微生物关联估计

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NetCoMi：R中微生物组数据的网络构建和比较

本文介绍了NetCoMi，一个用于微生物组数据的网络构建和比较的R软件包，它在单个可重现的计算工作流程中集成了每个分析步骤的现有方法。该软件包提供了用于构建和分析单个微生物关联网络以及量化网络差异的功能。这样就可以洞悉单个类群，类群组或整个网络结构在各组之间是否发生了变化。NetCoMi还包含用于构建差异网络的功能，从而允许评估单对类群在两组之间是否存在差异关联。此外，NetCoMi有助于构建和分析微生物组样品的异种网络，从而可以对整个微生物组样品采集的异质性进行高级图形化汇总。可在https://github.com/stefpeschel/NetCoMi上获得NetCoMi软件包以及教程。

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