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Ansel Hsiao
文章数:8篇
细菌间互作
大肠杆菌产生的colibactin如何抑制霍乱弧菌定殖?怎样重塑肠道菌群?
肠道等环境中的复杂微生物群落成员已经进化出种间竞争机制,目前发表的研究工作主要集中在代谢或生态位的竞争上,而对具体的微生物间的靶向机制研究较少。PNAS 近期发表的文章,首先确定了小鼠肠道中对霍乱弧菌感染具有害影响的肠道共生菌,进一步分析发现由pks基因岛编码的基因毒素colibactins,对于在体外和小鼠肠道中拮抗霍乱弧菌至关重要。并且,colibactins可特异性杀死肠道中的Bacteroides fragilis来塑造微生物群。本研究结果阐明了colibactins塑造微生物群落的机制,并为探究肠道多细菌相互作用在感染和疾病防治等方面提供了新思路。
细菌间互作
colibactin
霍乱弧菌
肠道微生物组
sos反应
可移动遗传元件
Cell子刊:一类可移动遗传元件,或帮助拟杆菌在肠道中获得竞争优势
由可移动遗传元件(MGEs)的水平转移,促进形成了人类肠道微生物组的功能和基因组多样性。一些MGEs编码的的基因,可能帮助细菌进行自我防御(如抗生素抗性),或提高细菌竞争资源(如维生素)的能力。维生素B12和相关化合物(类咕啉)是使肠道菌群中的拟杆菌成员定植的关键营养物质。Cell Reports发表的这项研究,从拟杆菌中鉴定出一类MGEs,编码了拟杆菌中的维生素B12转运体,并通过体外和体内实验证明了水平基因转移在塑造拟杆菌对B12等营养小分子的竞争中的重要性。
可移动遗传元件
拟杆菌门
肠道菌群
水平基因转移
维生素12
噬菌体
Cell子刊:噬菌体的溶源性感染影响其细菌宿主的转录及功能
肠道相关噬菌体可改变其细菌宿主的丰度及活性,从而影响人体健康与疾病。温和噬菌体占据了肠道病毒组中的大部分,而噬菌体的溶源性感染的作用尚未完全明确。Cell Reports上发表的一项最新研究,鉴定出了一种属于Salyersviridae病毒科的拟杆菌属噬菌体BV01,并发现BV01对普通拟杆菌的溶源性感染可导致其整合至宿主TspO蛋白的启动子区域,以抑制胆盐水解酶的表达,从而改变普通拟杆菌的胆汁酸代谢活性。
噬菌体
Bacteroides
gut microbiome
Bacteriophage
temperate phage. bile acids. host-microbe interactions. phage-host interactions
定植抵抗
Cell:肠道菌群如何影响人体对霍乱感染的易感性和抵抗力
过去的研究比较了霍乱患者和其未发生疾病症状的家庭成员的肠道菌群的差异,但是关于肠道菌群组成差异是否会影响宿主对霍乱弧菌等病原体的抵抗力和敏感性的研究很少,而《Cell》发表的这项研究为我们带来了新的见解。这一研究说明,我们肠道菌群的组成或会通过胆汁代谢影响宿主对肠道病原体的易感性,为未来通过微生物组疗法预防霍乱等疾病带来了新希望。
定植抵抗
肠道菌群
霍乱
霍乱弧菌
疾病易感性
儿童营养不良
Gordon团队:特定有毒菌株,让营养不良儿童体重减轻
最新一期Science Translational Medicine上Jeffrey I Gordon和团队的研究,发现转移到无菌小鼠中的营养不良儿童的菌群中包含了一个产肠毒素的脆弱拟杆菌菌株,它造成了体重减轻,而这样的表型可传递给后代,且与宿主能量代谢紊乱相关。Science子刊 + Jeffrey I Gordon,值得你必须看一看。
儿童营养不良
无菌小鼠模型
肠道病原体
Brennan Spiegel
Brian E Lacy
霍乱弧菌
Nature:肠道瘤胃球菌可抑制霍乱弧菌感染
这是2014年发表在Nature的重要研究,分析了霍乱弧菌感染前后的人体肠道菌群变化,鉴定了与感染后恢复密切相关的细菌。经典文献,特别推荐。
霍乱弧菌
瘤胃球菌属obeum
酸奶
Science子刊:酸奶里的益生菌,对肠道菌群有何影响?
研究发酵乳品如何影响菌群:① 研究对人的影响需严格对照,小鼠则可控制变量;② 食用酸奶前后,分析人粪菌和宏转录组;给限菌小鼠强饲,观察前后变化;③ 人粪菌组成无显著变化,相关基因几无变化;④ 小鼠菌群有微小变化,但许多代谢通路相关的酶尤其是糖代谢酶显著提升;⑤ 食用酸奶的限菌鼠中,动物双歧杆菌是优势群体,它们上调了低聚木糖代谢相关基因座;⑥ 在酸奶摄入期,包括与植物多糖代谢有关的人的宏转录组有显著变化。
酸奶
肠道菌群
酸奶
Science子刊:酸奶里的益生菌,对肠道菌群有何影响?
研究发酵乳品如何影响菌群:① 研究对人的影响需严格对照,小鼠则可控制变量;② 食用酸奶前后,分析人粪菌和宏转录组;给限菌小鼠强饲,观察前后变化;③ 人粪菌组成无显著变化,相关基因几无变化;④ 小鼠菌群有微小变化,但许多代谢通路相关的酶尤其是糖代谢酶显著提升;⑤ 食用酸奶的限菌鼠中,动物双歧杆菌是优势群体,它们上调了低聚木糖代谢相关基因座;⑥ 在酸奶摄入期,包括与植物多糖代谢有关的人的宏转录组有显著变化。
酸奶
肠道菌群