人类粪便菌群

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核糖体分析

Nature子刊：同时对来自人体菌群的数百种微生物进行核糖体分析

核糖体分析已应用于培养的细菌分离株，但将其应用于未培养的混合群落一直具有挑战性。该研究提出了 MetaRibo-Seq，这是一种能够将核糖体分析直接应用于人类粪便菌群的方案。本研究提供了用于质量控制和读长修正的计算工作流程，从头组装具有宏基因组读长的参考宏基因组，将 MetaRibo-Seq 读长与参考比对，并评估 MetaRibo-Seq 文库的质量(https://github.com/bhattlab/bhattlab_workflows/tree/master/metariboseq）。此 MetaRibo-Seq 方案使标准分子生物学实验室的研究人员能够在大约 5 天的时间内研究粪便菌群中的翻译组。

核糖体分析 mRNA 人类粪便菌群质控从头组装