过去的一年里，全球肠道领域的研究成果颇丰，取得了许多令人瞩目的进展。2025年肠道大会之际，我们基于《热心肠日报》中收录的2024年5月以来的一年期间（2024年5月1日至2025年4月30日）发表的肠道相关领域论文，进行了多维度评选，形成了《热心肠日报》2024-2025年度榜单。
此次榜单评选涵盖了3294篇发表在320个不同期刊上的研究文献，累计影响因子达到66503.6，平均影响因子为20.2。其中，发表在Cell、Nature、Science上的文章有193篇，发表在医学顶刊NEJM、Lancet、JAMA、BMJ上的文章有54篇。
本榜单仅代表热心肠研究院基于自身数据所做的优选，可能存在主观因素干扰等不足，仅供参考。欢迎在文末留言提出批评、建议和意见。
Lancet[IF:88.5]
① 1本综述全面概述了结直肠癌的临床进展，涵盖了生物学知识、治疗选择和生存率提高等方面；② 尽管在高收入经济体中平均年龄发病率有所下降，结直肠癌仍是全球第三大常见癌症，新兴经济体中的发病率正在上升，50岁以下的早发型结直肠癌日益成为全球关注的焦点；③ 研究进展促进了对结直肠癌生物学的理解，增加了治疗选择，提高了总体生存率，这些成就归功于有效的系统治疗、改进的治疗选择和扩展的局部区域手术选择；④ 目前的研究重点包括括约肌保存、针对分子改变的精准肿瘤学、循环肿瘤DNA的使用、肠道微生物组的分析以及局部区域策略在结直肠癌肝转移中的作用。
Colorectal cancer
2024-06-20 , doi: 10.1016/S0140-6736(24)00360-X
New England Journal of Medicine[IF:78.5]
① 核心主题概述：食物和营养不安全对全球健康的影响及其驱动因素、评估与干预措施。② 定义与驱动因素：联合国粮农组织（FAO）定义食物和营养安全需满足能量充足、营养均衡，但两者为独立概念；政治冲突、气候变化、经济不平等是主要驱动因素。③ 流行病学现状：2023年全球约23亿人面临中重度食物不安全，低收入国家超60%人口受影响，高收入国家内部存在显著收入不平等导致的差异。④ 健康影响路径：营养不足引发发育迟缓、慢性病；心理压力激活应激反应导致代谢紊乱；行为层面迫使医疗资源削减，加剧疾病恶化。⑤ 高危人群特征：孕妇、儿童、老年人、女性主导家庭、原住民及边缘化群体风险更高，营养不安全与种族歧视、性别暴力等结构性暴力高度关联。⑥ 干预策略框架：需结合营养特异性（如食品援助）与敏感干预（如经济支持、教育普及），医疗机构应筛查并转介“食物作为药物”等项目。⑦ 政策倡导方向：呼吁政府保障食物权，推动气候政策、农业转型、最低工资立法及健康食品减税，构建可持续食物系统以消除结构性不平等。
Effects of Food and Nutrition Insecurity on Global Health
02-13 , doi: 10.1056/NEJMra2406458
New England Journal of Medicine[IF:78.5]
① 肠内营养在住院成人中的应用：肠内营养通过鼻胃管或鼻肠管为无法经口摄取足够营养的患者提供必需营养，是治疗疾病相关营养不良的关键手段。② 营养不良普遍性及筛查：全球30%-45%住院成人存在营养不良，需通过标准化筛查工具（如MST、MUST）识别高风险患者，启动医疗营养治疗（MNT）。③ 标准化护理路径：MNT联合口服营养补充可提升能量和蛋白质摄入，降低不良结局风险，如EFFORT试验显示其使死亡率降低35%。④ ICU患者喂养策略：急性期低剂量喂养（<70%需求量）较全量喂养更安全，NUTRIREA-3试验显示高剂量营养（25kcal/kg/d）与ICU停留延长及并发症增加相关。⑤ 非危重患者证据有限：非ICU患者肠内营养使用率仅5%-5.2%，需进一步研究其在康复期的营养剂量及路径优化。⑥ 炎症与代谢机制：疾病相关炎症通过促炎细胞因子和应激反应抑制营养利用，GLIM标准将炎症作为诊断核心指标之一。⑦ 实践注意事项：需个体化选择喂管途径（如胃内或幽门后）、监测再喂养综合征，并采用ENFit连接器等安全措施减少并发症。
Enteral Nutrition in Hospitalized Adults
04-17 , doi: 10.1056/NEJMra2406954
British Medical Journal[IF:42.7]
