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Na L Gao
文章数:5篇
微生物基因组目录
刘庆友+陈卫华+滑国华Nature子刊:构建水牛肠道微生物基因组目录
广西大学刘庆友、华中科技大学陈卫华和华中农业大学滑国华及团队在Nature Communications上发表文章,在国际上首次提供了完整的水牛肠道微生物基因组目录。该成果为水牛肠道菌群相关研究以及分析肠道菌群对水牛粗纤维消化率、产奶性状、生长速度等经济性状的影响提供了重要的数据基础和挖掘蓝图。
微生物基因组目录
水牛肠道菌群
研究论文
粪菌移植
国内团队:“无菌小鼠+粪菌移植”研究人类疾病与菌群的因果关联可能不靠谱?
将人类的粪菌移植给无菌小鼠,常用于建立肠道菌群与表型的因果关联,但有些时候难以在小鼠中复制人类的表型。华中科技大学的陈卫华团队与复旦大学的赵兴明团队在Genomics, Proteomics and Bioinformatics上发表的一项最新研究,发现人的肠道菌群在被移植给无菌小鼠后,可能发生显著且一致的变化。因此,利用小鼠模型重现人肠道菌群相关表型仍存在较大的挑战。
粪菌移植
研究论文
基础研究
因果关联
宏基因组数据库
国内团队:人类肠道宏基因组数据库——GMrepo
华中科技大学陈卫华、复旦大学赵兴明、辽宁省人民医院赫丽杰日前联袂在《核酸研究》上发表了一个经人工矫正的人肠道宏基因组数据库。数据库整合了来自于多个公共数据库的结果,进行了一致化的处理,并添加了经核对的相关元数据。数据库收录了58903个样品,对于质控合格的样品,提供了预先计算好的物种丰度、相关性和菌株共现性网络等结果查询。数据库界面清爽,响应迅速,除了图形化查询生成器还提供了R/Python/Perl语言的API接口,方便不同背景的研究者使用。
宏基因组数据库
宏基因组学
生物信息学数据库
人肠道菌群
菌群互作
华中科技大学:解读肠道病变中的菌群互作
物种间对现有资源的竞争和合作相互作用很大程度决定了肠道菌群组成。华中科技大学的陈卫华团队近期在《Frontiers in Microbiology》发表研究,重新分析了3项肠道病变研究中的菌群代谢互作,阐释了多种新型的细菌类群互作模式,对于解读肠道病变中的菌群变化模式具有参考价值。
菌群互作
方法学
全基因组代谢网络重建
炎症性肠病
结直肠癌(CRC)
噬菌体
NAR:细菌-噬菌体互作数据库
噬菌体的相关研究越来越受到关注,这项发表在NAR上的研究,介绍了一个新的细菌-噬菌体互作数据库。
噬菌体
噬菌体-细菌相互作用