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Robert R Jenq
文章数:16篇
癌症免疫疗法
Nature子刊:揭开肠道菌群与CAR-T免疫治疗效果间的神秘关系
越来越多的证据表明,肠道菌群可以调节癌症免疫疗法的疗效。嵌合抗原受体(CAR)-T细胞疗法作为一种前沿免疫疗法,为难治性和复发性B细胞白血病或淋巴瘤患者提供了新的治疗选择,但最多只有40%的患者能获得完全和长期缓解,疗效的异质性阻碍了该疗法的临床应用。Nature Medicine最新发表了由Eran Elinav团队领衔的多团队合作研究,对德国和美国的5个中心的B细胞淋巴瘤患者队列进行了前瞻性分析,为肠道菌群对CAR-T疗法效果的潜在调节作用提供了新证据。该研究表明,在开始CAR-T治疗前,患者的基线肠道菌群特征可以预测之后对治疗的应答情况,但前提是这些患者没有预先使用广谱抗生素,因为这会破坏菌群与治疗反应间的关联。总之,这些发现对开发基于肠道菌群的CAR-T疗效预测方法具有重要参考价值。
癌症免疫疗法
CAR-T细胞治疗
肠道菌群
预后预测
中性粒细胞减少性发热
Science子刊:肠道菌群与细胞毒性癌症治疗后的发热相关!
并非所有癌症和严重中性粒细胞减少症患者都会发烧,粪便微生物组可能会在其中发挥作用。Science Translational Medicine近期发表的文章,发现发烧患者的粪便菌群中,Akkermansia muciniphila的相对丰度增加。使用靶向抗生素或丙酸盐(丙酸盐体外培养Akk,可降低Akk对粘蛋白和盐藻糖的利用率)治疗,可保护粘液层,减少结肠的炎性细胞因子,改善体温调节。研究显示,饮食、代谢产物和结肠粘液将微生物组与中性粒细胞减少联系起来,或可指导未来基于微生物组的预防策略。
中性粒细胞减少性发热
肠道菌群
丙酸盐
结肠黏液层
移植物抗宿主病
Cell:特定抗生素让拟杆菌破坏黏液层,促移植物抗宿主病
异体造血干细胞移植(allo-HSCT)后发生的移植物抗宿主病(GVHD)与肠道菌群存在密切关系,广谱抗生素如碳青霉烯类药物会增加肠道GVHD的风险,但其机制尚不清晰。Cell最新发表了德州大学安德森癌症中心Robert Jenq团队的研究,在allo-HSCT小鼠模型中发现,allo-HSCT患者常用的美罗培南(碳青霉烯类药物)能改变肠道菌群组成,引起肠道环境变化(如木糖减少),这使得菌群中的多形拟杆菌转向降解黏液层、破坏肠屏障,从而加剧GVHD。这些发现表明,特定的营养补充(如木糖)或能用于改善抗生素相关GVHD。
移植物抗宿主病
肠屏障
肠道菌群
肠道黏液层
多形拟杆菌
胰腺癌
Cell子刊:胰腺癌细胞逃避免疫监视的又一利器——Col1同源三聚体
Cancer Cell近期发表的文章,发现胰腺癌细胞可产生异常的I型胶原蛋白的同源三聚体,具有促癌特性。癌细胞中删除Col1同源三聚体可抑制肿瘤进展,重塑肿瘤微生物组,增加T细胞浸润,增强anti-PD-1的治疗效果。
胰腺癌
胶原蛋白
肿瘤微生物组
肿瘤免疫
肿瘤微环境
人乳寡糖(HMO)
Cell子刊:巧用HMO+婴儿双歧杆菌组成的合生制剂,促进婴儿双歧杆菌在成人肠道定殖
将活的生物治疗产品可控制和可持续地移植到人类肠道微生物组中,能调节人类肠道微生物组。Cell Host and Microbe近期发表的文章,利用婴儿双歧杆菌和母乳寡糖(HMO)组成的合生制剂,在不使用抗生素的前提下,能成功地使婴儿双歧杆菌在成人肠道中定植。另外,利用同样的方法,在接受了失调人类微生物群小鼠中实现了更高的定植水平,促进了丁酸盐产生。本研究结果提示,益生菌+益生元组成的合生制剂,或可用于改善人肠道菌群失调。
人乳寡糖(HMO)
婴儿双歧杆菌
成人肠道菌群
丁酸
肠杆菌科
无监督聚类
评测菌群数据无监督聚类方法的性能决定因素
本文系统地比较了菌群分析中常用的 β 多样性和聚类方法。作者将这些应用于四个已发布的数据集,其中可以在样本组之间看到高度不同的微生物组,以及在组之间分离不太清晰的临床数据集。作者表示没有现有的聚类方法可以在所有数据集中普遍表现最佳,并提出了 BC(Bray Curtis) 和 UU (unweighted UniFrac) 的组合指标,利用了这两个指标的互补优势。
无监督聚类
Bray Curtis距离
非加权 UniFrac 距离
β多样性
急性肠道移植物抗宿主病
国内团队:揭示肠道移植物抗宿主病的发病机制
类固醇耐药性急性肠道移植物抗宿主病(SR-Gut-aGVHD)的发病机制尚未明确。福建医科大学附属协和医院的陈元仲团队与国外研究者合作在Nature Communications上发表的一项最新研究,发现IFN-γ+ Th/Tc1细胞的缺失及IL-22+ Th/Tc22细胞的扩增在SR-Gut-aGVHD的发病机制中起到关键作用:IL-22可诱导肠道菌群失调及易位,而IFN-γ的缺失则促进了CX3CR1高表达单核吞噬细胞(在aGVHD中具有保护性作用)的耗竭。该研究结果提示,IL-22拮抗剂及IFN-γ激动剂或可用于治疗SR-Gut-aGVHD。