① 研究对象与方法：论文系统综述2013-2023年非药物治疗IBS的临床证据，纳入992篇文献经严格筛选，聚焦饮食、脑肠行为疗法及新兴技术等干预措施。② 核心发现与结论：低FODMAP饮食、脑肠行为干预（如催眠/认知行为疗法）是IBS标准疗法，但存在实施难度；新兴疗法如数字心理治疗和肠道吸附剂显示潜力，而粪菌移植缺乏足够证据。③ 饮食疗法核心：低FODMAP饮食需专业指导，可改善症状但需避免长期限制导致营养缺乏；可溶性纤维（如车前子）优于不可溶纤维，益生菌证据不足且不被指南推荐。④ 脑肠行为干预：认知行为疗法（CBT）和定向催眠对症状改善效果持久，但受制于资源不足；数字疗法（如APP）可提升可及性，疗效与面授相当。⑤ 补充疗法评估：薄荷油对腹痛有效但可能加重胃灼热，大麻素类药物缺乏证据；传统医学如中药方剂（如痛泻要方）在腹泻型IBS显示疗效但需更多研究。⑥ 新兴疗法进展：肠道吸附剂（如Enterosgel）对腹泻型IBS有效，迷走神经刺激和振动胶囊尚处探索阶段；虚拟现实疗法可改善患者心理状态但需更多临床验证。⑦ 挑战与建议：非药物治疗需个性化方案，需解决医疗资源分配、患者教育及经济负担问题，未来研究需标准化干预方案并优化真实世界应用。
Non-pharmaceutical treatments for irritable bowel syndrome
2024-12-16 , doi: 10.1136/bmj-2023-075777
Nature Reviews Clinical Oncology[IF:82.2]
① 本综述探讨了细菌在癌症免疫治疗中的潜在应用，揭示了细菌与肿瘤微环境的复杂相互作用，以及细菌如何被工程化用于癌症治疗；② 瘤内细菌以复杂的方式与癌细胞和肿瘤微环境成分相互作用，进而发挥促癌或抑癌作用，其效果取决于细菌菌种以及肿瘤和免疫系统的具体情况；③ 细菌介导的癌症免疫疗法（BCIT）可通过破坏细胞代谢、诱导细胞凋亡、递送治疗药物和增强抗癌免疫反应来诱导肿瘤消退；④ 新兴的BCIT策略利用先进的基因工程技术进行精确的基因调控和细菌表面修饰，以及开发生物杂交微机器人，以有效地和选择性地靶向肿瘤并输送治疗药物；⑤ 临床试验正在探索细菌在癌症治疗中的应用，包括利用改良细菌菌株和粪菌移植来改善患者对免疫疗法的应答，重点是安全性、有效性和最佳给药方法；⑥ BCIT面临的挑战包括解析作用机制、控制不良反应、确定最佳剂量、确保细菌产品安全性以及克服监管障碍。
Exploiting bacteria for cancer immunotherapy
2024-06-05 , doi: 10.1038/s41571-024-00908-9
Nature Reviews Clinical Oncology[IF:82.2]
① 这篇综述描述了在结直肠癌（CRC）患者中使用新辅助免疫检查点抑制剂治疗的最新支持性临床证据，并探讨了怎样通过临床研究（包括生物标志物）来改善疗效。② 在癌症转移的情况下，DNA错配修复缺陷和/或高微卫星不稳定性（dMMR/MSI-H）CRC对免疫检查点抑制剂（ICI）有很高的应答率；③ II期试验中，局部进展期dMMR/MSI-H CRC对ICI有显著反应，其验证试验正在进行中，因而在目前涉及直肠癌患者的试验中，器官保留已成为具有现实意义的目标，而结肠癌则面临更多挑战；④ 与dMMR/MSI-H CRC患者相比，DNA错配修复正常和/或微卫星稳定（pMMR/MSS）CRC患者对ICI往往应答较差，但ICI用于新辅助治疗时，部分患者有很好的应答；⑤ pMMR/MSS CRC具有生物学异质性，因此亟需鉴定新的预测性生物标志物来确定哪些患者能从当前的ICI中获得最大收益；⑥ 新辅助“机会窗口”试验旨在加速免疫治疗药物研发，并促进对治疗有/无应答的肿瘤的评估，帮助发现新的生物标志物。
Neoadjuvant immunotherapy for dMMR and pMMR colorectal cancers: therapeutic strategies and putative biomarkers of response
2024-09-24 , doi: 10.1038/s41571-024-00943-6
Nature Reviews Microbiology[IF:103.3]
① 大量研究揭示并构建了多种肠道-远端器官轴，如肠-肝轴、肠-脑轴等，最新的研究表明肠道与呼吸道存在双向互作，这篇综述对此进行了探讨；② 生命早期独立的肠道菌群和呼吸道菌群研究显示，两个黏膜系统都迅速被微生物定植，但由于其微环境条件不同，包括氧气水平、养分和pH值，进而影响其特定生态位菌群与本土免疫系统的互作和发育；③ 儿童慢性呼吸道疾病或与母亲在怀孕期间由于抗生素使用、感染疾病和营养不良等产生的菌群失调有关；④ 呼吸道病毒感染，包括甲流、呼吸道合胞病毒RSV和新冠可诱发胃肠炎症状，反之，肠道菌群失调增加呼吸道疾病易感性；⑤ 而越来越多的证据表明气道和肠道在肺癌及其治疗效果中起到重要的作用。
The gut-airway microbiome axis in health and respiratory diseases
2024-05-22 , doi: 10.1038/s41579-024-01048-8
Nature Reviews Microbiology[IF:103.3]
