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HMMs
文章数:1篇
CAZymes
鉴定宏基因组中碳水化合物相关基因的网站dbCAN2
随着越来越多的人类、动植物相关的微生物基因组和宏基因组被测序,迫切需要用于CAZymes基因挖掘的自动工具。作者在2012年开发了dbCAN Web服务器,以提供公共服务,为新测序的基因组提供自动CAZyme注释。在这里dbCAN2(http://cys.bios.niu.edu/dbCAN2)作为升级版,其中集成了三个用于CAZome(基因组的所有CAZyme)注释的最新工具, 此外,dbCAN2现在还接受核苷酸序列提交,并提供预测具有物理连接CAZyme基因簇(CGC)的服务,这将是非常有用的在线工具,用于识别微生物基因组或宏基因组中假定的多糖利用基因座(PULs)。
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