Eugene V Koonin

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Eugene V Koonin

文章数：7篇

Cell：全球RNA病毒组的扩展揭示出新的进化分支

噬菌体在人类肠道微生物组的生态学中具有重要作用，但在参考数据库中的代表性不足。2021年，美国劳伦斯-伯克利国家实验室Nikos C. Kyrpides等人，对11810个人类粪便样本的宏基因组进行大规模的病毒基因组组装，构建了宏基因组肠道病毒目录（包含189680个病毒基因组草图）。近日，Nikos C. Kyrpides联合其他研究人员在Cell发表最新研究，通过挖掘5150个不同的宏转录组，鉴定出超过250万个RNA病毒重叠群，鉴定出2个新的噬菌体门和多个噬菌体纲、目，极大地的扩展了噬菌体的进化分支。总之，目前对全球RNA病毒的采样远远没有达到饱和，未来仍需进一步整合，提高我们对RNA病毒圈的认识。

RNA病毒宏转录组研究论文基础研究病毒组

国内团队Nature：发现阿斯加德古菌新分支悟空古菌

阿斯加德古菌（Asgard）是近期发现的一个新的古菌超门（superphylum）。多方面证据显示，真核生物可能起源于阿斯加德古菌，探讨阿斯加德古菌与真核生物起源是当前国际生命科学研究的前沿热点。近期国内深圳大学高等研究院李猛教授团队在Nature发表关于阿斯加德古菌研究的最新进展，他们对阿斯加德古菌的162个完整或几乎完整的基因组进行了比较分析，大大扩展了阿斯加德古菌的系统发育多样性，将阿斯加德古菌从原有的6个门增加到12个门，并将其中一个门命名为悟空古菌，进而对真核生物起源于阿斯加德古菌的假设进行了深入的探讨。

古菌研究论文基础研究阿斯加德古菌悟空古菌

人体肠道噬菌体

肠道元基因组分析发现数千种新噬菌体

Microbiome近期发表的文章，通过对整个人类肠道宏基因组中发现的噬菌体基因组的分析，至少确定了三个新的尾病毒目候选家族，并揭示了人类肠道中噬菌体-宿主相互作用的各种假定机制。这些发现还扩展了噬菌体基因的功能，特别是脂质生物合成途径、过氧化氢酶类、HipA家族蛋白激酶和与防御相关的高变基因。这些发现将有助于人类肠道病毒组的分类和功能特征研究。

人体肠道噬菌体病毒组

crAss样噬菌体

Nature子刊：肠道crAss样噬菌体具有独特的基因组特征

crAss样噬菌体是人肠道中丰度最高的病毒，能感染拟杆菌门细菌。Nature Communications发表的文章，从人类肠道宏基因组中鉴定了近600种crAss样噬菌体的基因组，一些crass样噬菌体具有独特的基因组特征，如DNA聚合酶在A和B家族之间频繁的交换，晚期噬菌体基因中替代遗传密码的广泛利用，以及高密度的自剪接内含子和内含肽。对crass样噬菌体的系统基因组研究不仅增加了我们对人类肠道病毒的认识，而且揭示了噬菌体生物学有趣且鲜为人知的一面。

crAss样噬菌体 crAss样噬菌体基因组人体肠道噬菌体

Nature子刊：人体肠道中丰度最高的噬菌体病毒

这是近期Nature Microbiology发表的关于肠道噬菌体病毒的重要研究，值得专业人士好好读读。

噬菌体

COV：病毒-宿主共进化中的Polintons、噬病毒体与转座病毒（综述）

这是关注病毒相关研究的专业人士必读的一篇综述，介绍三个非专业人士可能非常陌生的新名词。特别推荐。另，Polintons这个词如何翻译？有知道的人欢迎留言给我们。

噬病毒体转座病毒共进化 Hyun Koo Yuan Liu

Nature Reviews：宏基因组时代的病毒分类

我们关注菌群，很多时候主要指的是细菌，但对病毒的研究和分类决不能忽视，这篇文章，一定可以好好读读。

病毒组分类学国际病毒分类学委员会 Shanti L Eswaran Kenya Jackson