① 本文综述了饮食与肠道微生物群之间的相互作用，强调了不同饮食模式如何影响肠道微生物的组成和功能，进而对健康和疾病产生深远影响；② 地中海饮食、高膳食纤维饮食、植物性饮食、高蛋白饮食、生酮饮食和西式饮食等不同饮食模式对肠道微生物群有显著影响，从而可能预防或促进与饮食相关的疾病发展；③ 地中海饮食通过增加有益菌的数量，减少有害菌，改善肠道健康；④ 高膳食纤维饮食通过促进益生菌如Lactobacillus spp.和Bifidobacterium spp.的生长，增加短链脂肪酸的产生，有助于降低长期体重增加的风险；⑤ 植物性饮食富含多酚，可通过改变肠道微生物群的组成和功能，提供心血管保护作用，并具有抗炎和抗病原体特性；⑥ 需要进行更全面的研究，以更好地理解饮食、宿主和微生物之间的因果关系，进而发展精准营养和基于菌群的治疗方法。
The interplay between diet and the gut microbiome: implications for health and disease
2024-07-15 , doi: 10.1038/s41579-024-01068-4
Nature Reviews Microbiology[IF:103.3]
① 本综述探讨了口腔-肠道菌群轴在健康与疾病中的作用及其相互影响；② 尽管口腔和肠道在生理上有所不同，但它们之间存在直接联系，并且可以通过多种方式相互影响，例如口腔微生物能够到达并定植在胃肠道；③ 特别是在肠道菌群失调的情况下，口腔微生物更容易定植；④ 口腔微生物在引起或加剧其他器官疾病方面的作用尚未完全阐明；⑤ 最新进展表明，口腔和肠道菌群的相互作用与人类健康和疾病的关系密切，但具体的定植机制和作用机理需要进一步研究；⑥ 相关研究对于理解人体微生物群与健康的复杂关系具有重要意义。
The oral-gut microbiome axis in health and disease
2024-07-22 , doi: 10.1038/s41579-024-01075-5
Nature Reviews Microbiology[IF:103.3]
① 这篇综述探讨了细菌产生的具有致癌作用的小分子代谢物（活性氧和活性氮、毒素和基因毒素、吲哚功能化代谢物等），以及它们在胃肠道癌症发展中的作用机制；② 幽门螺杆菌通过产生活性氧和活性氮，以及分泌 VacA 和 CagA 毒素，促进胃癌发展；③ tilimycin、tilivalline 和 colibactin 等细菌毒素通过诱导细胞凋亡和 DNA 损伤，增加癌症风险，而 Shiga 毒素等蛋白质毒素可靶向非 DNA 组件，影响细胞功能和癌症发展；④ 吲哚和indolimines等代谢物通过激活 AhR，影响炎症、免疫和肿瘤发展；⑤ 具核梭杆菌可从口腔转移至肠道，通过 Fap2 和 FadA 等效应因子定植并促进结直肠癌发展。
Bacterial small molecule metabolites implicated in gastrointestinal cancer development
2024-10-07 , doi: 10.1038/s41579-024-01103-4
Nature Reviews Microbiology[IF:103.3]
① 本篇综述深入探讨了膳食纤维与肠道微生物组之间的相互作用，及其在肥胖、心血管代谢疾病和癌症中的潜在影响和机制；② 膳食纤维是预防多种慢性疾病的关键营养素，它们通过肠道微生物的发酵作用，可能调节肠道微生物生态和代谢，从而影响人体健康；③ 膳食纤维对特定细菌类群的影响因个体而异，其对微生物多样性的影响尚存在争议；④ 在肥胖及相关代谢紊乱的背景下，膳食纤维的干预研究表明，准确评估微生物组对于理解膳食纤维的不同反应至关重要；⑤ 流行病学研究证实高膳食纤维摄入量与多种癌症的发生率降低强烈相关，但需要进一步研究特定膳食纤维的干预对癌症风险、治疗效果和毒性以及癌症恶病质的影响；⑥ 文章总结了肠道微生物组如何介导膳食纤维在肥胖、心血管代谢疾病和癌症中的生理益处，这些疾病的发生与低膳食纤维摄入量明显相关。
The gut microbiome and dietary fibres: implications in obesity, cardiometabolic diseases and cancer
2024-10-10 , doi: 10.1038/s41579-024-01108-z
Nature Reviews Microbiology[IF:103.3]
① 本综述深入探讨了肠道菌群与大脑之间的双向通讯机制，揭示了它们如何通过多种生物化学和细胞介质相互影响；② 肠道菌群通过四个主要途径与中枢神经系统（CNS）进行交流，包括菌群衍生物穿过血脑屏障直接接触CNS、菌群激活免疫细胞分泌细胞因子影响CNS、菌群刺激肠内分泌细胞分泌激素进入大脑、菌群通过肠道外周传入神经传入CNS；③ 肠内分泌细胞（EEC）和肠道支配感觉神经元在肠粘膜屏障处共同形成一个复杂的感觉网络，能够感知和响应各种微生物结构和代谢物，包括色氨酸代谢物、微生物相关分子模式、短链脂肪酸和次级胆汁酸等；④ 肠道神经上皮界面上菌群与脑的互作模式包括两种，一种是局部调节（神经元释放神经肽诱导杯状细胞粘液分泌以维持菌群稳态、肠嗜铬细胞分泌5-羟色胺与肠道菌群进行信号交流），一种是远端调节（迷走神经运动神经元释放乙酰胆碱刺激Brunner腺分泌粘液促进共生微生物定植、交感神经传出纤维释放去甲肾上腺素进入肠道腔并直接作用于微生物）；⑤ 菌群-神经上皮信号在肥胖摄食、肠易激综合征 、神经退行性疾病、应激相关疾病和肠道炎症的发生发展中都起到重要作用；⑥ 这份综述为理解肠道菌群如何影响大脑功能提供了新的视角，对于开发治疗胃肠疾病和神经精神疾病的新型疗法具有重要意义。
