《热心肠日报》2022-2023榜单 | 30篇动物肠道必读论文

热心肠研究院榜单

热心肠小伙伴们 2023-05-18

本篇发布“30篇动物肠道必读论文”。

在过去的一年多时间里，全球肠道领域研究继续高歌猛进，取得了颇多令人瞩目的进展。

2023肠道大会来临之际，我们基于《热心肠日报》中收录的2022年5月以来一年期间发表的肠道相关领域论文，进行了多维度评选，形成了《热心肠日报》2022-2023年度榜单。

2022年度榜单参评的文章共有3388篇，发表在420个不同的期刊上，累计影响因子达到了82902.36，平均影响因子24.48。其中来自Cell、Nature、Science的文章133篇，来自NEJM、Lancet、JAMA的文章54篇。

本榜单仅代表热心肠研究院基于自身数据所做的优选，可能存在主观因素干扰等不足，仅供参考。欢迎在文末留言提出批评、建议和意见。

本篇发布“30篇动物肠道必读论文”。

提示：下述文章点击中文标题可直达热心肠日报，点击英文标题可访问论文官网。

浙大团队Cell：来自细菌的基因，竟能影响昆虫求偶行为？

Cell[IF:66.85]

① 纳入218个不同昆虫物种的基因组样本，发现1410个来自细菌、病毒、真菌与植物的水平基因转移（HGT）；② 其中近80%基因来自细菌，鳞翅目（蝴蝶与飞蛾）获得的HGT基因最多，平均每个物种拥有16个；③ HGT基因会伴随着昆虫适应性进化，避免被昆虫清除掉，达到“存活”目的；④ 敲除小菜蛾从李斯特菌属获得的1个HGT基因，发现突变体小菜蛾后代数目少约70%，但相关生长发育未受到影响；⑤ 行为学发现突变体雄虫对雌虫的求偶欲望显著地降低。

HGT is widespread in insects and contributes to male courtship in lepidopterans

2022-07-18, doi:10.1016/j.cell.2022.06.014

Nature子刊：碳利用能力不同的弯曲杆菌科如何共存？

Nature Microbiology[IF:30.964]

① 对7头奶牛瘤胃上皮微生物组进行元基因组和分离基因组分析，发现占主导地位的弯曲杆菌科谱系最近已分化成两个群体；② 这些过程导致了基因表达和酶域组成的差异，这些差异与利用乙酸盐（宿主的主要碳源）的能力相对应，其代价是受到丙酸盐的抑制；③ 这种竞争能力的权衡进一步表现为两个种群在体内的不同动力学变化；④ 该结果强调了最近的进化动态如何塑造瘤胃微生物组的关键功能作用。 Differential carbon utilization enables co-existence of recently speciated Campylobacteraceae in the cow rumen epithelial microbiome

2023-01-12, doi:10.1038/s41564-022-01300-y

胡圣伟+倪伟+陈同等：动物微生物组组成与功能综合数据库—CRAMdb

Nucleic Acids Research[IF:19.16]

① 建立了动物宏基因组领域首个跨宿主、跨样本位点和跨表型比较的综合数据库CRAMdb；② 该数据库整理、收集和统一标准分析了世界范围内动物微生物组相关数据，实现了不同物种、不同样本位点和不同表型背景下宿主与微生物关联性的交互查询和联合比较分析；③ 分析来自475个项目的516种动物的微生物组，涉及43个表型，构建了含9430种细菌、278种古菌、2216种真菌和458个病毒的数据库；④ 数据库包括两个主要模块内容，即微生物组成和微生物关联。 CRAMdb: a comprehensive database for composition and roles of microbiome in animals

2022-11-01, doi:10.1093/nar/gkac973

Nature子刊：群居狒狒的个性化肠道菌群

Nature Ecology & Evolution[IF:19.1]

① 对来自12个群体的600只狒狒在14年间的1.7万份粪便的16S数据进行分析；② 狒狒的肠道菌群结构变化具有季节性、周期性和高度个性化的规律；③ 尽管共享环境和饮食，但不同狒狒间的肠道菌群仅有微弱的同步性；④ 同一群体中的狒狒间比不同群体的狒狒具有更相似的肠道菌群，但同一狒狒的菌群相似性远超过不同狒狒；⑤ 宿主因素对菌群纵向动态的偏差解释度是所有群体共享因素（降雨量和温度等）的10倍，是群体内共享因素（饮食和活动范围等）的3倍。 Synchrony and idiosyncrasy in the gut microbiome of wild baboons

