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Ian B Jeffery
文章数:14篇
菌群-疾病关联性
年龄可能影响对疾病相关菌群特征的鉴别
对疾病、菌群与年龄三者之间关联的研究较少。来自eLife上发表的一项最新研究,发现随着年龄的增长,个体将逐渐获得与疾病相关的菌群特征,并鉴定出一个与年龄增长相关的分类群集合,该集合的变化在多种疾病中均可发现。该研究结果提示,年龄相关的菌群变化可能影响对菌群-疾病关联的研究。
菌群-疾病关联性
年龄
Shuai Yuan
Jie Chen
Xue Li
地中海饮食
Gut:地中海饮食通过调节肠道菌群改善老年人的健康状态
NU-AGE项目是一项在5个欧洲国家进行的为期1年的地中海饮食干预项目,在该项目中发现,地中海饮食的高依从性与认知、记忆、免疫功能、骨质、血压等指标的改善相关。Gut上发表的这篇最新文献报道了对NU-AGE项目的最新研究结果,发现地中海饮食的依从性与菌群组成及菌群代谢产物的特定变化相关,对地中海饮食依从性更高的受试者中富集的分类群,与老年人的健康指标及认知功能改善正相关,并与炎症标志物呈负相关。结果提示,地中海饮食可能通过调节肠道菌群的组成与功能,起到改善老年人健康状态的作用。
地中海饮食
老年人
地中海饮食
饮食-菌群互作
虚弱
肠易激综合征
IBS和胆汁酸吸收障碍的菌群和代谢组标志物
肠易激综合征(IBS)是一个异质性的疾病,目前对临床亚型的诊断主要基于患者症状,缺少临床可用的生物标志物。这可能引起误诊,比如可引发腹泻的胆汁酸吸收障碍(BAM),因为症状相似,就常被误诊为腹泻型IBS,从而耽误治疗。Gastroenterolog发表的一项最新研究,试图通过分析粪便微生物组以及尿液和粪便代谢组,来寻找可用于诊断IBS及其亚型的标志物。研究发现,IBS患者的尿液和粪便代谢组以及粪便微生物组,与健康人有显著不同,而这种差异与IBS临床亚型无关,提示现有的IBS亚型诊断标准,无法反映患者的菌群和代谢异常;此外,该研究还表明粪便代谢组特征可用于判断患者是否患有BAM,有助于提高诊断准确性。这些发现为临床诊断和治疗IBS,提供了新的参考和视角。
肠易激综合征
machine learning
SeHCAT
stratification
Ruminococcus gnavus
维生素K
菌群产生的维生素K与老年人的认知水平相关
维生素K有多种生理益处,包括维持大脑髓鞘的完整性。American Journal of Clinical Nutrition上发表的一项队列研究发现,在老年人中,肠道菌群合成维生素K的能力及粪便中的特定维生素K浓度,与认知水平显著相关。
维生素K
microbial menaquinone biosynthesis
elderly
cognition
Shotgun metagenomic sequencing
骨密度
肠道菌群变化和老年人的骨密度减少相关
老年人易患骨质疏松症。来自Rheumatology上发表的一项最新研究,对比分析了骨密度减少的老年人(包括骨质疏松患者)与骨密度正常的老年人的肠道菌群,并鉴定出了部分与骨密度减少相关的细菌属,提示菌群或可作为骨密度减少的生物标志物或治疗靶点。
骨密度
Osteoporosis
Gut microbiota
bone mineral density
elderly
肠型
Nature子刊:利用“肠型”对肠道菌群进行分类
这是Nature Microbiology发表的重要文献,包括王俊、赵立平等两位中国科学家在内的29位菌群研究领域的重量级科学家,针对“肠型”这个概念进行了新的探讨,以求推动对这个重要概念的统一认识并将其推到实践。新方案是综合之前多种分型方案之长但充分考虑菌群功能、生态学及临床需求的在线方法。具体方法值得专业人士去深挖,我们仅简要介绍。特别推荐!
肠型
Trevor Beaudoin
Charles M Deber
肠道菌群
Microbiome:从出生到24周,婴儿肠道菌群怎么变?