Microbiota-neuroepithelial signalling across the gut-brain axis
01-02 , doi: 10.1038/s41579-024-01136-9
Nature Reviews Microbiology[IF:103.3]
① 炎症性肠病（IBD）与肠道微生物群密切相关，本综述探讨了细菌、真菌和病毒在IBD发病机制中的作用，并总结了基于微生物群的治疗策略；② IBD患者的肠道微生物群组成发生变化，表现为有益菌减少和致病菌增多，同时真菌（如白色念珠菌）和病毒的异常增殖也可能加剧炎症；③ 微生物代谢物（如短链脂肪酸和胆汁酸）在调节免疫反应和维持肠道稳态方面起关键作用，而某些细菌和真菌代谢物可能诱发炎症反应；④ 神经免疫相互作用是IBD发病的重要机制，微生物群能够通过影响神经系统调节炎症和疼痛感知；⑤ 目前的IBD微生物干预策略包括粪菌移植、饮食干预、益生菌/益生元以及基于生物技术的精准治疗，如噬菌体疗法和工程化微生物制剂；⑥ 肠道微生物群还可作为疾病状态和治疗反应预测的生物标志物；⑦ 未来研究需要整合多组学数据，探索跨界微生物相互作用（如细菌-真菌共生）对IBD的影响，并开发更精准的基于微生物群的个性化诊疗方法。
Microbiota in inflammatory bowel disease: mechanisms of disease and therapeutic opportunities
03-10 , doi: 10.1038/s41579-025-01163-0
Nature Reviews Immunology[IF:60.9]
① 本文综述了胆汁酸与肠道微生物群如何相互作用来调节宿主免疫反应，特别是在维持肠道稳态和疾病状态下的作用；② 胆汁酸通过其受体FXR和TGR5在多种细胞类型中调节基因表达，影响胆固醇和胆汁酸代谢，以及肠道屏障的完整性；③ 肠道微生物能够通过酶促反应改变胆汁酸的结构，产生具有不同生物活性的次级胆汁酸，这些次级胆汁酸通过与宿主受体相互作用，进一步影响免疫系统；④ 特定的次级胆汁酸可以促进调节性T细胞的分化，抑制Th17细胞的分化，从而有助于减轻炎症和自身免疫性疾病；⑤ 这些发现揭示了胆汁酸与肠道微生物群之间的复杂相互作用，为理解肠道免疫调节提供了新的视角，也为治疗炎症性肠病等疾病提供了潜在的新靶点。
How bile acids and the microbiota interact to shape host immunity
2024-07-15 , doi: 10.1038/s41577-024-01057-x
Nature Medicine[IF:50]
① 有关西方饮食与慢性疾病的研究表明，西方化饮食模式与全球非传染性疾病的上升趋势并行，特别是对心血管系统、全身代谢和肠道健康构成威胁；② 这种饮食模式通过减少膳食纤维摄入量并增加脂肪、糖和食品添加剂的摄入，导致肠道微生物多样性降低和慢性炎症，从而增加了肥胖、2型糖尿病、心血管疾病、肠道和肝脏疾病以及实体恶性肿瘤的风险；③ 医疗保健专业人员和社会必须对西方饮食的有害影响做出反应，以实现未来可持续的改变和改善结果；④ 为了应对西方饮食带来的挑战，需要采取多层面的行动，包括教育、政策制定和科学研究，以改善全球人口的长期健康状况。
Western diets and chronic diseases
2024-07-31 , doi: 10.1038/s41591-024-03165-6
Nature Medicine[IF:50]
① 论文主题：本文综述欧盟资助的ONCOBIOME网络在癌症微生物组研究中的突破性贡献，聚焦肠道菌群对癌症诊疗的调控机制与临床应用转化。② 研究框架构建：ONCOBIOME通过整合跨人群、癌症类型与分期的多组学数据，建立全球首个公开癌症微生物组资源库（含12,059份粪便样本），系统探索菌群通过肠道通透性、代谢及免疫应答影响癌症发生发展的机制。③ 诊断工具创新：开发基于肠道肿瘤微生物组特征（GOMS）的诊断体系，首创TOPOSCORE评分系统（含83种菌群互作组），通过定量PCR检测21种关键菌群实现低成本、高灵敏的菌群失调评估，并验证血浆sMAdCAM-1作为菌群失调的血清生物标志物。