过去的一年里，全球肠道领域的研究成果颇丰，取得了许多令人瞩目的进展。2025年肠道大会之际，我们基于《热心肠日报》中收录的2024年5月以来的一年期间（2024年5月1日至2025年4月30日）发表的肠道相关领域论文，进行了多维度评选，形成了《热心肠日报》2024-2025年度榜单。
此次榜单评选涵盖了3294篇发表在320个不同期刊上的研究文献，累计影响因子达到66503.6，平均影响因子为20.2。其中，发表在Cell、Nature、Science上的文章有193篇，发表在医学顶刊NEJM、Lancet、JAMA、BMJ上的文章有54篇。
本榜单仅代表热心肠研究院基于自身数据所做的优选，可能存在主观因素干扰等不足，仅供参考。欢迎在文末留言提出批评、建议和意见。
哈佛大学
2024-2025代表性文章
Spatially restricted immune and microbiota-driven adaptation of the gut
Nature. 2024 Nov 20.
doi: 10.1038/s41586-024-08216-z.
【日报解读】Nature：肠道免疫与微生物群如何协同塑造肠道空间适应性
Gut bacteria convert glucocorticoids into progestins in the presence of hydrogen gas
Cell. 2024 May 24.
doi: 10.1016/j.cell.2024.05.005.
【日报解读】Cell：肠菌如何将糖皮质激素转化为孕激素
Functional diversification of dietary plant small molecules by the gut microbiome
Cell. 2025 Mar 07.
doi: 10.1016/j.cell.2025.01.045.
【日报解读】Cell：肠菌如何“解锁”植物小分子的健康效应
Highly multiplexed spatial transcriptomics in bacteria
Science. 2025 Jan 24.
doi: 10.1126/science.adr0932.
【日报解读】Science：新突破！细菌单细胞空间转录组学技术助力菌群研究
Commensal consortia decolonize Enterobacteriaceae via ecological control
Nature. 2024 Sep 18.
doi: 10.1038/s41586-024-07960-6.
【日报解读】Nature：18株共生菌组成的群落，有效去除肠杆菌科细菌定植
RELMβ sets the threshold for microbiome-dependent oral tolerance
Nature. 2025 Jan 22.
doi: 10.1038/s41586-024-08440-7.
【日报解读】Nature：RELMβ调节菌群，影响食物过敏
斯坦福大学
2024-2025代表性文章
Nature. 2024 Sep 25.
doi: 10.1038/s41586-024-07970-4.
【日报解读】Nature：细菌通过基因内部翻转机制扩充编码能力
Brief antibiotic use drives human gut bacteria towards low-cost resistance
Nature. 2025 Apr 23.
doi: 10.1038/s41586-025-08781-x.
【日报解读】Nature：短期抗生素用药，让肠菌获得怎样的持久耐药“超能力”？
Viroid-like colonists of human microbiomes
Cell. 2024 Oct 30.
doi: 10.1016/j.cell.2024.09.033.
【日报解读】Cell：“方尖碑”RNA元件——人体微生物组中的神秘定居者
Genome-scale resources in the infant gut symbiont Bifidobacterium breve reveal genetic determinants of colonization and host-microbe interactions
Cell. 2025 Mar 10.
doi: 10.1016/j.cell.2025.02.010.
【日报解读】Cell：大规模基因组资源，揭示短双歧杆菌的定植与功能奥秘
Expanding the human gut microbiome atlas of Africa
Nature. 2025 Jan 29.
doi: 10.1038/s41586-024-08485-8.
【日报解读】Nature：最大规模非洲人类肠道微生物研究AWI-Gen2
Mining human microbiomes reveals an untapped source of peptide antibiotics
Cell. 2024 Aug 19.
doi: 10.1016/j.cell.2024.07.027.
【日报解读】Cell：从人类微生物组中挖掘小可读框抗菌肽
欧洲分子生物学实验室
2024-2025代表性文章
Nature. 2024 May 01.
doi: 10.1038/s41586-024-07336-w.
【日报解读】Nature：准爸爸肠道菌群失调，可影响孕妈和后代健康
Gut microbiota carcinogen metabolism causes distal tissue tumours
Nature. 2024 Jul 31.
doi: 10.1038/s41586-024-07754-w.
【日报解读】Nature：化学致癌物促癌症，肠菌代谢作用或是关键
Emergence of community behaviors in the gut microbiota upon drug treatment
Cell. 2024 Sep 24.
doi: 10.1016/j.cell.2024.08.037.
【日报解读】Cell：药物治疗时肠道菌群涌现出的群落行为
Fecal microbial load is a major determinant of gut microbiome variation and a confounder for disease associations
Cell. 2024 Nov 14.
doi: 10.1016/j.cell.2024.10.022.
【日报解读】Cell：肠道微生物负荷——疾病与肠菌关联中的重要混杂因素
中国科学院系统
2024-2025代表性文章
Cell. 2024 Sep 25.
doi: 10.1016/j.cell.2024.08.008.
【日报解读】Cell：解析3500年前的奶制品，揭示人类与乳酸菌的演化互动
An ancient ecospecies of Helicobacter pylori
Nature. 2024 Oct 16.
doi: 10.1038/s41586-024-07991-z.
【日报解读】Nature：古老幽门螺杆菌——人类胃中的隐秘生态种
A genomic compendium of cultivated human gut fungi characterizes the gut mycobiome and its relevance to common diseases
Cell. 2024 May 21.
doi: 10.1016/j.cell.2024.04.043.
【日报解读】Cell：迄今最大的人类肠道真菌参考基因组目录
Osteoarthritis treatment via the GLP-1–mediated gut-joint axis targets intestinal FXR signaling
Science. 2025 Apr 04.
doi: 10.1126/science.adt0548.
【日报解读】Science：肠-关节轴新机制！肠菌及其代谢物如何改善骨关节炎？
特伦托大学
2024-2025代表性文章
Cell. 2024 Jul 8.
doi: 10.1016/j.cell.2024.06.018.
【日报解读】Cell："寄生"肠道的芽囊原虫，或是饮食与心血管健康的标志？
Unexplored microbial diversity from 2,500 food metagenomes and links with the human microbiome
Cell. 2024 Aug 29.
doi: 10.1016/j.cell.2024.07.039.
【日报解读】Cell：大规模新资源，拓展食品微生物组研究新知
Global genetic diversity of human gut microbiome species is related to geographic location and host health
Cell. 2025 Apr 30.
doi: 10.1016/j.cell.2025.04.014.
【日报解读】Cell：3.2万样本！绘制全球人类肠菌物种的菌株"家谱树"，拓展菌群和健康新视角
Human microbiome acquisition and transmission
Nat Rev Microbiol. 2025 Mar 21.
doi: 10.1038/s41579-025-01166-x.
【日报解读】Nature Reviews：人类微生物组有哪些来源？如何传播？（综述）
