缺乏有效治疗方案。The Lancet Infectious Diseases最新发表了香港中文大学黄秀娟、陈家亮与团队开展的一项临床试验研究,表明合生制剂SIM01(3个菌株(分别属于青春双歧杆菌、两歧双歧杆菌、长双歧杆菌)+3种益生元(低聚半乳糖、低聚木糖和抗性糊精))(10^10 CFU,每天2次)在减轻多种PACS症状上显著优于安慰剂,伴随肠道菌群有益变化。这一发现为通过调节肠道菌群来治疗PACS提供了新思路,未来可进一步测试将SIM01推广用于其他慢性疾病或感染后症状的治疗。
微生态干预
合生制剂
长新冠
随机双盲安慰剂对照试验
肠道菌群
肠易激综合征
港中大:肠易激综合征不同亚型的肠道微生物组特征
这是发表在Gut microbes上的一份工作,由香港中文大学的Siew C Ng及其团队完成。作者纳入了942名三种不同IBS亚型的患者,从5488名的健康志愿者中按照年龄、BMI、性别、地理位置、饮食等因素筛选出与不同患者1:1配对的健康对照。通过16S扩增子测序,作者分析比较了不同IBS亚型间的微生物组特征,与健康对照相比,IBS-D(腹泻)和IBS-U(未分类)患者多样性降低,IBS-D患者丰富度也降低。在门和属水平,三者都表现出明显的结构变化,其中IBS-D和IBS-U门水平变化类似。在菌群功能变化方面,三组共计有6中功能途径发生显著变化,其中IBS-D 为 2 种,IBS-U 为 4 种,IBS-C(便秘) 为 3 种。IBS-D中硫化氢生成途径增加,IBS-C中棕榈油酸酯生物合成途径增加。在IBS抑郁症患者中,表现出独立于亚型的双歧杆菌、萨特氏菌等有益菌丰度降低和变形杆菌的丰度增加。同时,性别、年龄以及饮食对微生物组结构功能变化表现出不同影响。
肠易激综合征
肠道菌群
肠道噬菌体
黄秀娟团队:噬菌体在粪菌移植中的作用(综述)
香港中文大学的黄秀娟团队在Clinical Microbiology and Infection上发表的一篇综述文章,详细介绍了艰难梭菌感染、溃疡性结肠炎、移植物抗宿主病(GVHD)患者接受粪菌移植后的肠道噬菌体变化,并概述了粪便病毒移植在临床前研究中对肥胖、2型糖尿病、坏死性小肠结肠炎等多种疾病的治疗或预防作用。
肠道噬菌体
综述
疾病诊断
港中大Nature子刊:基于粪便微生物组的机器学习可用于多类疾病诊断
肠道菌群不平衡会导致各种人类疾病,随着测序技术和机器学习发展,研究人员基于肠道菌群常使用二元分类模型去预测疾病,但大多数疾病/健康表型存在重叠的肠道菌群特征,因此单一疾病的诊断模型很可能会被不相关的疾病混淆,可能导致错误的分类。近日,香港中文大学黄秀娟(Siew C Ng)与团队在Nature Communications发表最新研究,纳入涵盖大肠癌、大肠腺瘤、克罗恩病、溃疡性结肠炎、肠易激综合征、肥胖、心血管疾病、急性COVID-19后综合征和健康人等9种不同疾病/健康表型,利用5种多类分类器去预测不同的疾病,发现RF模型性能明显优于其他,进一步使用来自亚洲、欧洲和北美12个公共数据集的1597个粪便宏基因组数据验证了RF模型的良好性能,选取贡献度前50的物种关联分析发现,相比健康人,几乎所有疾病状态与厚壁菌门或放线菌门丰度下降、拟杆菌门丰度增加有关。总之,该研究表明基于粪便微生物组的多类模型用于疾病诊断是可行的,值得相关人员学习和参考。
疾病诊断
肠道菌群
机器学习
新冠
国内团队Nature子刊:新冠预后工具——宿主表型+多界微生物群
Nature Communications近期发表来自香港中文大学黄秀娟团队的文章,对新冠肺炎患者的粪便宏基因组、粪便代谢组学、1呼吸道样本的病毒载量及临床特征进行综合分析,基于宏基因组进行聚类得到两大类,结合宿主的表型可准确预测呼吸道病毒脱落的持续时间,即宿主表型和多界微生物谱或预测新冠肺炎患者的预后。
新冠
细菌
真菌
病毒
预后
新冠
国内团队Nature Reviews:新冠与肠道菌群(综述+一图读懂)
香港中文大学的黄秀娟团队在Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology上发表的一篇观点型综述,详细介绍了新冠病毒感染导致的肠道菌群变化,并讨论了新冠病毒诱导肠道菌群失调以及肠道菌群失调影响新冠病毒感染严重程度的潜在机制,同时探讨了新冠病毒流行前、流行期间及流行后的肠道菌群变化,以及新冠病毒防控措施对肠道菌群的影响,最后展望了靶向干预菌群以改善新冠肺炎患者结局的可能。
新冠
综述
肠道菌群
抗生素耐药基因
香港中文大学:抗生素和益生菌对新冠患者耐药基因有何影响?
目前,相关研究对新冠患者肠道菌群失调的描述较多,但对新冠患者使用抗生素后,耐药基因如何动态变化仍十分有限。近日,香港中文大学Siew C Ng及团队在Gut Microbes发表最新研究,系统的探究了患者从确诊到病毒清除后6个月的抗生素耐药基因(ARGs)的动态变化,发现首次使用抗生素会改变新冠患者的ARGs丰度及类型,且清除病毒后持续至少6个月。而口服含益生元的益生菌SIM01可在急性感染和恢复期间显著减少ARGs负荷。总之,该研究对于未来基于微生物疗法有效清除新冠患者体内ARGs数量提供了指导,值得关注。
抗生素耐药基因
新冠肺炎
研究论文
基础研究
益生菌
新冠肺炎后遗症
港中大:新冠后遗症中存在持续的肠道菌群失调
香港中文大学的黄秀娟团队在Gut上发表的一项前瞻性队列研究结果,对155名新冠肺炎患者进行平均超过1年的随访后发现,在新冠病毒清除后,新冠肺炎后遗症及相关的肠道菌群失调可持续存在。
新冠肺炎后遗症
研究论文
前瞻性队列研究
新冠
黄秀娟团队:肠道菌群与新冠长期后遗症的关系
新冠的长期后遗症很常见,目前尚不清楚其背后的原因。香港中文大学黄秀娟团队在Gut发表最新研究,研究了肠道菌群组成与急性期后COVID-19综合征(PACS,即新冠病毒转阴后4周时仍有至少一种持续症状)的关系,表明患者的肠道菌群组成可能影响对PACS的易感性,或能预测新冠后遗症的风险。调节肠道菌群能否帮助改善患者的后遗症,值得进一步探索。
新冠
肠道菌群