过去的一年里，全球肠道领域的研究成果颇丰，取得了许多令人瞩目的进展。2025年肠道大会之际，我们基于《热心肠日报》中收录的2024年5月以来的一年期间（2024年5月1日至2025年4月30日）发表的肠道相关领域论文，进行了多维度评选，形成了《热心肠日报》2024-2025年度榜单。
此次榜单评选涵盖了3294篇发表在320个不同期刊上的研究文献，累计影响因子达到66503.6，平均影响因子为20.2。其中，发表在Cell、Nature、Science上的文章有193篇，发表在医学顶刊NEJM、Lancet、JAMA、BMJ上的文章有54篇。
本榜单仅代表热心肠研究院基于自身数据所做的优选，可能存在主观因素干扰等不足，仅供参考。欢迎在文末留言提出批评、建议和意见。
Ami S. Bhatt
斯坦福大学
Ami S. Bhatt 教授是一位在微生物组学、微生物基因组学和宿主-微生物相互作用领域具有开创性贡献的科学家，尤其在利用宏基因组学方法理解血液恶性肿瘤患者的微生物组以及发现新型抗生素方面取得了显著成就。她的工作不仅推动了基础科学研究，也为临床转化和全球健康事业做出了贡献。
2024-2025代表性文章
Intragenic DNA inversions expand bacterial coding capacity
Nature. 2024 Sep 25.
doi: 10.1038/s41586-024-07970-4.
【日报解读】Nature：细菌通过基因内部翻转机制扩充编码能力
Expanding the human gut microbiome atlas of Africa
Nature. 2025 Jan 29.
doi: 10.1038/s41586-024-08485-8.
【日报解读】Nature：最大规模非洲人类肠道微生物研究AWI-Gen2
Mining human microbiomes reveals an untapped source of peptide antibiotics
Cell. 2024 Aug 19.
doi: 10.1016/j.cell.2024.07.027.
【日报解读】Cell：从人类微生物组中挖掘小可读框抗菌肽
Sequencing-based analysis of microbiomes
Nat Rev Genet. 2024 Jun 25.
doi: 10.1038/s41576-024-00746-6.
【日报解读】Nature Reviews：一文读懂基于测序的微生物组分析方法（综述）
Peer Bork
欧洲分子生物学实验室
亥姆霍兹协会-柏林马克斯·德尔布吕克中心
马克斯·德尔布吕克分子医学中心
Peer Bork教授是一位杰出的德国生物信息学家，在计算生物学和系统生物学领域做出了开创性贡献。他的主要研究方向包括：微生物组学与宏基因组学、网络生物学与系统生物学、肿瘤生物信息学、蛋白质组学与进化基因组学。他与团队建立了多种高效可扩展的生物信息学平台和数据库，极大地推动了微生物组与网络生物学研究的普及，并率先将系统生物学方法应用于人类健康与疾病研究，尤其是在揭示微生物组与宿主相互作用及肿瘤生物学机制方面具有深远影响。
2024-2025代表性文章
Fecal microbial load is a major determinant of gut microbiome variation and a confounder for disease associations
Cell. 2024 Nov 13.
doi: 10.1016/j.cell.2024.10.022.
【日报解读】 Cell：肠道微生物负荷——疾病与肠菌关联中的重要混杂因素
Emergence of community behaviors in the gut microbiota upon drug treatment
Cell. 2024 Sep 24.
doi: 10.1016/j.cell.2024.08.037.
【日报解读】Cell：药物治疗时肠道菌群涌现出的群落行为
Andrew L. Goodman
耶鲁大学医学院
Andrew L. Goodman教授的研究集中在人类肠道微生物组对健康、疾病及药物疗效的影响，通过微生物遗传学、无菌动物模型和代谢组学等手段，阐明肠道菌群如何代谢药物、调控宿主免疫及抵御病原体感染。此外，他还探索菌群内的竞争与合作机制，揭示菌群结构变化与疾病易感性的关系，为精准医学和新型疗法开发提供了重要基础。
2024-2025代表性文章
Microbial transformation of dietary xenobiotics shapes gut microbiome composition
Cell. 2024 Sep 24.
doi: 10.1016/j.cell.2024.08.038.
【日报解读】Cell：微生物对膳食异生物质的转化，塑造肠道菌群组成
A human gut bacterium antagonizes neighboring bacteria by altering their protein-folding ability
Cell Host Microbe. 2025 Feb 4.
doi: 10.1016/j.chom.2025.01.008.
【日报解读】Cell子刊：一种人类肠道细菌通过改变邻近细菌的蛋白质折叠能力来对抗它们
Activity of GPCR-targeted drugs influenced by human gut microbiota metabolism
Nat Chem. 2025 Apr 3.
doi: 10.1038/s41557-025-01789-w.