2022-06-02, doi:10.1038/s41559-022-01773-4

Nature子刊：肠道菌群影响蜜蜂的社交网络

Nature Ecology & Evolution[IF:19.1]

① 自动追踪9对各100只无菌工蜂（MD）和肠道菌群重组的工蜂（CL）的蜂群行为；② 相对于MD，CL个体间触角接触次数和专业化显著增加，其他交互行为、存活率及行为模式无差异；③ 菌群定植与大脑中1/3代谢物的丰度较高有关，如在突触传递和大脑能量功能中起作用的氨基酸、社交互动数量的重要预测因子等；④ 肠道菌群通过影响大脑转录过程（如与感官刺激感知有关的大脑区域的表观遗传修饰、氨基酸代谢等）以增加社交倾向。 The gut microbiota affects the social network of honeybees

2022-08-22, doi:10.1038/s41559-022-01840-w

王关红团队：宿主-菌群互作研究中的无菌和限菌技术（综述）

Trends in Microbiology[IF:18.23]

① 各种无菌和限菌昆虫饲养系统被建立用于揭示共生菌群和宿主互作，无菌饲养有助于揭示微生物群对昆虫多种行为特征的影响；② 从灭菌方式、无菌食物制作及限菌系统改良法等方面批判性地评价了近年来发展的饲养技术；③ 黑腹果蝇是第一个成功无菌繁殖的无脊椎动物，相关方法已扩展到蜜蜂、黄蜂和蚕等其他昆虫；④ 无菌昆虫系统的建立依赖于有效杀菌方法、提供无菌饮食和足够的营养，未来通过优化相关模型，将有助于阐明昆虫代谢机制和营养需求。 Axenic and gnotobiotic insect technologies in research on host–microbiota interactions

2023-03-09, doi:10.1016/j.tim.2023.02.007

鞠峰团队Nature子刊：从昆虫肠道中锁定降解塑料的微生物

Nature Communications[IF:17.694]

① 草地贪夜蛾幼虫能以聚氯乙烯（PVC）膜为食，伴随肠道菌群组成改变；② 从幼虫肠道中分离出一株克雷伯菌（EMBL-1），与栖异地克雷伯菌同源性99%，能解聚PVC并利用PVC作为唯一能量来源；③ 通过多组学分析，鉴定出EMBL-1中参与PVC生物降解的潜在基因和蛋白（涉及过氧化氢酶-过氧化物酶等多种酶），并推测出PVC生物降解途径（涉及对非生物因素的应答、胞外酶解聚、降解副产物的胞内代谢）；④ 酶学测定表明过氧化氢酶-过氧化物酶参与PVC解聚。 Polyvinyl chloride degradation by a bacterium isolated from the gut of insect larvae

2022-09-12, doi:10.1038/s41467-022-32903-y

Nature子刊：毛毛虫是优良的肠免疫研究模型

Nature Communications[IF:17.694]

① 烟草天蛾幼虫肠道可经常规诊断成像技术CT、MRT和OAT进行有效呈像，并可通过PET研究肠组织代谢过程；② 细菌或DSS可有效诱导该幼虫肠炎表征，并可以通过CT、MRI和PET进行高通量表型分析；③ 造模剂可导致该幼虫进行性肠损伤，庆大霉素抗菌治疗可有效缓解肠损伤，是良好的肠疾病模型；④ 该幼虫具有与哺乳动物肠道保守的NADPH双氧化酶DUOX，且与肠炎呈剂量依赖性关系；⑤ 该模型可用以高通量筛选DUOX激活剂，并可研究肠道宿主和病原菌的互作。 High-throughput screening of caterpillars as a platform to study host–microbe interactions and enteric immunity

2022-11-24, doi:10.1038/s41467-022-34865-7

Nature子刊：不同动物肠道古菌的研究

Nature Communications[IF:17.694]