④ 机制解析突破：揭示特定菌属（如嗜黏蛋白阿克曼氏菌）通过激活Th1免疫应答改善非小细胞肺癌（NSCLC）免疫治疗预后，而Enterocloster通过下调MAdCAM-1促进免疫抑制性Tr17细胞迁移导致治疗抵抗；证实回肠菌群通过IL-1β/TH17通路调控结肠癌化疗敏感性。⑤ 临床干预策略：发起30余项菌群干预试验，包括粪菌移植（FMT）、阿克曼氏菌菌株活体疗法及膳食调节，证实FMT联合免疫检查点阻断（ICB）可使转移性黑色素瘤客观缓解率达65%，并推动抗生素使用指南优化以减少医源性菌群破坏。⑥ 理论范式革新：提出菌群失调应作为癌症标志性特征，建立菌群-免疫-癌症三方互作模型，揭示β肾上腺素能信号介导的“应激性回肠病变”促进全身免疫逃逸，为癌症防治提供新靶点。⑦ 学科生态建设：构建跨学科研究网络与数据平台（覆盖8国17个中心），推动微生物组分析标准化，并通过MetaPhlAn4等工具实现菌株水平精准解析，为免疫-肿瘤-微生物学领域奠定方法学基础。
Impact of the ONCOBIOME network in cancer microbiome research
04-11 , doi: 10.1038/s41591-025-03608-8
Nature Medicine[IF:50]
① 精准营养核心目标：精准营养通过整合多组学、数字工具与AI，优化针对代谢性疾病的个性化饮食建议，超越传统“一刀切”指南，应对个体间营养需求与代谢反应的差异。② 精准营养三大支柱：其框架包含：基于个体差异的定制化饮食建议、数字技术（如穿戴设备与APP）支持实时监测与反馈、结合行为心理学提升依从性，并以AI、行为科学、数据隐私保护等为支撑。③ 基因-环境互作机制：遗传变异（如因纽特人增强脂肪代谢的基因）与多基因风险评分可预测个体对特定饮食的响应差异，但现有研究显示基因与饮食的交互效应证据有限，需结合代谢与表型数据深化理解。④ 肠道微生物组作用：微生物组构成受饮食长期或短期影响，如地中海饮食促进有益菌种，其与宿主代谢的互作可指导个性化干预，但小肠微生物研究及动态适应性仍需更多数据支持。⑤ 临床转化挑战：短期研究难以验证长期有效性，现有临床试验显示个性化饮食对血糖或血脂的改善效果有限且易受干预强度干扰，需标准化设计与真实世界验证以提升可推广性。⑥ 现实世界应用难点：数字工具（如CGM与APP）虽提升依从性，但面临文化适配性、数据隐私及健康公平性问题，需通过社区合作（如瑞典MINISTOP项目）与全球倡议（如欧盟Precision Nutrition Challenge）推动包容性发展。⑦ 未来研究方向：需强化多组学与行为数据整合，开发可持续的环境友好型饮食方案，同时解决伦理与成本效益问题，以实现精准营养在慢性病防控中的规模化应用。
Precision nutrition for cardiometabolic diseases
04-30 , doi: 10.1038/s41591-025-03669-9
Chemical Reviews[IF:55.8]
① 研究主题概述：本综述聚焦口服给药策略在生物大分子（核酸和蛋白）递送中的机遇与挑战，旨在从基础研究到临床实践全景评估该领域进展及瓶颈。② 生理屏障挑战：胃肠道(GI)的胃酸(pH≈1.5–2.0)、酶(胃蛋白酶、胰蛋白酶等)、黏液层及上皮紧密连接共同造成核酸和蛋白在口服途径中易降解和吸收受限。③ 递送系统创新：聚合物和脂质纳米/微米粒子、多室和可植入微制造设备、植物细胞及微生物类生物灵感载体，通过pH‑响应、靶向配体等设计实现环境响应型保护与靶向释放。④ 应用前景展望：口服疫苗、口服免疫治疗、肿瘤治疗及代谢疾病（如糖尿病）干预显示出显著潜力，不仅可提高患者依从性，还能降低成本并扩大全球可及性。⑤ 转化实践难题：稳定性与生物活性保持、载体大规模生产与批次一致性、体内模型差异及严格的法规审批等因素对临床转化构成主要障碍。⑥ 未来发展方向：整合人工智能和高通量筛选优化载体设计，多组学解析肠道微环境交互，并探索新型生物启发材料以加速口服生物大分子疗法的临床落地。
Synthetic and Biogenic Materials for Oral Delivery of Biologics: From Bench to Bedside
04-01 , doi: 10.1021/acs.chemrev.4c00482
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:51]
① 本篇综述概述了目前对肠上皮细胞线粒体代谢、功能和信号传导影响组织稳态的理解，讨论了炎症性肠病和结直肠癌的线粒体靶向治疗方法以及线粒体损伤与疾病的前因后果；② 线粒体健康对于上皮屏障功能至关重要，包括细胞间连接、分泌的细胞外屏障（黏液和抗菌肽）以及诱导免疫耐受的共生微生物群；③ 线粒体产生的因子（线粒体活性氧和释放的线粒体DNA）会加剧组织损伤和病理反应；④ 参与线粒体功能和质量控制的基因突变与炎症性肠病有关，炎症性损伤导致炎症性肠病的线粒体功能障碍；⑤ 肠上皮细胞线粒体功能障碍抑制氧化磷酸化、提高氧水平、破坏黏膜氧梯度，导致为宿主上皮供能的厌氧菌的损失；⑥ 线粒体功能障碍与细胞类型的改变有关，这些改变在慢性损伤的情况下会引起结直肠肿瘤的发生，在结直肠癌晚期线粒体代谢促进了癌症的生长；⑦ 线粒体靶向治疗可以为基于基因突变、代谢或线粒体应激生物标志物的特定亚型患者提供双重治疗方法。
