郭春君团队Cell突破:在复杂菌群中揭示单个肠菌基因功能,新方法来了
① 开发一套对5个菌门的非模式肠道细菌进行基因操纵的高通量流程;② 通过多因子优化,确定了对梭菌纲38个非模式菌株进行基因转移的方法,对其中28个菌株建立了基于CRISPRi或II类内含子的基因编辑工具;③ 该方法能有效进行细菌基因编辑,并在体外和小鼠体内调节对应的细菌代谢产物(如SCFA);④ 构建敲除baiH(胆汁酸7α脱羧通路的关键基因)的某梭菌菌株,将该突变株或对照菌株定植到有复杂菌群的小鼠中进行对比分析,表明敲除baiH影响了宿主的胆汁酸池和菌群组成,并通过减少丹毒丝菌科的扩张减轻了结肠炎症。
2022-01-19