① 分析了250种动物的341份肠道菌群样本，在175种动物中检测到古菌，并确定了五个主要类群；② 甲烷短杆菌属可能与宿主相关，而非产甲烷的奇古菌在动物中分布广泛，但丰度较低；③ 哺乳动物肠道古菌的多样性和丰度受宿主、饮食类型、纤维含量和肠道生理等因素的驱动，相比较于肠道细菌，古菌对这些因素更加敏感；④ 用H2还原甲基化合物的产甲烷古菌是产甲烷古菌的主要类群，该类群与以CO2还原型产甲烷古菌一样，显著受饮食和肠道细菌的影响。 Factors shaping the abundance and diversity of the gut archaeome across the animal kingdom

2022-06-10, doi:10.1038/s41467-022-31038-4

Nature子刊：101种海洋鱼类的菌群分析

Nature Communications[IF:17.694]

① 收集南加州的22个目、55个科、83个属的101中海洋鱼类（代表了当地约25%的海洋鱼类多样性），对鳃组织、体表粘液、中肠消化物及后肠消化物中的菌群进行分析；② 身体部位是菌群多样性的最大驱动因素，远洋鱼类的体表粘液菌群的生物量及多样性最低，中肠菌群的多样性最高；③ 鱼类有着最独特的菌群，92%的鱼类菌群不存在于两栖动物、爬行动物、鸟类及哺乳动物中；④ 哺乳动物的后肠菌群gamma多样性最高，鱼类最低。 Host biology, ecology and the environment influence microbial biomass and diversity in 101 marine fish species

2022-11-17, doi:10.1038/s41467-022-34557-2

中科院动物所：环境太拥挤，肠道菌群或会加速衰老进程？

Advanced Science[IF:17.521]

① 在实验室环境下设置不同的笼养密度处理组，发现高密度拥挤会显著增加血清皮质酮水平和田鼠社会压力、减少端粒长度、加速衰老过程和DNA损伤、缩短寿命；② 高密度组处理降低了有益菌种类和丰度，增加致病菌比例，改变肠道菌群组成，导致短链脂肪酸含量下降；③ 不同住宅密度的供体田鼠粪便菌群移植会引起受体田鼠出现类似的衰老相关过程；④ 通过高密度处理消除和补充丁酸可显著下调田鼠社群压力、抑制NF-κB和COX-2通路、缓解衰老相关过程。 Gut Microbiota is Associated with Aging-Related Processes of a Small Mammal Species under High-Density Crowding Stress

2023-03-25, doi:10.1002/advs.202205346

中科院：疫苗导致罗非鱼肠道菌群变化，进而改变肠道代谢

Microbiome[IF:16.837]

① 罗非鱼分别注射嗜水气单胞菌-维氏气单胞菌二联灭活疫苗或PBS作对照，收集血液、鳃、胃肠道黏膜及内容物；② 灭活疫苗对肠粘膜菌群结构和组成有显著影响，但对其他共生点菌群无显著影响；③ 与对照组相比，免疫组肠粘膜的潜在机会致病菌（如埃希氏志贺氏菌属）相对丰度显著降低，肠道碳水化合物相关代谢物（如乳酸、琥珀酸）浓度显著增加，而多种脂质相关代谢物浓度显著降低；④ 大多数肠道差异菌群（如肠弧菌属）与肠道差异代谢物显著相关。 Significant alterations of intestinal symbiotic microbiota induced by intraperitoneal vaccination mediate changes in intestinal metabolism of NEW Genetically Improved Farmed Tilapia (NEW GIFT, Oreochromis niloticus)

2022-12-12, doi:10.1186/s40168-022-01409-6

郑浩+张雪等：我国蜜蜂肠道中耐药组分布规律及传播机制

Microbiome[IF:16.837]

① 纳入全国14个省市94份东方蜜蜂和吉林省32份西方蜜蜂肠道样本，探究其肠道中抗生素抗性基因（ARG）组成和多样性；② 相比于地理分布，ARG组成与宿主物种更相关，且西方蜜蜂肠道中ARG含量更高；③ 发现6组核心ARG在中华蜜蜂中普遍存在，主要由肠道物种Gilliamella和Snodgrassella携带；④ strA和sul2基因在蜜蜂肠道中广泛存在，并形成了与IncQ质粒高度同源的片段；⑤ 可移动IncQ质粒可在蜜蜂肠道共生体间转移，促进ARG在肠道不同细菌中广泛传播。 Geographical resistome profiling in the honeybee microbiome reveals resistance gene transfer conferred by mobilizable plasmids

