ChenQ

微生物网络微生物网络微生物生态学 Wei Li Wei Tian

收集已发表的病毒组数据集，开发了新的生物信息学工具——病毒组蛋白基因簇簇数据库，并将其用到新的研究中。虽然数据库中没能排除很多非病毒序列，但是仍然有一定的利用价值。

病毒组人病毒组基因集数据库 Simone Rampelli Simone Rampelli

Gastroenterology发表评论文章，点评了利用阳离子固醇CSA13抑制艰难梭菌感染的研究，指出了CSA13抑制艰难梭菌感染的作用方式具有多效型，在肯定了研究新颖性的同时，也指出了进一步研究的前景，如CSA13降低艰难梭菌毒素活性的具体机制等，值得专业人士关注。

新药研发艰难梭菌感染

孕期

TEM：孕期适当锻炼，利于子女代谢健康（综述）

孕期适当锻炼不仅对准妈妈有好处，对宝宝的健康也有好处。Trends in Endocrinology and Metabolism[IF：10.893]发表的这篇综述对近期的相关研究进行了总结，提出孕期锻炼可促进子女成年后的代谢功能健康，推荐关注。

孕期锻炼代谢后代健康 Sergio de Frutos

双歧杆菌

BJ：组学研究揭示双歧杆菌益生作用的机制（综述）

这是Biochemical Journal[IF：3.797]发表的系统性介绍利用各种不同的组学方法来研究双歧杆菌的各种潜在益处机制的综述，干货很多，关注益生菌特别是双歧杆菌的人必读。

双歧杆菌 BIFIDOBACTERIA Human gut microbiota probiotics Jee-Young Moon

噬菌体

FM：对裂解性噬菌体进行的全基因组测序

这是 Frontiers in Microbiology[IF：4.076]针对感染瘤胃中细菌的裂解性噬菌体的全基因组测序研究，值得专业人士特别关注。

噬菌体裂解性噬菌体全基因组测序 Shrey Kanvinde David Oupický

肺部菌群

ERJ：肠道+肺部菌群，深入影响肺病（综述）

这是关于菌群（肺部+肠道菌群）深入影响肺病的必读综述，内容详尽，图表清晰，很值得精读，强烈推荐！

肺部菌群 Lucia Mori Gennaro De Libero Mathias Schmaler

蜜蜂肠道菌群

PNAS：蜜蜂肠道菌群促进宿主体重增加

这是我们的群友作为第一作者的高水平研究，特别推荐。

蜜蜂肠道菌群代谢组学 Gut microbiota honeybee Insulin

尿路感染

PP：过路菌激活膀胱中潜伏的大肠杆菌感染

一篇很有代表性的女性阴道与尿路菌群的研究，值得读一读。

尿路感染生殖道菌群阴道加德菌 Dorothy Kim Casey E Hofstaedter

RARα

FI：肠道细菌如何促进树突细胞的炎症反应及耐受反应？

一项肠道菌群如何参与免疫细胞功能的研究，推荐阅读。

RARα 共生菌树突状细胞(DC) moDC gut commensal bacteria

类器官模型

SR：一种巨噬细胞-肠道共培养模型

新的一种肠道细胞培养模型，方法学创新，都值得看看。

类器官模型 Kathryn R Tringale Jona A Hattangadi-Gluth

表观基因组

JA：利用微生物组与表观遗传组解密自身免疫病（综述）

北京协和医学院张烜教授和团队的综述，在之前他们在Nature Medicine上的研究基础上，全面阐述菌群与自身免疫性疾病的关系，很值得好好看看。

表观基因组微生物组学自身性免疫病 autoimmune diseases epigenetics

植物病原

Cell子刊：植物-微生物互作中的MAP激酶信号通路

Cell Host & Microbe十年回顾，对2007年关于植物-微生物相互作用的研究，很值得回顾看看。

植物病原植物固有免疫 MAPK级联信号 plant innate immunity pathogen-associated molecular patterns

组蛋白修饰

ENL助推组蛋白乙酰化，导致急性髓系白血病

① 癌细胞能够通过表观修饰来激活癌基因，如何识别被修饰的组蛋白非常关键；② YEATS结构域中包含的ENL蛋白在急性髓系白血病的发展中是必需的；敲除ENL后，导致了一系列抗白血病效应；③ ENL结合于乙酰化的组蛋白H3上，并与H3K27ac和K3K9ac共定位于白血病相关的关键基因的启动子区；④ 打乱YEATS结构域和组蛋白乙酰化之间的联系，导致癌基因表达受抑制；⑤ ENL是组蛋白乙酰化的识别者，并在急性髓系白血病的发展过程中调控癌基因的转录。

组蛋白修饰癌基因急性髓系白血病组蛋白乙酰化识别蛋白ENL Netusha Thevaranjan

乳腺癌

Nature Genetics：遗传分析发现乳腺癌超级增强子

① 体细胞基因重排促进癌细胞的遗传变异，本研究系统分析了560个乳腺癌患者中基因充沛的情况，鉴定出了33个较大（>100kb）的串联重复的热点区域；② 这些串联重复的热点区，主要分布在乳腺癌遗传易感基因相邻位点（OR=4.28）、乳腺特异的超级增强子（OR3.54）；③ 这些串联重复区域，是双链DNA锻炼的高敏感区，是未来“二次打击”的高发区；④ 上述基因重排可能影响基因编码区，或基因转录调控序列，参与肿瘤的发生发展。

乳腺癌基因重排转录组增强子

肠易激综合征

DLD：IBS患者的肠道菌群分子特征

复旦大学附属中山医院团队写的综述，很值得读一读。

肠易激综合征肠道菌群 meta分析 Intestinal Microbiota Irritable bowel syndrome

免疫建成

Immunity：吞咽食物前多咀嚼，促进Th17产生

多咀嚼可能会损伤牙龈，但却能促进Th17细胞的产生，神奇不？

免疫建成免疫细胞因子免疫细胞

核心微生物群

EM：在复杂群落中评估核心微生物群

一篇方法学研究论文，研究对象是海绵微生物，但对其他微生物组研究对象也适用，推荐给大家阅读。

核心微生物群 John C Lieske John C Lieske

核心微生物群

JP：通过皮肤微生物组影响皮肤功能（综述）

关于皮肤微生物组与皮肤疾病和健康的综述，很值得看看。

核心微生物群皮肤微生物组

皮肤菌群

Nature Reviews：皮肤免疫耐受建立的窗口期，稍纵即逝

这是2015年Nature Reviews Immunology[IF：39.932]针对Immunity上关于新生鼠皮肤免疫耐受建立的研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1050193700）的介绍文章，很短，但内容很精华，值得读一读。

皮肤菌群免疫耐受 Bernhard Hube Stefanie Allert