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生物合成
文章数:11篇
肠菌代谢物
Nature子刊:肠肽是含有N-甲基甲鸟氨酸的替代肽
随着测序技术及生物信息学的快速发展,已经成为研究人员识别肠菌天然产物的两把利刃。近日,美国普林斯顿大学研究人员在Nature Chemistry发表最新研究,借助生信手段搜索在被忽视的链球菌中鉴定出约600个基因簇,这些基因簇编码由自由基S-腺苷蛋氨酸酶合成的核糖体肽天然产物,还识别出肠肽的一个新化学类型,建议命名4型塞克肽类,并探究肠肽相关的抑菌活性。总之,该研究为未来进一步探究肠菌相关天然产物提供了新的思路。
肠菌代谢物
肠肽
研究论文
基础研究
细菌天然产物
动物菌群
毛胜勇+刘军花:全面分析反刍动物胃肠道菌群的维生素B和K2生物合成
在畜牧养殖中,向日粮中添加维生素有助于改善动物健康,但增加成本。很多胃肠道微生物具有合成维生素的能力,如能善加利用可帮助减少过多的维生素补充,从而降低养殖成本。南京农业大学的毛胜勇、刘军花与团队在Microbiome发表最新研究,全面分析了参与反刍动物维生素B族和K2生物合成的胃肠道微生物基因和基因组,揭示了维生素生物合成在胃肠道中的分布特点和饮食的影响,并特别分析了菌群的钴胺(维生素B12)生物合成。这些发现有望为增强反刍动物胃肠道微生物的维生素B族和K2生物合成,提供新的解决方案。
动物菌群
反刍动物胃肠道菌群
维生素B
维生素K2
生物合成
D-阿洛酮糖
江南大学:D-阿洛酮糖的生物合成
江南大学沐万孟团队研究成果。D-阿洛酮糖已被美国FDA批准为GRAS食品,其具有甜度高、热量低和多种生理功能的特点,有望成为蔗糖替代品。但是,天然D-阿洛酮糖十分稀少,需要生物或者化学方法合成,主要是KEase法。本文主要综述了D-阿洛酮糖生化特点、生理功能、应用以及其生化合成途径;针对其KEase合成法,进一步探讨了其主要的局限和可能的解决方法,展望了未来的发展和应用。
D-阿洛酮糖
代糖
生物合成
lantibiotics
王欢+司同:新型肽酶参与羊毛硫肽抗生素的生物合成
羊毛硫肽化合物(Lantibiotics)是由核糖体合成并经过翻译后修饰得到的一大类肽类天然产物。这类化合物广泛的产生于不同种类的细菌,具有丰富的结构和生物活性多样性,为活性药物研究和开发提供重要的来源。南京大学的王欢课题组和中国科学院深圳先进技术研究院的司同课题组合作在Angewandte Chemie International Edition上发表的一项研究,在模式动物大鼠肠道菌中发现了一类新颖的窄谱羊毛硫肽抗生素amylopeptins,解析了基因簇内S8家族丝氨酸肽酶AmyP如何参与前导肽移除和抗生素活性的激活。本工作首次报道了具有特异性识别位点的肽酶可以参与III型羊毛硫肽生物合成过程,为天然产物研究领域提供了重要借鉴意义。
lantibiotics
生物合成
蛋白酶
结直肠癌
Cell子刊:重新定义大肠癌干细胞层次结构
结直肠癌(CRC)由不同基因型和表型的细胞组成。最新发表在Cell Stem Cell的研究揭示了CRC中绝大多数rRNA和蛋白质合成发生在一群与基质相邻的特定癌细胞中。该体系结构定义了一个通用的干细胞层次结构。此外,在一些CRC中,有生物合成能力的肿瘤细胞使得LGR5+肿瘤细胞对肿瘤生长的重要性明显下降。
结直肠癌
生物合成
细胞分化
POLR1A
Lgr5
吲哚类物质
Cell子刊:细菌产生的“吲哚因子”,介导跨界防御应答
人体肠道细菌可产生的上万种小分子物质,虽然某些物质可影响肠道菌群组成和功能并调节宿主免疫,但大多数都是功能未知的。发表在《Cell Chemical Biology》上的文章对特定吲哚类物质(indolokine,“吲哚因子”)的功能进行了深入研究,发现该类物质广泛存在于不同细菌和小鼠粪便中,并可促进细菌耐药细胞形成、激活植物防御反应及人免疫反应。该研究将细胞应激诱导的代谢产物与细菌、植物和人类的防御反应联系起来,表明生物界存在着相对保守的防御策略。
吲哚类物质
stress response
indole
SIGNALING
E. coli
细菌天然产物
Nature Reviews:细菌——活性天然产物的生物工厂(综述)
细菌是活性天然产物的重要来源。细菌通过多样化的生物合成途径,产生多种多样的初级和次级代谢产物,这些代谢产物不仅对细菌的生存至关重要,同时也是人类的资源宝库。《Nature Reviews Chemistry》近期发表的长篇综述,详细介绍了细菌作为“生物工厂”在不同领域的应用,讨论了多样化的细菌次级代谢产物及其生物合成途径,论述了用细菌靶向基因工程技术生产生物活性化合物的最新进展。
细菌天然产物
次级代谢物
生物合成
基因工程
工程菌
胃癌
胃癌切除后,肠道菌群和代谢组发生了哪些变化?
研究表明,肠道微生物群可影响手术后的结果(包括胃切除术)。最新发表在Gut上的文章研究了胃癌患者胃切除术对肠道微生物组和代谢组的影响,以及它与胃切除后情况的关系。该研究对有胃癌切除史的参与者(n=50)粪便样本进行猎枪宏基因组测序和毛细管电泳飞行时间质谱代谢组学分析,并与对照组(n=56)进行比较。胃切除术后,在患者粪便标本中发现微生物群落结构变化。此外,术后患者微生物功能特征及体内代谢物均发生变化。
胃癌
微生物组
代谢组
需氧菌
兼性厌氧菌
工程菌
将大肠杆菌改造为天然产物的合成工厂(综述)
工程菌可用于天然产物的大规模生产,《Trends in Biotechnology》发表的这篇综述文章详细介绍了改造大肠杆菌以产生特点天然产物的代谢工程策略、代表性例子以及前景和挑战。
工程菌
天然产物
E. coli
systems metabolic engineering
natural products
菌群互作
利用菌群互作来激活微生物的“沉默基因”
微生物的次级代谢产物可能成为新的药物来源。《Current Opinion in Pharmacology》近期发表文章,阐释了编码次级代谢产物的生物合成基因如何依靠菌群互作来进行顺利表达,并指出可利用营养匮乏、微生物间竞争等方式来促进目标代谢产物的表达,对于开发新药物,尤其是抗生素药物具有参考价值。
菌群互作
生物合成
观点评论
药物研发
Helmut Grasberger
花青素
花青素或可有助于减肥!
① 本文综述了花青素的减肥活性的相关分子机制,花青素的物理化学和生理特性,花青素在肥胖治疗方法的适用性以及在未来的应用微生物生物合成的可能性。② 花青素显示减肥通过多种机制,其生物合成有广泛应用:抑制脂质吸收,调节脂质代谢,增加能量消耗,抑制食物摄取和调节肠道微生物群等。③ 花青素在减肥药物开发上具有很大的潜力,微生物中花色苷生物合成是大规模生产的希望。
花青素
减肥
分子机制
脂质代谢
肠道菌群