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Anupriya Tripathi
文章数:9篇
遗传-菌群互作
Nature子刊:6000人数据揭示宿主遗传和饮食对肠道菌群的影响
近期,Nature Genetics背靠背发表了2篇大型单一人群队列中的肠道微生物组GWAS研究。这项基于近6000芬兰人的研究,鉴定出宿主SNP与肠道微生物分类单元之间的567个独立关联,特别鉴定出3个遗传位点——LCT(乳糖酶)、ABO(血型)和MED13L(与大肠癌有关)与特定肠道微生物丰度间的强关联性,并关注了饮食对这些关联带来的影响,最后通过孟德尔随机化和对长期健康记录的分析,探索了肠道微生物与疾病间的潜在因果关系。
遗传-菌群互作
全基因组关联分析(GWAS)
肠道菌群
三氯生
长期暴露于防腐剂三氯生,可导致毒物相关性脂肪肝(TAFLD)
三氯生(TCS)作为一种防腐剂和消毒剂,通过大量的产品消费和环境释放而与人类直接接触。已有研究发现TCS可以促进小鼠肝肿瘤的发生。然而,TCS发挥其毒性的生物学和分子机制,特别是在肝病的早期阶段仍不清楚。近期发表于PNAS的研究通过TSC处理HFD小鼠模型的研究证实TCS通过影响转录激活子4(ATF4)和过氧化物酶体增殖物激活受体ɑ(PPAR α)导致代谢调节因子FGF21失调,从而加重了高脂饮食(HFD)引起的非酒精性脂肪肝。
三氯生
脂肪肝
非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)
Nature子刊:NAFLD肝硬化患者的肠道菌群特征
Nature Communications上发表的一项最新研究,在非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)患者及其亲属中,鉴定出了NAFLD肝硬化的肠道菌群特征。
非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)
肠-肝轴
非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)
Sumaira Z Hasnain
Ran Wang
gut microbiome
面向临床医生的肠道菌群研究解读(综述)
Clinical Gastroenterology and Hepatology的这篇综述介绍了“肠道菌群”的定义和组成、临床取样方法、检测方法和数据分析方法,还提到了临床上解读数据时候可能遇到的陷阱以及解决办法,值得临床医生一读。
gut microbiome
Clinician
Study design
prognosis
Diagnosis.
阻塞性睡眠呼吸暂停
睡眠呼吸暂停可能影响肠道菌群和代谢物
来自mSystems上发表的最新研究,发现睡眠呼吸暂停引起的间歇性低氧可改变小鼠的肠道菌群组成及代谢产物,提示肠道菌群可能在睡眠呼吸暂停与心血管代谢紊乱的关联中起作用。
阻塞性睡眠呼吸暂停
Rui Chen
Shenshen Wu
菌群分析方法
一文读懂:Rob Knight手把手指导菌群研究(必读综述)
菌群研究和分析方法日新月异,本文系统性地介绍了菌群研究的实验设计、方法选择和数据分析方式,在列举和比较大量研究方法的同时,指出了目前OTU分析、菌群丰度分析和相关性分析的缺陷,强调数据共享、方法标准化的重要性。文中提及大量最新研究、分析方法和平台,指导作用强,值得专业人士参考。
菌群分析方法
多组学分析
Jordi Merino
Jordi Merino
肠-肝轴
Nature Reviews:一图读懂肝脏疾病中的肠-肝轴(必读综述)
随着肠道菌群研究的不断展开,肠-肝轴在多种肝脏疾病中的作用逐渐凸显。Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:13.678]近期发表了Rob Knight主笔的综述,详细回顾这一领域的研究进展,讨论了肝脏疾病中的分子、遗传和肠道菌群间的关系,着重探讨了菌群研究的成果,并对未来进一步揭示因果性机制的研究提出建议,非常值得关注。
肠-肝轴
酒精性肝病
非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)
肠道菌群
肝脏疾病
炎症性肠病
南方医科大学:肠道菌群用于IBD诊断和疗效预测
南方医科大学陈烨和周宏伟团队主导的最新研究,基于肠道菌群开发诊断标志物,可用于不同人种的IBD诊断,结合肠道菌群及其它指标,可用于IBD患者对英夫利昔单抗治疗应答的预测。
炎症性肠病
生物标志物
英夫利昔单抗
Disease activity
Gut microbiota
代谢组学-全菌群相关性研究
AC:用好质谱,让代谢产物与对应菌群的研究更靠谱!
这是一项利用质谱技术研究菌群代谢产物和相对应细菌之间关联的研究,关于质谱的文章我们分享得不多,这篇一定特别推荐下,建议感兴趣的人精读。
代谢组学-全菌群相关性研究
Zhengzhi Liu
Kangning Ren