翟齐啸+张家超+黄适Cell子刊:益生菌如何改善便秘?锁定菌株特异性背后的关键遗传因子
江南大学陈卫院士翟齐啸教授团队、海南大学张家超教授团队和香港大学黄适教授团队合作,在Cell Host and Microbe发表重要研究,鉴定出影响长双歧杆菌对功能性便秘疗效的关键细菌遗传因子——abfA基因簇,并结合体外实验、多种小鼠模型、队列分析和临床试验等多种方法,对相关发现进行了系统性验证,揭示了其背后的潜在机制,表明益生菌和菌群中的特定遗传因子可在决定菌群功能和宿主表型上发挥关键作用。
2023-11-22
张家超+黄适:基于多队列人群肠菌的SNV或可用于评估肠道健康状态?(荟萃分析)
近日,海南大学张家超、香港大学黄适及团队在mSystems发表最新研究,通过荟萃分析描述了多个人类队列中不同健康状态下肠道微生物的普遍进化模式。发现微生物遗传变化可先于与宿主生理变化相关的生态变化,从而为疾病预测建模提供一个新的宏基因组数据信息层。此外,发现SCFAs产生的一些遗传生物标志物可以覆盖荟萃分析中涉及的大多数慢性疾病,值得关注。
2023-11-10
张家超+黄适+翟齐啸等:塑造益生菌的肠内进化,土著菌群vs宿主因素谁胜出?
近日,海南大学张家超、香港大学黄适和江南大学翟齐啸及团队在npj Biofilms Microbiomes发表最新研究,利用GF和SPF小鼠区分宿主及肠道菌群对益生菌肠道内进化的驱动贡献,并确定激烈的微生物竞争是益生菌在肠道内进化的主要驱动力,而宿主贡献度小于0.5%,为利用肠道菌群进行微生物的突变驯化提供指导。
2023-10-17
诸奇赟+黄适:OGU一种不依赖分类学的宏基因组分析方法
亚利桑那州立大学的诸奇赟和香港大学的黄适作为共同第一作者,与加州大学圣地亚哥分校的Rob Knight团队合作在mSystems上发表文章,开发了一种新的宏基因组分析策略—操作基因组单位(OGU),OGU法不依赖于分类学,直接利用序列比对鉴定到的单个参考基因组作为评估微生物群落多样性的最小单位。
2022-04-14
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