Mitochondrial function and gastrointestinal diseases
2024-05-13 , doi: 10.1038/s41575-024-00931-2
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:51]
① 本综述深入探讨了转移性结直肠癌（mCRC）的分子和细胞机制，以及影响其进化的原则；② 尽管癌症转移是结直肠癌（CRC）主要的致死原因，但其分子基础尚未得到充分阐明，这限制了治疗策略的发展；③ 研究数据表明，转移扩散所需的多数驱动事件在癌症早期就已发生，但是致癌基因和肿瘤抑制基因的突变会影响癌症转移的疾病进程；④ 肿瘤细胞的可塑性普遍存在且对转移进展至关重要，肿瘤细胞在转移扩散、复发、生长和治疗抵抗过程中采用不同的细胞状态；⑤ mCRC表现出免疫排除（肿瘤周围的免疫细胞无法有效浸润到肿瘤中）或免疫沙漠（肿瘤内和周围都缺乏免疫细胞）表型，暗示免疫系统在塑造mCRC中有重要作用，同一患者的不同转移瘤可能展现出不同的免疫环境；⑥ 目前还缺乏对转移瘤中免疫逃避机制的整体认识，新证据表明，不同器官的转移瘤利用不同的肿瘤微环境，并对免疫疗法有不同反应。
Mechanisms of metastatic colorectal cancer
2024-05-28 , doi: 10.1038/s41575-024-00934-z
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:51]
① 本文综述了肠道器官芯片技术的发展，其通过模拟人体肠道结构和功能，为疾病建模、个性化医疗提供了强大的工具；② 动物模型无法准确再现人类肠道疾病，因此迫切需要建立人类肠道生理和疾病状态模型，用于基础研究和药物开发应用；③ 器官芯片是一种微型装置，包含活细胞和组织及其围起的中空通道，可以再现活体器官中的组织-组织界面、动态流体流动、化学和氧气梯度以及机械信号；④ 用肠道特异性细胞形成的器官芯片能够再现人类肠道的发育、生理和疾病状态，这些都对生理蠕动样的机械运动非常敏感；⑤ 目前已有能复制区域特异性结构和功能的小肠和大肠器官芯片；⑥ 肠道器官芯片可经历动态流体流动，并能支持低氧梯度，因而可用于人类肠道细胞与复杂微生物组的共培养，以研究宿主与微生物组在体外的相互作用；⑦ 肠器官芯片为深入了解人类肠道生理和疾病机制、药物作用和毒性机制以及新型候选药物的鉴定提供了新的途径。
Intestinal organ chips for disease modelling and personalized medicine
2024-08-27 , doi: 10.1038/s41575-024-00968-3
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:51]
① 这篇综述探讨了饮食和代谢变化对肠道干细胞（ISCs）的影响，特别关注了在肠道肿瘤发生中的作用；② 肠道是一个高度特化、持续更新的组织，LGR5+ ISCs位于肠隐窝基部，能够生成所有成熟的肠上皮细胞系，并受到饮食、微量营养素和代谢产物的影响；③ 与成熟的分化细胞类型相比，LGR5+ ISCs表现出独特的代谢程序；④ 促肥胖的高脂饮食能通过多种机制增加LGR5+ ISCs自我更新，并可能通过相同机制促进肠道肿瘤发生，这些机制包括PPAR信号通路、脂肪酸氧化、神经酰胺产生、胆固醇依赖的膜重塑和胆汁酸池的改变；⑤ 饮食干预，如热量限制、间歇性禁食和生酮饮食，可增强干细胞功能，并通过增加克隆竞争和改变脂肪酸氧化，以及对酮体代谢的下游影响，可能对肠道肿瘤有益；⑥ 饮食不仅影响肠上皮，还广泛影响微生物组成、浸润免疫细胞和间充质细胞群等，进而影响肠干细胞的命运决定和屏障组成。
Dietary and metabolic effects on intestinal stem cells in health and disease
2024-10-02 , doi: 10.1038/s41575-024-00980-7
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:51]