2022-05-03, doi:10.1186/s40168-022-01268-1

浙江大学：脂肪过度分解的围产期奶牛免疫功能受损，或与肠道菌群有关

Microbiome[IF:16.837]

① 围产期奶牛中，过度脂肪分解（HNF）影响产后生理状态，与免疫细胞中功能下调有关；② HNF过程激活了奶牛肠道菌群中次级胆汁酸（SBA）的生物合成途径，粪便中SBA水平增加；③ HNF导致奶牛与细胞迁移吞噬、对细胞因子和病毒的反应相关的单核细胞功能下降，或与血浆中共轭胆汁酸浓度降低导致表达GPBAR1的单核细胞的免疫抑制有关；④ 肠道中拟杆菌OF04−15BH、Paraprevotella clara、Paraprevotella xylaniphila、密螺旋体属JC4与SBA合成有关。 Gut microbiome is linked to functions of peripheral immune cells in transition cows during excessive lipolysis

2023-03-03, doi:10.1186/s40168-023-01492-3

赵圣国+王加启等：构建微球原位培养方法实现牛瘤胃重要尿素分解菌分离

Microbiome[IF:16.837]

① 研究人员建立了一种包括脲酶基因（ureC）引导富集加上原位琼脂糖微球包埋和瘤胃模拟条件下的培养分离方法，成功从瘤胃微生物组中分离尿素分解菌；② 共分离了404种独特的细菌菌株，选定52株进行基因组测序，基因组分析显示，28个菌株可分为12个物种，都含有脲酶基因；③ 此外，在新的分离株中发现了五种不同的脲酶基因簇组织，它们具有不同的水解尿素的方法；④ 同时鉴定了在脲酶活化中可能起关键调节作用的UreC蛋白的关键氨基酸残基。 Functional gene-guided enrichment plus in situ microsphere cultivation enables isolation of new crucial ureolytic bacteria from the rumen of cattle

2023-04-15, doi:10.1186/s40168-023-01510-4

张宏福等：粘蛋白O-聚糖-菌群轴可调控肠道稳态

Microbiome[IF:16.837]

① 腹泻导致仔猪菌群失调、结肠黏液层破坏变薄以及黏蛋白O-聚糖异常如酸性聚糖减少和结构无法延长，导致肠道微环境受损；② 腹泻发作、菌群改变和细菌易位，导致肠道上皮屏障完整性受损、炎症易感性增强以及轻度生长迟缓；③ 与健康仔猪相比，腹泻仔猪中NLRP3炎性小体激活，触发促炎因子IL-1β和IL-18释放，并抑制自噬小体形成如LC3A/B II减少和p62积累；④ 3-MA通过抑制自噬途径可显著降低杯状细胞中特异性基因的转录。 Mucin O-glycan-microbiota axis orchestrates gut homeostasis in a diarrheal pig model

2022-08-31, doi:10.1186/s40168-022-01326-8

印遇龙院士、尹佳等：猪奶中的潜在益生菌

Microbiome[IF:16.837]

① 部分母乳微生物可以在母乳喂养期间从母体垂直传递给后代；② 用培养组学大规模分离和鉴定猪奶细菌，共筛选出1240株分离菌，可归为271个非冗余细菌类群；③ 通过体外拮抗病原菌试验和果蝇百草枯模型抗氧化测试，筛选出一株戊糖片球菌SMM914；④ 给哺乳仔猪灌服SMM914，于断奶7天后采样，发现SMM914使结肠中的有益菌乳杆菌属/科的相对丰度显著增加，并激活仔猪肝脏中Nrf2-Keap1抗氧化信号通路，以及改善血浆中的氨基酸代谢和脂质代谢通路。 Antioxidant potential of Pediococcus pentosaceus strains from the sow milk bacterial collection in weaned piglets

2022-06-01, doi:10.1186/s40168-022-01278-z

西北农林科技大学：水稻-鱼类共生如何影响罗非鱼的肌肉营养、肠道菌群及肝脏代谢

Microbiome[IF:16.837]

