Environmental Microbiology

甘蔗植物菌群 Tim Hendrikx Bernd Schnabl

两栖动物

EM：两栖动物体表细菌的抗病功能与其丰度的关联

这是Environmental Microbiology[IF：5.395]发表的针对两栖动物皮肤表面的细菌抑制真菌致病菌蛙壶菌的研究，推荐专业人士特别看看。

两栖动物体表菌群蛙壶菌 Ruth Schübel Tilman Kühn

空肠弯曲杆菌

EM：氧含量如何影响致病菌空肠弯曲杆菌的毒力因子

这是关于食物中常见的致病菌空肠弯曲杆菌如何受到氧含量影响而产生不同毒力因子的研究，特别推荐。

空肠弯曲杆菌

宿主-菌群互作

EM：胃肠道中的宿主-菌群互作（综述）

这是Environmental Microbiology[IF：5.395]发表的关于宿主-菌群相互作用的综述，值得作为入门文献阅读。

宿主-菌群互作 Yulong Yin Xia Xiong Jian Zhou

弯曲杆菌

EM：南非的海鸥，或传播病原菌和耐药基因！

这是一项在南非开展的研究，发现天上飞的海鸥，像地上走的和被人吃的其他动物一样，可能是病原菌和耐药基因传播的有效宿主。有趣并也是值得关注的研究，特别推荐！

弯曲杆菌沙门氏菌海鸥耐药性 PFGE

两栖动物

EM：能抑制病原体的两栖动物皮肤菌群

这是Environmental Microbiology[IF：5.395]上发出的针对两栖动物皮肤菌群的重要研究，针对牛蛙、东方蝾螈、春雨蛙和美国蟾蜍的不同皮肤菌群如何抑制病原体做了仔细研究，很值得一读，特别推荐。

两栖动物皮肤菌群两栖动物病原体优势菌稀有菌

尾滴虫

EM：原生生物影响植物叶菌群的组成与功能

这是关于尾滴虫（一种原生生物）如何影响植物叶相关菌群的研究，推荐关注植物菌群的专业人士阅读。

尾滴虫叶相关菌群原生生物 bacteria functional diversity

宏基因组学

EM：Patescibacteria中DNA损伤诱导网络的比较基因组学

Environmental Microbiology[IF：5.395]上关于特定细菌的比较基因组学研究一项，特别推荐。

宏基因组学遗传学多样性比较基因组学 SOS调控网络转录抑制因子LexA

小麦麸

EM：个体差异决定了人体肠道菌群在小麦麸上的定殖结果

① 未消化的、不溶性膳食颗粒是肠道菌群的食物来源，同时为其提供黏附场所；② 分析人粪便菌群在小麦麸及菊粉颗粒上的定殖情况；③ 两种颗粒上菌群组成情况很大程度上依赖粪菌捐赠者；④ 因捐赠者不同，发酵后产生比例较高的丙酸或丁酸；⑤ 麦麸颗粒上定殖了丰富的C.cluster XIVa、普氏菌、罗斯氏菌、巨单胞菌、双歧杆菌和拟杆菌属；⑥ 菌属中有些为小麦麸的主要分解者，有些依靠交叉喂养获得能量；⑦ 所有捐赠者都有以上两种功能菌群。

小麦麸 adhesion bacteria microbe:microbe interactions microbes and surfaces

桡脚类动物

EM：海洋桡足类动物肠道菌群的季节性变化

这是又一篇研究动物肠道菌群季节性变化的文章，推荐关注这方面的专业人士阅读。

桡脚类动物季节性变化海洋 Meagan E Sullender Megan T Baldridge

肠道菌群

海洋中桡脚类动物肠道菌群的季节性变化

① 在马尾藻海，经过两年的季度性探索发现：常年稳定存在的菌群有厚壁菌门，拟杆菌门和放线菌，并且其变化具有同步性，可能与动物的营养条件有关；② 肠道菌群是在海水中分离的，说明桡脚类动物长年、特定的社群稳定性；③ 菌群主要的短暂变化发生在早冬和早春，尤其是聚球藻属的相对丰度可以达到65%，从而使水体中的浮游细菌增加，桡脚类动物以此为食；④ 专/兼性厌氧菌，包括梭菌，的存在，表明在贫营养的开放海洋中，厌氧反应也时有发生。

肠道菌群桡脚类动物海洋菌群季节性变化 Teppei Shimasaki

环境微生物学：人类在城市化中丢失和获得什么细菌？（综述）

在城市化和工业化进程中，人类丢失了什么细菌，得到了什么细菌，这又有什么重大意义？看看这篇文章。

Changqing Zhong Changmin Qu

EM：花粉中的菌群

花粉中有什么细菌？居然也有人和动物肠道中常见的肠杆菌科细菌，神奇不？

核心微生物群

EM：在复杂群落中评估核心微生物群

一篇方法学研究论文，研究对象是海绵微生物，但对其他微生物组研究对象也适用，推荐给大家阅读。

核心微生物群 John C Lieske John C Lieske

儿童肥胖

EM：儿童肥胖与肠道菌群（综述）

关于成年人肥胖的研究很多，但儿童肥胖需要更多关注，包括儿童肥胖与肠道菌群的关系，值得我们更多认识。这篇综述，值得一看。

儿童肥胖肠道菌群 Yi Zheng Heping Zhang Xiaoxia Xi

肠道菌群

EM：人体肠道菌群到底有多稳定？这有何关键意义？

人的肠道菌群到底稳不稳定？变化大不大？这个关键性问题其实不是那么贸然可以回答，支持的证据维度也不一样，而菌群的变化往往又跟健康关系密切，所以了解变化的幅度等等都是很关键的。这篇文章相当值得仔细读一读。

肠道菌群稳定性 Chad M Trent Martin J Blaser

噬菌体

赵方庆团队：噬菌体与细菌在人体口腔如何相互作用？

中科院北京生科院赵方庆老师和团队在2015年对噬菌体与细菌在人体口腔中相互作用的研究，特别推荐给大家。

噬菌体噬菌体-细菌相互作用交叉侵染噬菌体口腔菌群 Wendy S Garrett

Phenotype

Biolog PM表型芯片用于微生物细胞的表型鉴定

① Biolog PM表型芯片为微生物生长表型的全方位分析提供一个高通量方法，其原理是利用显色反应在微孔板上测定单个菌株或微生物群落对不同营养物质和化学物质的反应；② 该技术可应用于检测与基因敲除相关的表型变化，进而研究基因功能并改善基因组的注释；③ 同时可应用于微生物群落的生理分析，包括研究不同自然环境或工业环境中微生物群落空间及瞬时特征；④ 该芯片还可用于代谢功能的研究，并可根据不同的研究需求进行个性化定制。

Phenotype Biolog Metabolic fingerprinting Microplate assays Susceptibility testing