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Jason M Ridlon
文章数:8篇
胆汁酸代谢
厚壁菌门中一种新型胆汁酸还原酶
肝脏中胆汁酸合成是机体排出多余胆固醇的主要途径,且胆汁酸在小肠脂质代谢中发挥着重要的作用。胆汁酸部分在肠道中在吸收,重新回到肝脏中,而有部分胆汁酸则进入大肠,最终被排出体外。在大肠中,各种不同的肠道菌群均可以把胆汁酸进行生物转化,从而产生不同的次生代谢物。这些次生代谢物可以作为多种信号分子,与人类健康有着密切的关系。结肠中胆汁酸代谢依赖于胆酸盐水解酶以及胆汁酸诱导(bai)操纵子的调控,此前对L. scindens中的bai基因研究较为深入。近年来有研究发现厚壁菌门也具有bai基因,可能参与形成脱氧胆酸(DCA)和石胆酸(LCA)异构体,但对其具体的机制尚不明确。近期一篇发表在Gut Microbes的研究成果发现baiP和baiJ两个基因均编码一种新型3-oxo-Δ -5ɑ胆汁酸还原酶,在厚壁菌门特异性分布,参与A/B反式扁平胆汁酸次生代谢物的合成。进一步研究发现baiP和baiJ与结肠癌发生相关。
胆汁酸代谢
baiP
胆汁酸次生异构代谢产物
胆汁酸5-ɑ还原酶
厚壁菌门
硫代谢菌群
人肠道菌群中的硫代谢基因及其与结直肠癌的关联
来自Microbiome上发表的一项最新研究结果,对人肠道菌群中的硫代谢基因进行了深入分析,并鉴定出了与结直肠癌相关的硫酸盐还原基因。
硫代谢菌群
研究论文
硫代谢基因
基础研究
结直肠癌
胆盐代谢
Science子刊:斑马鱼肠道胆盐的FXR信号传导和微生物代谢
所有的脊椎动物都有胆盐的合成、分泌和再吸收过程。这一信号过程在哺乳动物中研究的较为深入,通常胆盐组成成分是由宿主和肠道微生物通过调节胆盐结合转录因子胆汁酸受体(Fxr)共同决定的。但是,目前对于其他脊椎动物类,该过程的情况仍知之甚少。近期一篇发表在Science Advances上的一篇研究工作,探索了脊椎动物模型斑马鱼肝脏胆盐合成和回肠转运的途径。研究显示在斑马鱼中,胆盐合成、分泌和再吸收的关键成分与哺乳动物是高度保守的,也同样受Fxr的调控。此外,研究利用单细胞测序技术,提供了斑马鱼肠上皮细胞图谱,揭示了Fxr在回肠其他细胞类型中的转录和细胞分化中的作用。这一研究成果建立了斑马鱼作为研究胆盐代谢和Fxr信号转导的非哺乳动物脊椎动物模型。
胆盐代谢
胆汁酸受体
fxr突变体
单细胞测序分析
回肠上皮细胞功能特化
胆汁酸代谢
构建研究次级胆汁酸的小鼠模型
E.muris菌是一种新发现的小鼠肠道细菌,可通过7α-脱氢作用将胆酸(CA)代谢为脱氧胆酸(DCA)。虽然胆汁酸影响代谢和炎症反应,但很少有体内模型可用于研究其代谢和对宿主的影响。Gut Microbes近期发表的文章,发现E.muris菌可在悉生小鼠中稳定定植,并产生次级胆汁酸,该模型可以用于研究次级胆汁酸在体内的病理生理作用。
胆汁酸代谢
E. muris
悉生小鼠
猪
Nature子刊:猪肠道细菌集合的分析鉴定
Nature Communications上发表的一项最新研究,对猪的肠道细菌进行培养,在分离出的117个菌株中,鉴定出16个新的菌属及22个新的菌种,并发现了一些新的有趣的菌群功能,包括Clostridium porci的基因组中编码的岩藻糖转移酶等。该研究鉴定出的“猪肠道细菌集合”(PiBAC)已公开,有助于进一步深入了解猪肠道菌群的功能。
猪
研究论文
基础研究
噬菌体
Cell子刊:噬菌体的溶源性感染影响其细菌宿主的转录及功能
肠道相关噬菌体可改变其细菌宿主的丰度及活性,从而影响人体健康与疾病。温和噬菌体占据了肠道病毒组中的大部分,而噬菌体的溶源性感染的作用尚未完全明确。Cell Reports上发表的一项最新研究,鉴定出了一种属于Salyersviridae病毒科的拟杆菌属噬菌体BV01,并发现BV01对普通拟杆菌的溶源性感染可导致其整合至宿主TspO蛋白的启动子区域,以抑制胆盐水解酶的表达,从而改变普通拟杆菌的胆汁酸代谢活性。
噬菌体
Bacteroides
gut microbiome
Bacteriophage
temperate phage. bile acids. host-microbe interactions. phage-host interactions
癌症
微生物组如何影响癌症进程和疗效?(观点)
微生物组或影响癌症进展和治疗反应,但具体作用尚不清楚,需要更多的研究。最新发表在Trends in Cancer的观点文章详细分析了微生物组对癌症进程和治疗的直接或间接影响方式。微生物组与癌症之间的互作是两个复杂系统的互作,或需引入系统生物学的方法进行分析。目前已有一些改变恢复癌症患者微生物组的治疗方法正在进行试验,但仍需要进一步探究以更好地治疗癌症。
癌症
微生物组
代谢
共生菌
免疫治疗
胆汁酸
肠道菌群对氢气与胆汁酸的代谢作用(综述)
来自FEBS Letters的一篇最新综述,介绍了肠道菌群如何代谢氢气及胆汁酸,以对宿主生理产生影响。
胆汁酸
氢气
放线菌门
acetogenesis
bile acids