BingQiang Liu

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BingQiang Liu

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山东大学：一文读懂瘤内微生物组数据的计算方法和挑战（综述）

人类微生物组与癌症生物学密切相关，在癌症治疗效果方面发挥着重要作用。随着不断深入的微生物研究，发现人类微生物能够通过与宿主免疫系统的相互作用在癌症诊断、发病机制和治疗中发挥广泛的作用。近日，美国俄亥俄州立大学马勤、山东大学刘丙强及团队在Trends in Microbiology发表最新综述，重点关注了研究肿瘤内微生物组的数据和计算方法，详细介绍了通过分析宿主bulk、单细胞和空间测序数据中的微生物组数据来挖掘生物学发现的计算方法及挑战，并对免疫肿瘤微生物组（IOM）研究方法的发展前景进行了展望，值得精读。

瘤内菌群互作综述基础研究免疫-肿瘤-微生物组

自闭症谱系障碍（ASD）

国内团队：基于16S菌群数据寻找自闭症标志物

自闭症谱系障碍 (ASD) 是一类神经发育障碍疾病，主要表现为不同程度的言语发育障碍、人际交往障碍、兴趣狭窄和行为方式刻板。多项研究已经发现ASD和肠道菌群密切相关，但有关患者的肠道菌群标志物的鉴定也存在较大争议。近日，山东大学刘丙强、华中科技大学熊枝繁及团队在Microbiology spectrum发表最新研究，重新分析了10项研究（含1019个样本）的16S rRNA测序数据，不同研究、测序技术及测序区段都会干扰ASD和健康对照组间的物种组成。此外，通过进一步区分不同干扰因素，基于12个菌属构建了机器学习模型用于区分ASD和对照组，预测性能较好。总之，该研究为未来利用菌群标记物预防和治疗ASD的提供了新依据。

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