① 对比水稻开花前后的稻田罗非鱼（aRT和bRT）和池塘罗非鱼（aTT和bTT）；② 相比池塘鱼，稻田鱼的体长、体重、肌肉总鲜味氨基酸、单不饱和脂肪酸含量显著增加，尤其是水稻开花后；③ 相比其他三组，bRT的肠道菌群多样性显著增加，拟杆菌门、厚壁菌门，拟杆菌属和Turicibacter属占优势，革兰氏阴性菌和耐胁迫细菌的相对丰度最高，潜在致病菌最低；④ 稻鱼共生改善罗非鱼的代谢谱，拟杆菌属与氨基酸、脂肪酸及脂质代谢相关的代谢产物呈正相关。 Rice flowering improves the muscle nutrient, intestinal microbiota diversity, and liver metabolism profiles of tilapia (Oreochromis niloticus) in rice-fish symbiosis

2022-12-16, doi:10.1186/s40168-022-01433-6

沈锡辉团队：探索瘤胃菌群中AI-2介导的种间通讯

Microbiome[IF:16.837]

① 分析981个瘤胃细菌基因组并鉴定15种群体感应（QS）相关基因；② 对QS相关基因丰度进行分析，发现680个细菌基因组包含自身诱导因子-2(AI-2)合成酶或受体编码基因；③ AI-2介导的瘤胃微生物之间的种内和种间交流在瘤胃中普遍存在；④ 含有dCache1的AI-2受体介导的QS过程对于植物降解、食物消化及宿主能量和营养所必需；⑤ 瘤胃微生物可能通过AI-2与细胞外传感器dCache1结构域结合，激活参与不同信号转导途径的相应受体，从而协调社会行为。 Exploring AI-2-mediated interspecies communications within rumen microbial communities

2022-10-07, doi:10.1186/s40168-022-01367-z

毛胜勇+刘军花：全面分析反刍动物胃肠道菌群的维生素B和K2生物合成

Microbiome[IF:16.837]

① 分析1.7万个反刍动物胃肠道微生物基因组，鉴定出参与维生素B族和K2生物合成的113万个基因、167种酶和2366个高质量基因组；② 维生素B族和K2合成主要由胃部菌群完成，大肠菌群也有贡献；③ 在2366个基因组中，近半数只能合成1种维生素，2.7%能合成≥5种维生素；④ 多数微生物消耗钴胺（编码钴胺转运蛋白或依赖性酶），少数有完整的钴胺合成途径；⑤ 高谷物日粮抑制瘤胃菌群的钴胺合成，但增强其他维生素合成，提示膳食纤维对钴胺合成的重要性。 Metagenomic insights into the microbe-mediated B and K2 vitamin biosynthesis in the gastrointestinal microbiome of ruminants

2022-07-21, doi:10.1186/s40168-022-01298-9

吉林农大：母鸡自产卵起，便影响着后代的肠道发育与免疫？

Microbiome[IF:16.837]

① 将486只蛋鸡分为对照组和营养干预组（CCAB），发现CCAB干预有利于母体免疫、卵孵化和后代生长；② CCAB组溶菌酶和禽β-防御素水平较高，卵泡中免疫球蛋白水平与母体血清正相关；③ CCAB组胚胎十二指肠、空肠和回肠绒毛高度和隐窝深度增大，后代肠道发育始于胚胎期；④ CCAB组膨大部双歧杆菌富集，母体菌群可从膨大部转移到胚胎肠道再到蛋清；⑤ 转录组分析发现多种与肠道发育和免疫相关的差异表达基因，胚胎肠道菌群与肠道基因表达和发育相关。 Maternal effects drive intestinal development beginning in the embryonic period on the basis of maternal immune and microbial transfer in chickens

2023-03-03, doi:10.1186/s40168-023-01490-5

华中农大：鸡空肠菌群可通过减轻肠道炎症改善生长性能

Microbiome[IF:16.837]

