研究聚焦肠道菌群介导的组织间交互调节与人类健康，内容涉及肠道菌群与宿主营养代谢交互调节机理在代谢性疾病中的作用机制和转化应用。形成了“基础研究-技术转化-临床应用”的全链条创新体系。在基础研究层面，团队聚焦肠道菌群结构与功能解析、微生物组大数据分析技术开发，通过多组学方法揭示微生物与宿主互作机制；在临床研究方面，重点探索肠道菌群干预策略（如益生菌）对代谢性疾病（肥胖、糖尿病）和胃肠道疾病（如溃疡性结肠炎）的临床应用；在转化应用领域，推动基于微生物发酵技术和合成生物技术在生物制造和健康产品的开发和应用。团队通过整合生理学、生物信息学与临床医学，实现了从微生物和宿主以及从基础理论到临床实践的有效转化。