① 这篇综述探讨了人类小肠微生物群（SIM）的特征、功能及其在健康和疾病中的作用；② SIM在生理特性上显著不同于结肠微生物群，具有较低的微生物多样性和生物量，其组成和功能随着小肠不同部位及进食-空腹周期动态变化；③ 小肠通过上皮屏障、黏液层、抗菌肽、分泌型IgA等抗体、胆汁酸抗菌作用、肠神经系统调节肠道运动等机制控制微生物群，保护宿主抵御微生物入侵、免受微生物代谢物的过度暴露；④ SIM代谢产物，包括胆汁酸和药物代谢产物，可影响全身代谢，其代谢活性具有个体化特征；⑤ 技术难点包括低生物量和难以采集样本等问题，限制了对健康个体SIM的研究，大部分数据来源于病理样本，可能存在偏倚；⑥ SIM失调与小肠细菌过度生长、功能性胃肠病、乳糜泻等多种疾病相关；⑦ SIM具有功能冗余性，尽管个体间微生物组成差异较大，但其整体代谢能力相似；⑧ 利用非侵入性技术，进一步揭示SIM的动态特性及其与宿主基因、饮食、药物的相互作用，是未来研究的重要方向。
Delving the depths of 'terra incognita' in the human intestine - the small intestinal microbiota
2024-10-23 , doi: 10.1038/s41575-024-01000-4
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:51]
① 本研究综述了克罗恩病中宿主与病原共生体的相互作用，揭示了特定病原体在遗传易感宿主体内引发疾病的关键作用；② 肠道微生物群落的组成和功能在克罗恩病中发生改变，克罗恩病患者的肠道中特定细菌（包括肠杆菌科成员）的增加是一个常见特征，但目前尚不清楚这种变化是导致炎症的原因还是仅仅是炎症的后果；③ 动物模型研究表明，特定共生体能够引起类似克罗恩病的结肠炎，这表明特定微生物和宿主基因突变共同作用可能导致疾病；④ 克罗恩病相关基因变异通常影响宿主机制，限制细菌共生体在肠道粘膜的存在，强调了宿主-微生物相互作用在疾病发病机制中的重要性；⑤ 研究还讨论了基于微生物组的干预措施在精准治疗策略中的潜在作用，包括粪菌移植和特定细菌群体的使用，以及针对病原体关键代谢途径的小分子抑制剂。
Host-pathobiont interactions in Crohn's disease
2024-10-24 , doi: 10.1038/s41575-024-00997-y
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:51]
① 这篇综述探讨了肠脑轴在内脏疼痛信号传导中的作用；② 内脏疼痛是与多种内脏疾病相关的重要临床问题，也是胃肠道疾病患者寻求医疗救助的主要原因之一。③ 源自背根神经节的感觉神经元支配着肠道，负责检测有害刺激并向中枢神经系统传递信号，这些信号被感知为疼痛；④ 胃肠道与神经系统之间的双向交流网络被称为肠-脑轴，这一网络在内脏疾病的疼痛介导中发挥关键作用；⑤ 免疫细胞、上皮细胞和肠道微生物群都与感觉神经元交流，这种交流可导致外周敏化并调节内脏疼痛过程；⑥ 非神经元细胞类型与神经元之间相互作用的失调，可导致胃肠道疾病中的内脏超敏反应，了解这些变化可为治疗内脏疼痛开辟新的治疗靶点。
The gut-brain axis and pain signalling mechanisms in the gastrointestinal tract
2024-11-22 , doi: 10.1038/s41575-024-01017-9
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:51]
① 这篇综述回顾了抗生素介导的肠道微生物群紊乱的证据，探讨了益生菌是否有助于恢复被抗生素破坏的微生物群；② 抗生素是治疗严重细菌感染的重要资源，但目前被过度使用，并可能造成伤害，包括对共生微生物群的破坏性影响；③ 几项荟萃分析表明，特定的益生菌可降低抗生素相关腹泻以及艰难梭菌相关腹泻的风险，目前尚无研究表明健康人使用抗生素后使用益生菌会产生临床危害，但需要对患者进行风险效益评估；④ 虽然低多样性的成人肠道微生物群与各种疾病相关，但较高多样性的微生物群与宿主健康并无因果关系，健康的微生物群应该既有弹性（能够抵御变化），又有适应性（能够应对变化）；⑤ 将多种微生物群指标（包括多样性和物种丰度）与宿主相关参数相结合来评估微生物群的恢复情况，可以减少单个微生物群分析方法固有的技术偏差；⑥ 衡量微生物组的恢复情况应包括评估抗生素耐药基因组；⑦ 目前的证据并不支持益生菌能使微生物群恢复到抗生素前状态的观点，有限的证据表明，某些益生菌可能会减轻抗生素对某些肠道细菌及其代谢终产物的影响，但也有有限的数据表明，特定的益生菌制剂可延缓受抗生素干扰的微生物群恢复。
Antibiotic-perturbed microbiota and the role of probiotics
2024-12-11 , doi: 10.1038/s41575-024-01023-x
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:51]