① 先前研究表明空肠菌群可改善鸡的生长性能，但是否通过减轻肠道炎症来发挥作用仍不清楚；② 7周龄的高体重鸡生长性能显著高于低体重鸡；③ 高体重鸡空肠的优势菌种为乳酸菌等革兰氏阳性菌，而低体重鸡以丛毛单胞菌属等革兰氏阴性菌为主；④ 低体重鸡血清中LPS、空肠中TLR4、MyD88及相关炎性因子表达水平均显著上调，导致肠屏障完整性受损；⑤ 将高体重成年鸡粪便菌群移植到1日龄雏鸡中，可重塑其空肠菌群、减轻炎症反应并提高生长性能。 Chicken jejunal microbiota improves growth performance by mitigating intestinal inflammation

2022-07-15, doi:10.1186/s40168-022-01299-8

华中农大：肠道真菌如何促进猪肠道上皮糖酵解？

Microbiome[IF:16.837]

① 使用内部转录间隔物（ITS）基因扩增子测序和宏基因组学研究了7个品种的56头断奶仔猪和56头肥育猪的肠道真菌群落；② 结果表明，在7个断奶仔猪品种中Kazachstania slooffiae是最丰富的肠道真菌种类；③ K.slooffie降低了肠上皮赖氨酸琥珀酰化水平，而这些蛋白质在糖酵解途径中尤其丰富；④ K.slooffie通过激活sirtuin 5（SIRT5）来降低的赖氨酸琥珀酰化，从而促进肠上皮糖酵解；⑤ K.slooffie的代谢产物5′-甲硫腺苷促进了SIRT5活性。 Core-predominant gut fungus Kazachstania slooffiae promotes intestinal epithelial glycolysis via lysine desuccinylation in pigs

2023-02-23, doi:10.1186/s40168-023-01468-3

国内团队：土源细菌或能赋予茶籽象更强的茶皂素抵抗能力

Microbiome[IF:16.837]

① 与水果相比，土壤微生物群是油茶害虫茶籽象肠道菌群的主要来源，其中不动杆菌属丰度较高；② 不动杆菌中茶皂素（油茶的一种防御性次级代谢物）降解相关代谢通路显著富集，体外实验确认不动杆菌具有降解茶皂素能力；③ 荧光标记实验证明，不动杆菌AS23菌株可以从土壤迁移到油茶象幼虫肠道中，赋予其降解茶皂素的能力，使其耐受油茶种子中的茶皂素从而能够在油茶种子中生存；④ 土壤来源的肠道菌群赋予了茶籽象更强的植物毒素耐受能力。 Soil-derived bacteria endow Camellia weevil with more ability to resist plant chemical defense

2022-06-25, doi:10.1186/s40168-022-01290-3

国内团队：滤食性牡蛎体内的病毒组具有明显的多样性和组织性

Microbiome[IF:16.837]

① 构建了一个牡蛎病毒组数据集，其中包含728784个非冗余的病毒操作分类单元重叠群(≥ 800 bp)和3473个高质量的病毒基因组；② 牡蛎中的新型病毒具有多样性，包括数据读取数、病毒操作分类单元及高质量病毒基因组；③ 牡蛎中的病毒与海其他栖息地中的病毒具有明显差异，尤其是发现的新型圆环病毒的高度多样性表明牡蛎可能是圆环病毒的潜在热点区域；④ 牡蛎中富集的病毒具有良好的组织性，可在组成和功能水平上响应宿主和外部环境的变化。 A remarkably diverse and well-organized virus community in a filter-feeding oyster

2023-01-07, doi:10.1186/s40168-022-01431-8

国内团队：多组学分析揭示梅花鹿早期生命发育的代谢适应性

Microbiome[IF:16.837]

① 代谢分析表明脂肪酸谱的变化与梅花鹿体重增加是同步的；② 脂肪酸β-氧化和色氨酸及支链氨基酸的代谢，在调节肝脏代谢方面起重要作用；③ 细菌、病毒和古细菌在鹿出生不久就定植于GIT（胃肠道），微生物的演替是由中心种群的合作网络所驱动；④ 与甘露糖和氨基酸代谢相关的菌群代谢途径丰度增加，标志着GIT挥发性脂肪酸增加；⑤ 脂肪酸代谢及小肠、大肠免疫反应主导GIT功能转变，且坏死和凋亡在促进回肠和结肠上皮细胞发育中或起到了促进作用。 Integrated multi-omics of the gastrointestinal microbiome and ruminant host reveals metabolic adaptation underlying early life development