足月顺产、足月剖腹产、早产婴儿,在出生后到24周时,肠道菌群都会经历怎样的变化过程,不同生产方式的婴儿的菌群有何不同,好好看看这篇文章,必有收获。
肠道菌群
婴儿
Philip L Molyneaux
Philip L Molyneaux
结肠直肠癌
Gut:到底有什么细菌与大肠癌相关?
① 对59位结肠直肠癌(CRC)患者、21位带有息肉的普通患者、56位健康人粪便和粘膜样品分析;② CRC患者粘膜菌群组成以及基因表达与健康人不同,可根据粘膜相关细菌共丰度群(CAGs)的水平结构进行分级;③ 菌群组成改变并不局限于癌变组织,在远、近端癌症中也有所不同;④ 拟杆菌簇1和厚壁菌簇1在CRC黏膜中丰度降低,而拟杆菌簇2、厚壁菌簇2、病原体簇和普雷沃氏菌簇在CRC黏膜中丰度升高;⑤ CRC相关的CAGs与宿主免疫炎症反应基因表达谱存在差异。
结肠直肠癌
粘膜微生物群
Jonathan Braun
Jonathan Braun
老年人
肠道菌群中的早衰特征
① 纳入728名年龄42-86岁之间的女性双胞胎的粪便样本,进行16S rRNA测序分析,研究老年人身体虚弱与肠道菌群组成之间的关系;② 结果表明,虚弱指数(frailty index,FI)与肠道菌群的α-多样性呈显著负相关,其中637个OTUs与FI相关;③ 细长真杆菌及迟缓埃格特菌丰度增加与FI呈正相关,而柔嫩梭菌与其呈负相关;④ 60个OTUs相关在老年人队列中得到重现,OTU共现模组,虚弱性和多样性之间对比显著;⑤ FI与肠道菌群之间的因果关系尚待探究。
老年人
肠道菌群
虚弱
Silvia Guglietta
Maria Rescigno
衰老
Science:肠道菌群与衰老关系密切
这是15年底Science的一篇重要文章,题目就是简洁的“肠道菌群和衰老”,明确链接二者的关系。非常值得我们好好读一读。
衰老
肠道菌群
功能基因组学
对213株乳杆菌及其相关菌属进行比较基因组学研究扩展乳酸杆菌的生物应用潜力
① 乳酸菌的代谢多样性、种属不明确、与其他重要的乳酸菌之间关系的不确定性,使得开发利用乳酸菌变得复杂,且乳酸菌催化的生物转化能力尚未开发;② 发布213株乳杆菌及其相关菌属的基因组序列,发现73个核心基因,描述修饰碳水化合物和蛋白质的编码基因目录;③ 乳酸杆菌有广泛且多样性的新CRISPR-Cas免疫系统,可用于基因编辑;④ 揭示乳酸杆菌在自然和工业环境的宿主相互作用因子和细菌素的系统基因组学分布,及工艺过程中承受压力的机制。
功能基因组学
乳杆菌
Diet
Gut:地中海饮食对肠道菌群和代谢组有何好处?
去年Gut上关于地中海饮食如何影响肠道菌群和相关代谢组的重要文献,特别分享给大家。
Diet
DIETARY FIBRE
ENTERIC BACTERIAL MICROFLORA
INTESTINAL BACTERIA
Short chain fatty acids
微生物组学
Microbiome:人体微生物组学的未来在哪里?
① 2013年7月24日至26日在美国马里兰州的贝塞斯达召开了题为“人类微生物组学:憧憬未来”的学术会议;② 会议汇集了人类微生物组研究领域的专家,旨在全面介绍微生物组研究的现行状态,但更重要的是确定并讨论这个新兴领域研究的不足,挑战和机遇;③ 本报告将总结一下专家演讲报告,并阐述了在继续推动并提供医学转化应用方面,人类微生物组该做什么样的研究。
微生物组学
Jing Sun
Jiaming Liu
衰老
Nature:饮食和健康状况,影响老年人的肠道菌群
这是Nature在2012年发表的衰老(老年人)肠道菌群研究,我们今天特别重温。
衰老