急性肠道移植物抗宿主病
研究论文
基础研究
啮齿动物(小鼠)
自体造血干细胞移植
肠道菌群多样性或影响自体造血干细胞移植的临床结果
异基因造血干细胞移植(allo-HCT)治疗导致患者粪便微生物多样性减少。而接受大剂量化疗和自体造血干细胞移植(auto-HCT)的患者也出现同样的抗生素治疗和营养改变,其肠道菌群是否发生变化?Blood近期发表的一项临床试验结果表明,病人在接受auto-HCT移植前其粪便菌群多样性就低于健康对照,且移植后进一步减少。同时,移植期粪便菌群多样性低与较差的整体生存期或无疾病进展期有关。
自体造血干细胞移植
粪便菌群
多样性
菌群-免疫互作
Nature子刊:IL-22帮助肠道菌群抑制艰难梭菌感染
肠道菌群了介导对艰难梭菌的定殖抗性以抑制艰难梭菌感染,但宿主免疫在其中的影响尚未明确。Nature Medicine上发表的一项最新研究发现,肠道菌群定殖可诱导IL-22的产生,IL-22可增强宿主黏液的糖基化修饰,从而促进考拉杆菌属的生长,而考拉杆菌属物种可与艰难梭菌争夺琥珀酸盐以抑制后者的定殖。
菌群-免疫互作
艰难梭菌感染
糖基化
IL-22
菌群-免疫互作
allo HCT
调控肠道菌群或可优化异基因造血干细胞移植的疗效(综述)
微生物可调节多种疾病,影响预后、治疗反应和并发症等。异体造血细胞移植是癌症治疗的重要方式,目前有大量研究报道了这种治疗方式与微生物组之间的互作关系。Annual Review of Medicine上发表的一篇综述系统地回顾了这方面的研究,并阐述了目前正在研究的调控微生物群的策略,包括抗生素的适当选择和时间,饮食方式和给药途径,添加益生菌和益生元以及粪菌移植等,或为优化患者的治疗方式提供新方法。
allo HCT
GvHD
TRM
造血干细胞移植
移植物抗宿主病
感染
肠道菌群特征或能预测白血病化疗感染风险
Clinical Infectious Diseases上发表的一项最新研究,在近100名接受新辅助化疗的急性髓系白血病患者中发现,肠道菌群的多样性及组成与治疗期间的感染风险相关。
感染
Microbiome
Acute Myeloid Leukemia
carbapenem
Shannon Diversity
菌群差异分析
分析成对、纵向样本菌群差异性的R语言程序包
人类肠道内的微生物环境对于人的健康具有重要的影响。《Bioinformatics》近期发表的文章介绍了一种基于UniFrac距离的差异性评估的新方法,可分析成对样品、同一个体不同时间段样品中的菌群差异,有助于减小宿主个体差异对菌群相关研究的影响。
菌群差异分析
方法学
Ping Lan
Jingrong Weng
Yichen Li
粪菌移植
Nature子刊:免疫检查点抑制剂相关结肠炎可用粪菌移植治疗
用于癌症治疗的免疫检查点抑制剂(ICI)可引起结肠炎等不良反应,重者可致命,有研究指出其发病与肠道菌群的改变有关。Nature Medicine发表了由德克萨斯大学MD安德森癌症中心的华人学者Yinghong Wang主导的最新研究,报道了用粪菌移植(FMT)成功治疗难治性ICI相关结肠炎的案例,提示调节肠道菌群的干预方法可用于改善ICI相关结肠炎,有望造福患者。
粪菌移植
免疫检查点抑制剂相关结肠炎
Y Lin
L Cheng
M Jiang
自体粪菌移植
Science子刊:自体粪菌移植,重建患者被抗生素摧残的肠道菌群
Cell本月发表的一项重磅研究中(http://www.mr-gut.cn/papers/read/1041252324),自体粪菌移植可迅速恢复使用抗生素后的健康人的肠道菌群多样性。Science Translational Medicine刚刚上线的一项临床研究表明,在接受造血干细胞移植的患者中,自体粪菌移植可作为干预手段,用于恢复被常规抗生素治疗所破坏的肠道菌群。该研究仍在追踪患者的恢复情况,以判断自体FMT是否能减少因丧失菌群多样性而导致的不良临床结局。
自体粪菌移植
异基因造血干细胞移植
随机对照临床试验
抗生素
肠道菌群
骨髓移植
Cell子刊:肠道菌群如何影响骨髓移植预后?
骨髓移植(BMT)是治疗恶性血液病的有效手段,然而患者术后通常会经历免疫缺陷和营养问题,影响BMT预后。Cell Host and Microbe[IF:14.946]本周上线的一项研究表明,肠道菌群增加饮食能量吸收,有助于BMT后重建造血和免疫功能。有兴趣的读者不妨搭配Nature Reviews发表的综述(http://www.xunludkp.com/papers/read/1095674431)共同阅读。
骨髓移植
营养吸收
炎症疾病
FI:菌群在炎症疾病中的临床证据(综述)
一篇重要综述,推荐。
炎症疾病
临床证据
Microbiome
Inflammation
bacteria