Ling Deng

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Ling Deng

文章数：7篇

粪便样本储存缓冲液对下游噬菌体分离或测序的影响

这是发表在Microbiome上的一份工作，作者主要讨论了在不同粪便样本储存缓冲液中，噬菌体的感染活性和核酸稳定性的变化。他们发现不同缓冲液中视具体你的感染性和基因组回收率高度可变，CANVAX或DNA/RNA Shield类缓冲液会快速灭活噬菌体，但它们的宏基因组组成变化最小，同时由于其内含有核酸酶抑制剂，会导致去除游离核酸效率降低，从而引入较多细菌序列污染。其中，在4°C的SM缓冲液存储样品可用于噬菌体分离，-80°C存储可用于测序分析。其他缓冲液存储的样品应在核酸提取前洗涤干净缓冲液残留，以降低影响。

肠道病毒组

Nature子刊：健康婴儿的肠道病毒组

Nature Microbiology近期发表的文章，详细分析了健康婴儿肠道中的病毒组。研究中发现的病毒家族扩展了现有的噬菌体分类，并为未来的婴儿肠道病毒组研究提供了资源。

肠道病毒组健康婴儿病毒多样性

坏死性小肠结肠炎（NEC）

坏死性小肠结肠炎粪菌移植供体-受体菌群动态

坏死性小肠结肠炎(NEC)是一种影响早产儿的危及生命的炎症性肠病，其病理与肠道菌群失调有关。NPJ Biofilms and Microbiomes近期发表的文章，使用早产仔猪作为早产儿的模型，发现采用健康的哺乳仔猪作为供体，对新生早产仔猪进行粪菌移植（FMT）可以降低NEC风险。但其效应是供体特异性的。

坏死性小肠结肠炎（NEC）早产仔猪粪菌移植研究论文

粪便滤液或可替代粪菌移植，预防坏死性小肠结肠炎

坏死性小肠结肠炎对于早产儿是一种致命威胁。ISME Journal上发表的一项最新研究，利用剖腹产的乳猪作为早产儿模型，并使用健康乳猪作为粪便供体，对比了粪菌移植及粪便滤液移植对坏死性小肠结肠炎的预防作用。结果发现，粪菌移植可诱导黏膜免疫应答，且无法预防坏死性小肠结肠炎；而经口胃的粪便滤液移植可完全预防坏死性小肠结肠炎，且无任何副作用，并可减少坏死性小肠结肠炎相关的变形菌门的丰度。

粪菌移植粪便滤液研究论文基础研究其它哺乳动物（猪羊牛等）

坏死性小肠结肠炎（NEC）

抗生素或降低粪菌移植对坏死性小肠结肠炎的治疗效果

早产儿有多种疾病风险，包括坏死性小肠结肠炎（NEC），疑似NEC患者需接受静脉注射抗生素（AB）预防败血症。虽然肠内AB治疗能有效降低NEC风险，但由于可能产生AB耐药风险而较少使用。粪菌移植（FMT）在动物实验中显示对NEC具有保护作用，但AB和FMT之间的相互作用在新生儿中缺少研究。Gut Microbes近期发表的文章，研究了肠内静脉注射抗生素（AB）和直肠粪便菌群移植（FMT）联用对坏死性小肠结肠炎（NEC）的治疗效果，发现AB会拮抗FMT对NEC的治疗效果，FMT可部分逆转AB对肠道菌群的影响，但对AB造成免疫系统的发育失调没有效果。研究结果显示不建议新生儿中联合使用AB和FMT。

坏死性小肠结肠炎（NEC）抗生素粪菌移植

粪便病毒组移植

粪便病毒组移植的前景与局限（综述）

噬菌体是粪便病毒组的主要成员，能感染细菌，进而操纵肠道菌群，影响人体健康。FEMS Microbiology Reviews近期发表的一篇综述，讨论了用无菌过滤的供体粪便(含病毒、代谢物和细胞碎片，但不含完整的细菌细胞)替代FMT进行干预，对治疗IBD（炎症性肠病）、肥胖症和2型糖尿病等疾病的可能性，并阐述了噬菌体是如何通过FVT在肠道微生物组中发挥关键作用的。最后，文章还指出了未来使用FVT干预时应考虑的因素及安全隐患。值得一读！

粪便病毒组移植 gut microbiome Bacteriophages phage therapy fecal virome transplantation

Nature子刊：婴儿肠道中烈性大肠杆菌噬菌体的数量少，但感染性强

噬菌体是人类肠道微生物的重要组成部分，但对肠道菌群的影响，我们知之甚少。Nature Communications最近发表的研究，从一岁大的婴儿粪便样本分离出的大肠杆菌中，有60%以上会自发释放温和噬菌体，但这些温和的噬菌体在大肠杆菌上的宿主范围很窄。从粪便样本中也分离出了烈性噬菌体，这些噬菌体的宿主范围要大得多，这或许有助于它们在本生态系统中的存活，并在肠道菌群动态中发挥作用。本研究强调了开发培养学方法以更好地了解噬菌体在肠道菌群中的生物学作用的重要性。

婴儿菌群噬菌体大肠杆菌温和噬菌体烈性噬菌体