2022-12-12, doi:10.1186/s40168-022-01396-8

国内团队：肠道菌群可帮助鸡对抗肾型传染性支气管炎病毒感染

Microbiome[IF:16.837]

① 用广谱抗生素（ABX）清除SPF鸡的肠道菌群导致鸡对肾型传染性支气管炎病毒（IBV）抵抗力下降，感染后病毒载量增加、临床症状加重；② ABX处理的鸡感染IBV后，激活的巨噬细胞比例显著下降，I型干扰素（IFN-I）产生减少，外周血单核细胞和脾脏中干扰素刺激基因（ISG）表达下调；③ 补充鼠乳杆菌可抑制ABX处理的鸡感染IBV；④ 机制上，鼠乳杆菌的胞外多糖通过干扰素受体IFNAR诱导巨噬细胞分泌IFN-I，促进ISG表达从而起到抗IBV感染作用。 Chicken intestinal microbiota modulation of resistance to nephropathogenic infectious bronchitis virus infection through IFN-I

2022-10-03, doi:10.1186/s40168-022-01348-2

国内团队：肠道菌群参与产后奶牛的氧化应激

Microbiome[IF:16.837]

① 粪便菌群组成与产后氧化应激（OS）存在密切联系，可解释性为43.1%；② 高OS（HOS）和低OS（LOS）奶牛显著差异的有17个细菌属和19个物种，其中9个属、16个种与OS显著负相关，Marasmitruncus和Ruminococcus_sp._CAG:724有最强的相关性；③ 鉴定出58种显著不同的代谢物，其中19种是菌群或菌群和宿主的共代谢产生，且富集在谷氨酰胺、谷氨酸、甘氨酸和半胱氨酸代谢；④ 小鼠灌胃HOS粪菌，OS更高，血浆谷胱甘肽过氧化物酶和谷胱甘肽含量更低。 The hindgut microbiome contributes to host oxidative stress in postpartum dairy cows by affecting glutathione synthesis process

2023-04-22, doi:10.1186/s40168-023-01535-9

付云贺等Microbiome：“肠源性乳腺炎”的新机制

Microbiome[IF:16.837]

① 乳腺炎奶牛发生瘤胃菌群紊乱，血清LPS浓度增加，碱性磷酸酶（ALP）活性降低，并伴发系统性炎症；② 将乳腺炎奶牛瘤胃菌移植给小鼠（M-RMT）可诱导小鼠乳腺炎和系统性炎症，并破坏血乳屏障；③ M-RMT诱导肠道菌群紊乱，破坏肠屏障并促进LPS入血，诱导机体系统性炎症；④ 肠道菌群紊乱诱导的持续低度内毒素血症引起ALP唾液酸化，降低ALP活性，促进小鼠乳腺炎发生并恶化大肠杆菌诱导的乳腺炎，而补充小牛肠碱性磷酸酶cIAP或唾液酸酶抑制剂Zanamivir可缓解乳腺炎症。 Gut dysbiosis induces the development of mastitis through a reduction in host anti-inflammatory enzyme activity by endotoxemia

2022-12-01, doi:10.1186/s40168-022-01402-z

陈松林院士+宁康等：肠道菌群介导半滑舌鳎对弧菌病的抵抗力

Microbiome[IF:16.837]

① 收集弧菌病抗性和易感的半滑舌鳎肠道组织及内容物，进行多组学分析；② 发现抗性组和易感组的肠道菌群组成、功能及宿主基因表达模式显著不同；③ 肠道菌群通过菌-肠道-免疫轴调控宿主免疫稳态和炎症，增强半滑舌鳎对弧菌病的抵抗力；④ 如褐杆菌属通过调节其hdhA和宿主cyp27a1基因在胆汁酸合成途径中上调，其trxA和宿主akt基因在促炎因子合成途径中下调，减轻炎症和疾病感染；⑤ 肠道菌群和宿主基因可作为生物标志物区分抗性和易感的半滑舌鳎。 Intestinal microbiome-mediated resistance against vibriosis for Cynoglossus semilaevis

2022-09-23, doi:10.1186/s40168-022-01346-4