【日报解读】Nature子刊：菌群"药剂师"如何"加工"GPCR靶向药物？
Seth Rakoff-Nahoum
波士顿儿童医院
Seth Rakoff-Nahoum教授的主要研究领域和贡献集中在宿主相关菌群的全面理解，特别是在不同生物组织水平上，从基因到分子，再到生物体和生态系统，并确定其中的因果关系。 他的研究旨在揭示微生物如何与宿主、环境以及彼此相互作用，并关注菌群在健康和疾病中的作用，尤其是儿科人群。
2024-2025代表性文章
Functional diversification of dietary plant small molecules by the gut microbiome
Cell. 2025 Mar 7.
doi: 10.1016/j.cell.2025.01.045.
【日报解读】Cell：肠菌如何“解锁”植物小分子的健康效应
RELMβ sets the threshold for microbiome-dependent oral tolerance
Nature. 2025 Jan 22.
doi: 10.1038/s41586-024-08440-7.
【日报解读】Nature：RELMβ调节菌群，影响食物过敏
June L. Round
犹他大学医学院
June L. Round教授的研究聚焦肠道共生微生物与宿主免疫系统之间的互作机制，不仅研究细菌、真菌和病毒等多种微生物如何通过调节抗体及调节性T细胞等免疫途径维持肠道稳态，还深入探讨这些微生物在代谢疾病（如肥胖、胰岛素抵抗）、炎症性肠病及结直肠癌以及神经代谢紊乱等多种疾病中的因果关系，为基于微生物的精准治疗提供了重要见解，并推动了肠道菌群在疾病预防和治疗中的转化应用。
2024-2025代表性文章
Neonatal fungi promote lifelong metabolic health through macrophage-dependent β cell development
Science. 2025 Mar 7.
doi: 10.1126/science.adn0953.
【日报解读】Science：促β细胞发育的生命早期肠道真菌，开启防治糖尿病新视角
Clec12a controls colitis by tempering inflammation and restricting expansion of specific commensals
Cell Host Microbe. 2025 Jan 8.
doi: 10.1016/j.chom.2024.12.009.
【日报解读】Cell子刊：免疫受体Clec12a控制菌群和炎症，调节结肠炎
Intestinal fungal-host interactions in promoting and maintaining health
Cell Host Microbe. 2024 Oct 9.
doi: 10.1016/j.chom.2024.09.010.
【日报解读】Cell子刊：肠道真菌-宿主的相互作用（综述）
Nicola Segata
特伦托大学
欧洲肿瘤研究所
伦敦国王学院
Nicola Segata教授的研究领域主要集中在人类微生物组研究和计算生物学。他尤其关注利用宏基因组学、机器学习和微生物基因组学方法，对微生物群落进行高分辨率的分析，包括功能和系统发育分析，以及探索饮食等因素对肠道微生物组的影响。
2024-2025代表性文章
Unexplored microbial diversity from 2,500 food metagenomes and links with the human microbiome
Cell. 2024 Aug 29.
doi: 10.1016/j.cell.2024.07.039.
【日报解读】Cell：大规模新资源，拓展食品微生物组研究新知
Global genetic structure of human gut microbiome species is related to geographic location and host health
Cell. 2025 Apr 30.
doi: 10.1016/j.cell.2025.04.014.
【日报解读】Cell：3.2万样本！绘制全球人类肠菌物种的菌株"家谱树"，拓展菌群和健康新视角
Intestinal Blastocystis is linked to healthier diets and more favorable cardiometabolic outcomes in 56,989 individuals from 32 countries
Cell. 2024 Jul 8.
doi: 10.1016/j.cell.2024.06.018.
【日报解读】Cell："寄生"肠道的芽囊原虫，或是饮食与心血管健康的标志？
Coffee consumption is associated with intestinal Lawsonibacter asaccharolyticus abundance and prevalence across multiple cohorts
Nat Microbiol. 2024 Nov 18.
doi: 10.1038/s41564-024-01858-9.
【日报解读】Nature子刊：咖啡消费与肠道微生物群的关联在不同人群中高度重复
Gut microbiome signatures of vegan, vegetarian and omnivore diets and associated health outcomes across 21,561 individuals
Nat Microbiol. 2025 Jan 6.
doi: 10.1038/s41564-024-01870-z.
【日报解读】Nature子刊：饮食如何塑造人类肠道微生物组？
Paternal and induced gut microbiota seeding complement mother-to-infant transmission
Cell Host Microbe. 2024 Jun 12.
doi: 10.1016/j.chom.2024.05.004.
【日报解读】Cell子刊：父亲与母亲共同塑造新生儿肠道菌群
Birthmode and environment-dependent microbiota transmission dynamics are complemented by breastfeeding during the first year
Cell Host Microbe. 2024 Jun 12.
doi: 10.1016/j.chom.2024.05.005.