① 炎症性肠病（IBD）的治疗手段在不断发展，这篇综述总结了IBD治疗的各种干预方法；② 全面有效的IBD护理结合了药物治疗、外科手术和量身定制的生活方式调整，以全面满足患者的个性化需求；③ 目前，炎症性肠病的治疗选择包括一系列药物，如氨基水杨酸盐、皮质类固醇、免疫调节剂、生物制剂（抗TNF制剂、抗整合素、抗白介素）以及小分子药物（如JAK抑制剂和S1P调节剂）；④ 针对IBD的新兴疗法包括抗IL-23、JAK抑制剂、TL1A抑制剂和RIPK1抑制剂，这些疗法能够有针对性地缓解炎症，为IBD患者提供了更多选择；⑤ 非药物疗法，如戒烟、健康饮食、定期锻炼和心理健康支持，能够辅助药物治疗，改善疾病管理；⑥ 多学科护理在IBD管理中非常重要，专家之间的合作以及患者通过教育和共同决策积极参与，能够提高治疗的依从性、满意度和长期效果；⑦ 通过向患者提供可用的知识、自我管理工具和资源，能够增强患者的自主性，提高疾病控制的有效性。
Understanding the therapeutic toolkit for inflammatory bowel disease
01-31 , doi: 10.1038/s41575-024-01035-7
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:51]
① 核心话题概述：CAR-T细胞治疗胃肠癌的临床进展与挑战。② CAR-T设计与机制：CAR-T通过靶向肿瘤抗原激活T细胞，四代设计整合细胞因子分泌以增强抗肿瘤活性，需根据靶点调整信号域和亲和力。③ 临床试验进展：针对CEA、CLDN18.2、MESO等靶点的试验显示部分疗效，如CLDN18.2-CAR-T在胃癌中ORR达38.8%，但存在抗原异质性和脱靶毒性风险。④ 关键挑战分析：肿瘤微环境致密、免疫抑制及靶点缺乏特异性是主要障碍，CLDN6等肿瘤相关抗原虽具潜力但表达水平低且异质性强。⑤ 毒性管理策略：细胞因子释放综合征（CRS）和神经毒性通过IL-6抑制剂等管理，靶向HER2/EGFR的CAR-T引发肺毒性，需调整亲和力或局部给药降低风险。⑥ 未来改进方向：优化CAR设计（如CD28共刺激域）、联合放化疗预处理改造肿瘤微环境、开发双特异性CAR或“活体工厂”释放IL-12/IL-18以增强持久性。⑦ 个性化与安全性：需筛选肿瘤特异性抗原、监测抗原逃逸，并通过allo-CAR-T和逻辑门控设计平衡疗效与安全性，长期监测二次肿瘤风险。
CAR T cell therapies in gastrointestinal cancers: current clinical trials and strategies to overcome challenges
04-14 , doi: 10.1038/s41575-025-01062-y
Cell[IF:42.5]
① 本综述讨论了以能量平衡管理为目标的分子营养学的概念进展，包括新出现的膳食和药物干预及其与肠道微生物组的相互作用；② 地中海饮食、生酮饮食、热量限制和间歇性禁食等方法通过不同机制改善体重管理和代谢健康，这些饮食干预并不严格限制脂肪摄入；③ 新一代减重药物如GLP-1受体激动剂效果显著，其作用可能部分由肠道微生物组介导，但个体间反应差异需进一步研究；④ 肠道微生物组通过多种分子机制影响宿主能量平衡，例如短链脂肪酸和胆汁酸等菌群代谢物可发挥为宿主提供能量底物、调节食欲、影响热量消耗和脂肪储存等作用，因此需重新评估能量平衡范式，纳入肠道微生物组在能量摄入和消耗中的复杂作用，考虑基于宿主和微生物驱动的消化过程；⑤ 肠道微生物组研究对营养学提出新挑战，促使重新评估卡路里价值，考虑未吸收营养素和一般认为安全（GRAS）的成分（如甜味剂）对健康的影响，未来需整合微生物组数据制定精准饮食建议。
Digesting the complex metabolic effects of diet on the host and microbiome
2024-07-25 , doi: 10.1016/j.cell.2024.06.032
Science[IF:45.8]
① 本文综述了宿主如何通过各种机制控制微生物组，以及这些机制如何影响微生物组的生物学特性；② 宿主控制共生菌群的机制包括：免疫系统（如肠道IgA）、屏障功能（如黏液层）、生理稳态（如限氧、肠道形态）、肠道转运（如腹泻反应）和宿主行为（如规避腐烂食物）；③ 这些机制可以帮助宿主筛选有益的共生微生物、限制无益的微生物（伙伴选择），也可以通过改变微生物的行为和代谢使其变得对宿主有益（伙伴操纵），从而增加宿主从微生物组中获得的健康益处；④ 微生物的快速进化既是宿主控制的机遇（在宿主的选择压力下进化出有益特征），也是挑战（进化出逃避宿主控制的机制甚至产生致病性）；⑤ 宿主与微生物之间的这种动态平衡对理解微生物组的生物学和相关疾病具有重要意义，同时，宿主控制机制也可能成为改善健康的治疗靶点。
Host control of the microbiome: Mechanisms, evolution, and disease
2024-07-19 , doi: 10.1126/science.adi3338
