Meng Zhang

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文章数：6篇

刘洋彧等Nature子刊：限制性内切酶或可助力解决宏基因组假阳性鉴定问题

尽管现有的宏基因组分析器前景看好，它们也存在一些局限性。目前多数宏基因组分析器面临的主要瓶颈是它们依赖于通用的单拷贝标记或整个微生物基因组作为参考，因此受限于构建参考数据库时的标记缺失，抑或保守区域的多重比对问题。近日，哈佛大学医学院刘洋彧及团队在Nature Communications发表最新研究，利用物种特异性IIB型限制性内切酶酶切位点作参考，不采用通用标记或整个微生物基因组，构建基于IIB型限制性内切位点的宏基因组分析器MAP2B，MAP2B可以有效的消除微生物组数据鉴定时存在的假阳性，并生成更高精度、更准确的物种分类结果，值得关注。

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张和平团队Nature子刊：腺嘌呤甲基化在副干酪乳酪杆菌生理学中有何作用？

多项研究已经报道，在细菌中DNA甲基化是一种普遍的表观遗传机制，其中6-甲基腺嘌呤（6mA）是最普遍的一种，在调节基因表达和形成致病菌的宿主细胞方面起作用，但其在副干酪乳酪杆菌中的生理功能却鲜为人知。近日，内蒙古农业大学张和平及团队在Nature Communications发表最新研究，通过多组学和高通量染色体构象捕获（Hi-C）技术，揭示了副干酪乳酪杆菌表观遗传修饰的分子和功能作用，极大地促进了益生菌领域的最新前沿研究，值得关注。

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张和平+张文羿：鼠李糖乳杆菌Probio-M9对肠道菌群和免疫的影响

益生菌在全球市场正在爆炸性增长，但目前关于食用益生菌是否对非患者有益仍存在争议。近日，内蒙古农业大学张和平团队联合张文羿团队在Microbiology spectrum上发表文章，发现鼠李糖乳杆菌Probio-M9可以收紧免疫与肠道菌群间的联系，并稳定肠道菌群的遗传变异。本研究揭示益生菌消费的影响被严重低估，为全面了解和评估益生菌的疗效提供了新的视角。

孙志宏等：“远洋综合征”与肠道菌群相关

慢性疾病是当今重要的健康问题，其与肠道菌群失调的关联已被广泛报道和研究，但亚健康状态与肠道菌群之间的关系仍待阐释。Microbiology spectrum近期发表了内蒙古农业大学孙志宏与团队的研究，评估了长期远洋航行的船员的健康状态，表明远洋航行可能引发不同船员群体的不同症状，但存在一组高发的核心症状，将这种亚健康状态命名为“远洋综合征”。该研究进一步揭示了远洋综合征与肠道菌群的关系，并鉴定出能预测其发生的菌群标志物。这项研究为极端环境下的健康管理提供了潜在策略，对于预测菌群失调相关疾病具有参考价值。

航海亚健康肠道菌群预测模型

国内团队：干酪乳杆菌Zhang或能减少抗生素引起的菌群失调

内蒙古农业大学张文羿团队，近期在Computational and Structural Biotechnology Journal发表研究，表明抗生素治疗不仅导致宿主肠道菌群失调，还导致炎症反应和肠道菌群中抗生素耐药基因增加。而每日补充干酪乳杆菌Zhang可以缓解抗生素干预的这些不良副作用，并促进肠道菌群稳态的恢复，这些益生菌作用可能与戈氏副拟杆菌介导的有益作用有关。

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宏基因组学

Nature子刊：刘洋彧、Rob Knight等评测不同宏基因组物种定量方法及其对结果的影响

本文通过严谨的论证分析，量化了宏基因组学物种分类工具所产生的两种相对丰度类型的差别，对于混淆两种丰度所产生的影响进行了全面系统地研究。作者通过数据模拟，对宏基因组物种分类工具的输出结果进行了深度解读，提出了基于不同丰度类型的双层评价标准，为解决微生物组研究中如何选择宏基因组学物种分类工具的问题提供了重要依据，也对微生物组标准化研究提出了一系列建设性的意见。作者呼吁整个菌群研究界应更多地关注由于忽视序列丰度和物种丰度之间的区别而引起的潜在误导性生物学结论。本文第一作者是哈佛大学医学院的孙政博士和加州大学圣地亚哥分校的黄适博士，Rob Knight教授和刘洋彧教授为本文的通讯作者。

宏基因组学序列丰度物种丰度物种分类工具 DNA-to-DNA