microbial load

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基于粘膜菌群负荷预测克罗恩病患者对粪菌移植的应答

粪菌移植可能缓解克罗恩病，但成功率较低。EBioMedicine上发表的一项最新研究，通过在体外共培养克罗恩病患者的粘膜组织与健康供体的粪便悬浮物后发现，初始菌群负荷较低的粘膜样本在共培养后，供体菌群更容易在粘膜样本中定殖，且表现出更高的抗炎症因子释放，提示粘膜菌群负荷或可作为预测克罗恩病患者对粪菌移植的应答的生物标志物。

克罗恩病 Intestinal microbiome CROHN'S DISEASE FMT Recipient stratification

植物微生物组

中科院遗传发育所开发定量检测宿主微生物组的HA-QAP技术

健康的植物根系定植着复杂多样的微生物组，对于植物的营养吸收、胁迫适应以及疾病抵抗具有重要的作用。当前，植物根系微生物组的检测主要是基于扩增子高通量测序产生的相对丰度，却无法评估微生物相对于宿主的总量（the total microbial load）。而在微生物总量未知的前提下，经典的相对丰度分析有时会产生“欺骗性”的结果，这也是目前微生物组研究的局限。2019年9月17日，Plant Communications 在线发表了中科院遗传与发育生物学研究所白洋组和傅向东组合作完成的论文，报道了一种定量检测宿主微生物组的新技术。此外，之前Nature也报导过一种结合流式细胞术的微生物组绝对定量方法（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1062816672）。

植物微生物组绝对定量内参扩增子测序新方法