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Changan Liu
文章数:4篇
结直肠癌
于君团队:大肠癌中的肠道真菌群特征和促癌真菌
真菌菌群是人类肠道菌群的主要组成部分,但其在结直肠癌 (CRC) 中的作用未知。香港中文大学于君团队近期在Gastroenterology发表研究,通过对454个CRC、350个腺瘤以及525个健康人粪便进行宏基因组分析,发现在结直肠肿瘤发生阶段,肠道中真菌菌群失调以及病原真菌Aspergillus rambellii富集。这项研究表明粪便真菌也可作为诊断CRC的生物标志物。
结直肠癌
肠道真菌组
生物标志物
人类肠道病毒组
于君团队:人肠道病毒组超深度测序,发现1058种新病毒
缺少病毒参考基因组是病毒组研究面临的一大挑战。香港中文大学于君团队近期在Gastroenterology发表研究,通过改良病毒DNA提取,结合基于三代和二代测序的超深度宏基因组测序,以及配套的生信分析流程,从健康人粪便中解析出1058种基因组完整的新病毒,并对这些病毒基因组进行了多角度分析。这些发现可助力疾病诊断、扩充病毒参考基因组,为进一步开展病毒组研究作出贡献。
人类肠道病毒组
三代测序
PacBio测序
超深度宏基因组测序
诊断标志物
结直肠癌
于君团队:肠道代谢物+菌群或可无创诊断大肠癌
迄今为止,微生物和代谢物如何相互以促进CRC发展的早期事件尚不清楚。香港中文大学的于君团队在Microbiome上发表文章,通过对结直肠癌(CRC)患者、结直肠腺瘤(CRA)患者和健康者(NC)的粪便样本进行代谢组学和宏基因组学分析,鉴定出结直肠肿瘤发生早期阶段潜在的驱动代谢物。代谢组和菌群的综合分析显示,CRC相关代谢物和细菌之间的关联在CRC的不同阶段发生变化。
结直肠癌
肠道代谢物
肠道菌群
标志物
肝癌
于君+黄炜燊+夏强:从肠入肝的代谢物变化或参与肝癌发生
代谢物的改变在肝细胞癌(HCC)的肿瘤发生中起重要作用。来自香港中文大学的于君、黄炜燊和上海交通大学夏强与团队在Gut上发表文章,通过对2个队列人群中HCC患者和健康对照的门静脉血液代谢物变化进行综合代谢组学分析,并与肝组织和粪便样本中的代谢物变化进行比较。结果显示,HCC患者的代谢组发生改变,尤其是门静脉中代谢物的改变,提示出某些代谢产物或在HCC发生中起作用。
肝癌
代谢组学
门静脉