16S 扩增子测序

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16S 扩增子测序

文章数：4篇

iMeta：中国科学院团队揭示荒漠地衣结皮中关键细菌具宿主选择趋势

本研究以石果衣属地衣Endocarpon为对象，利用16S rRNA基因V4高变区的扩增子测序，首次对来自三块代表荒漠的120个样品的4个垂直生态取样位中的细菌群落进行了分析。本研究揭示了干旱荒漠地衣关键菌群的组成规律、追溯了地衣相关细菌特别是关键物种的来源，为更好地了解地衣共生体的稳态维持机制提供了重要参考。

地衣关键菌群群落组装宿主选择结皮土

国内团队iMeta：引物选择影响环境菌群的微生态模式评估

该研究基于五种生境来源（水、沉积物、土壤、叶际和动物肠道）共352组扩增子测序数据，使用针对16S rRNA基因V4和V5−V7区域的两对引物，评估了群落表征和微生态模式（包括物种丰度分布、beta多样性分区和群落构建过程）中的引物偏倚。本研究揭示了引物选择在菌群的有效监测以及在多生境微生态模式的准确评估中起到了关键作用，为相关实验设计和数据分析策略提供了参考。

引物选择环境菌群微生态模式 16S 扩增子测序引物偏倚

新生儿湿疹

iMeta：谢黎炜+马颖等发现新生儿肠道微生物网络结构变化规律

南方医科大学谢黎炜、马颖团队在iMeta发表研究，结合图论与网络算法系统探索了中国婴儿生命早期的肠道菌群变化，联合分析结果表明不同民族的健康婴儿在生命初期的肠道菌群网络形态发展规律相似；并且健康婴儿的肠道菌群网络形态比患有湿疹的婴儿更稳定和复杂。此外，健康的婴儿肠道菌群丰富度在生命早期逐步增高，而母亲在孕晚期血清甘油三酯（TG）的高水平可能是出现新生儿湿疹的危险因素。

新生儿湿疹肠道菌群图论网络算法血清甘油三酯

16S 扩增子测序

iMeta：中国农大揭示有机农业长期定位试验番茄菌群结构

在长期定位试验条件下环境因素对番茄菌群结构的影响尚不明晰。本研究在长期定位试验的基础上，通过16S 扩增子测序和分离培养技术比较了不同种植模式下番茄内生细菌的群落结构。本文综合分析了器官生态位和种植模式对番茄内生菌群的相对贡献。本研究将有助于全面了解温室农业生态系统中番茄内生菌群结构，并为有益菌群服务于农业生产提供指导意义。

16S 扩增子测序分离培养种植模式番茄内生细菌器官生态位