【日报解读】Cell子刊：分娩环境和母乳喂养共同塑造婴儿菌群
Human microbiome acquisition and transmission
Nat Rev Microbiol. 2025 Mar 21.
doi: 10.1038/s41579-025-01166-x.
【日报解读】Nature Reviews：人类微生物组有哪些来源？如何传播？（综述）
Ramnik J. Xavier
麻省理工学院和哈佛大学博德研究所
麻省总医院及哈佛医学院
Ramnik J. Xavier教授是肠道免疫学与肠道微生物组领域的国际知名学者，致力于整合临床与基础研究以推动消化系统疾病领域的发展。通过多学科的交叉协作，他与团队不仅在基础研究层面取得了突破，还推动了多种基于遗传与微生物组信息的临床转化策略，为炎症性肠病和其他免疫相关疾病的诊断与治疗提供了新的思路和靶点。
2024-2025代表性文章
Spatially restricted immune and microbiota-driven adaptation of the gut
Nature. 2024 Nov 20.
doi: 10.1038/s41586-024-08216-z.
【日报解读】Nature：肠道免疫与微生物群如何协同塑造肠道空间适应性
Commensal consortia decolonize Enterobacteriaceae via ecological control
Nature. 2024 Sep 18.
doi: 10.1038/s41586-024-07960-6.
【日报解读】Nature：18株共生菌组成的群落，有效去除肠杆菌科细菌定植
赵立平
上海交通大学
罗格斯大学
赵立平教授的研究聚焦肠道菌群与宿主健康的相互作用，利用分子与基因组工具揭示饮食、微生物与慢性疾病（如肥胖、糖尿病等代谢性疾病）之间的关系和机制。他特别将生态学概念应用于肠道菌群研究，通过识别核心功能群和揭示其动态，为理解肠道菌群与人类健康和疾病的复杂关系，提供了深刻的洞察，为精准微生态干预提供新范式。
2024-2025代表性文章
A core microbiome signature as an indicator of health
Cell. 2024 Oct 07.
doi:10.1016/j.cell.2024.09.019.
【日报解读】Cell：人类肠道两大核心菌群
Guild-based approach for mitigating information loss and distortion issues in microbiome analysis
J Clin Invest. 2024 Sep 3.
doi: 10.1172/JCI185395.
【日报解读】应对菌群分析中的信息丢失和失真问题，基于功能群的分析方法或可破局
Michael Zimmermann
欧洲分子生物学实验室
Michael Zimmermann教授的研究聚焦宿主-微生物组之间的代谢相互作用，通过深入理解肠道微生物组在分子层面的代谢活动，揭示微生物组对人类健康和疾病——特别是药物代谢和致癌物毒性的影响。
2024-2025代表性文章
Gut microbiota carcinogen metabolism causes distal tissue tumours
Nature. 2024 Jul 31.
doi: 10.1038/s41586-024-07754-w.
【日报解读】Nature：化学致癌物促癌症，肠菌代谢作用或是关键
Emergence of community behaviors in the gut microbiota upon drug treatment
Cell. 2024 Sep 24.
doi: 10.1016/j.cell.2024.08.037.
【日报解读】Cell：药物治疗时肠道菌群涌现出的群落行为
Laurence Zitvogel
古斯塔夫·鲁西癌症研究中心
巴黎萨克雷大学
法国国家健康与医学研究院
Laurence Zitvogel教授的主要研究领域集中于肿瘤免疫学和免疫疗法，她与团队在肠道微生物组与癌症免疫治疗的研究领域中做出了大量开创性工作。此外，她与团队在外泌体介导的癌症疫苗研究、抗癌微生物的发现以及基于生物标志物的诊断平台开发方面，也取得了突破性成果，大大推动了免疫治疗的临床与转化研究。
2024-2025代表性文章
Custom scoring based on ecological topology of gut microbiota associated with cancer immunotherapy outcome
Cell. 2024 Jun 20.
doi: 10.1016/j.cell.2024.05.029.
【日报解读】Cell：基于肠道菌群生态拓扑学的评分，预测癌症免疫治疗效果
Low-dose irradiation of the gut improves the efficacy of PD-L1 blockade in metastatic cancer patients
Cancer Cell. 2025 Mar 10.
doi: 10.1016/j.ccell.2025.02.010.
【日报解读】Cell子刊：肠道照一照，抗癌疗效好？低剂量放疗如何唤醒抗肿瘤免疫？
Impact of the ONCOBIOME network in cancer microbiome research
Nat Med. 2025 Apr 11.
doi: 10.1038/s41591-025-03608-8.
【日报解读】Nature子刊：ONCOBIOME——肠道菌群撬动肿瘤诊疗新局面（综述）
