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Serena Sanna
文章数:6篇
微生物组全基因组关联分析
Nature子刊:宿主遗传如何影响肠道菌群?现状、挑战和方向(观点)
宿主遗传因素可一定程度上影响肠道菌群。Nature Genetics发表的这篇观点文章,讨论了微生物全基因组关联研究(mbGWAS)的技术现状、面临的挑战,以及微生物组遗传分析的未来方向。
微生物组全基因组关联分析
遗传-菌群互作
Nature子刊:近8000人数据揭示遗传对肠道菌群的影响
宿主遗传可影响肠道菌群。近期,Nature Genetics背靠背发表了2篇基于大型单一人群队列的肠道微生物组GWAS研究。这项研究纳入了荷兰微生物组计划中的近8000名参与者,对肠道菌群宏基因组的组成(分类单元)和功能(通路)进行了全基因组关联研究(GWAS),鉴定出24个遗传位点(涉及37个SNP)与菌群分类单元和通路的关联,分析了潜在混杂因子(如用药、饮食和BMI)对这些关联的影响,用孟德尔随机化法探索了肠菌与宿主表型的因果关系,并通过功效分析强调了大样本量对于微生物组GWAS研究的重要性。有兴趣的读者可搭配阅读该团队同期发表的观点评论文章(见“延伸阅读”),讨论了微生物组GWAS的研究进展、技术现状、面临的挑战和未来的研究方向。
遗传-菌群互作
全基因组关联分析(GWAS)
肠道菌群
药物-菌群互作
Nature子刊:常用药物与肠道菌群组成和代谢功能的关联
肠道菌群可影响药物效力,反过来药物也影响肠道菌群。Nature Communications发表的一项最新研究,对荷兰3个队列的数据进行了分析,鉴定出19种常用药物与肠道菌群特征的关联,重点列举了质子泵抑制剂、二甲双胍、SSRI抗抑郁药以及非抗生素药物与菌群变化的关联。这些发现对于研究药物-菌群互作有参考意义。
药物-菌群互作
肠道宏基因组
队列研究
炎症性肠病
肠易激综合征
代谢疾病
Nature子刊:肠道菌群、短链脂肪酸和代谢疾病有因果关联
肠道菌群与2型糖尿病、肥胖等代谢异常具有相关性。Nature Genetics近期发表的一份通信研究,通过结合全基因组基因分型、肠道宏基因组和代谢产物数据,利用双向孟德尔随机化法分析,发现肠道菌群和特定代谢产物与人体代谢具有因果关系。该方法和结果对菌群-疾病相关研究具有重要参考价值。
代谢疾病
肠道菌群
肠道菌群代谢物
孟德尔随机化法
代谢疾病
心血管
傅静远等:调控心血管疾病相关蛋白的遗传-菌群互作
Nature Genetics刚刚上线来自荷兰格罗宁根大学傅静远等主导的研究,系统性分析了与92种心血管疾病相关蛋白质有关的人体遗传和菌群因素,并从中鉴定出若干重要的遗传-菌群互作。这些蛋白质中有很多都对人体健康有广泛影响,因此该研究的发现不仅揭示了心血管疾病中遗传和菌群的联合效应,对于代谢、肠道、免疫等相关疾病的研究和个性化医疗等领域也有很大参考价值。
心血管
全基因组关联研究
宏基因组关联研究
肠道菌群
遗传学
多组学
Nature子刊:整合多组学数据预测免疫疾病风险
Nature Immunology上发表的一项研究,利用20种病原体刺激534名健康志愿者的免疫细胞,分析细胞因子的产生与遗传因素、代谢组、肠道菌群、基础免疫指标的关联,发现可结合多组学数据,预测细胞因子的水平,并可进一步预测免疫疾病的风险。
多组学
细胞因子
免疫疾病