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Shenghui Li
文章数:3篇
终末期肾病
国内团队:终末期肾病患者肠道菌群有何特征?
在终末期肾病(ESRD)患者中,肠道微生物群在调节宿主代谢和产生尿毒症毒素中起着至关重要的作用。近日,复旦大学丁小强、中国农业大学赵亮、伦敦大学学院皇后广场神经病学研究所Stanislav Dusko Ehrlich及团队在Genome Biology发表最新研究,通过宏基因组测序探究了ESRD患者肠道菌群组成,表征了ESRD微生物组的分类和功能景观以及生物标志物。还证明识别的特征物种在预测不同队列的血清尿毒症毒素浓度方面有效性良好,值得关注。
终末期肾病
肠道菌群
研究论文
基础研究
抗生素耐药
肠道病毒组
马骁驰+鄢秋龙等:用肠道病毒组诊断大肠癌和腺瘤,潜力如何?(荟萃分析)
先前研究发现病毒是肿瘤发生的诱导剂,但很少有研究探讨肠道病毒组对结直肠癌进展的影响,并且在不同队列中病毒特征的可重复性较差。近日,大连医科大学的马骁驰、鄢秋龙及团队在Journal of Advanced Research发表最新研究,纳入9项已发表的结直肠癌和腺瘤研究(含1282个粪便宏基因组)用于组装病毒基因组,基于患者和健康人肠道内识别的差异噬菌体构建随机森林模型,发现可以较好地区分结直肠癌/腺瘤与健康人。总之,该研究证实了结直肠癌和腺瘤患者的肠道病毒群特征,并强调了结肠直肠癌进展中肠道噬菌体-细菌的协同作用,为未来结直肠癌治疗的提供了新靶点。
肠道病毒组
预测性能
荟萃分析
基础研究
结直肠癌
宏病毒组
马郁芳+马骁驰:肠道宏病毒组扩增和测序方法的优化及评价
由于生物量较低,宏病毒组测序中难免需要多次PCR扩增以获取足量的DNA,可能导致病毒基因组的测序覆盖分布不均匀,对基因组组装产生影响。大连医科大学马郁芳和马骁驰团队在Journal of Advanced Research发表了最新研究,建立了一种优化的、可重复的宏病毒组扩增和测序工作流程,并结合二三代混合测序策略,有效提升了宏病毒组的组装性能,为未来在基因组水平研究复杂的肠道病毒群落提供了有效的方法支撑。
宏病毒组
噬菌体
方法学
测序
纳米孔测序