郭锐进
深圳华大生命科学研究院生物信息副研究员
华⼤⽣命科学研究院基因组学副高级研究员,澳门科技⼤学博⼠。华大基因学院研究生导师与西北大学研究生导师。聚焦“脑-菌”轴、自身免疫疾病宏基因组与人体共生菌参考集构建等研究⽅向。 在 Nature Biotechnology, Nature Communications,Cell Systems, Molecular Psychiatry , Microbiome 等期刊发表 11 篇科研论⽂,累计影响因子大于150,总引⽤大于1400,H-index:10 ,i10-index:10(Google Scholar, Since 2018), 其中第一作者(含共同))或者通讯作者8篇。 受邀担任学术期刊Frontiers in Microbiome客座专题主编,Frontiers Cellular and Infection Microbiology客座编辑。Journal of Neuroinflammation, BMC Microbiology, Frontiers in Microbiology等杂志审稿人。参与多项澳门科技发展基金项目和深圳市基础创新计划。已授权/申请专利13项,软件著作权4项,技术转产3项。学术兼职包括中国微循环学会-阿尔茨海默病⽣物标志物分会常委委员, 世界中医药学会联合会中医药免疫专业委员会会员,中国生物物理学会肠道菌群分会会员等。
聂超+郭锐进:揭开人体皮肤微生物组的神秘世界面纱
① 对450个面部样本进行深度鸟枪法测序,并结合2069个公开的皮肤宏基因组数据集,构建了一个统一的人体皮肤基因组目录(UHSG);② UHSG囊括来自5779个宏基因组组装基因组的813种原核生物,包括覆盖20个门、1385个新组装基因组的470个新物种;③ 基于UHSG鉴定了皮肤微生物组不同门之间代谢和耐药功能的差异,对接近完整基因组的次级代谢物的分析发现1220个假定的新次级代谢物;④ 单核苷酸变异揭示皮肤环境可能对条件病原体负选择的保护机制。
2023-08-07
马现仓+朱峰:抗疫医护人员的长期肠道菌群失调与创伤后应激症状的关联
① 用16S rRNA基因测序分析抗疫一线医护人员(FHW)肠道菌群的长期变化,及其与心理应激的关系;② 抗疫应激导致FHW严重的抑郁、焦虑和压力,扰乱肠道菌群,肠道失调持续至少半年;③ 在半年随访期间,不同菌的变化轨迹不同;④ 具抗炎作用的栖粪杆菌属和挑剔真杆菌,与应激症状明显相关;⑤ 基线时(一线抗疫结束后)低丰度的某未培养霍氏真杆菌与高丰度的埃氏拟杆菌,可预测FHW创伤后应激症状复发。
2022-02-12
马现仓+贾慧珏等:精神分裂症患者的肠道微生物组特征
① 收集90例未经治疗的精神分裂症患者和81例对照的粪便样本,通过宏基因组关联分析鉴定出83个相对丰度有显著差异的OTU;② 患者菌群中,兼性厌氧菌和口腔菌增多,短链脂肪酸合成、色氨酸代谢、多种神经递质的合成/降解等功能潜力发生改变;③ 包含26个OTU的诊断模型可较准确的区分患者和对照(AUC=0.896),并在测试队列中得到确认(AUC=0.765);④ 移植患者中富集的前庭链球菌,可诱导小鼠的精神分裂症样行为、改变外周神经递质水平。
2020-03-31
国内团队:强制性脊柱炎患者的肠道菌群组成及功能变化
① 对比分析85名强直性脊柱炎(AS)患者及62名健康人的肠道菌群,发现惰性真杆菌等5种菌种在AS患者中富集;② 在AS患者的肠道菌群中,氧化磷酸化、脂多糖生物合成和粘多糖降解作用增强;③ AS患者中存在脆弱拟杆菌和III型分泌系统等与自身免疫相关的特征;④ AS患者肠道菌群中部分富集的细菌多肽可模拟II型胶原,并促进特定HLA分类(HLA-B27)AS患者的PBMC产生IFN-γ。
2019-12-02
马现仓+贾慧珏等:肠道菌群异常可影响色氨酸代谢,促进小鼠精神分裂症状
① 给抗生素处理的小鼠移植健康人(HC)或精神分裂症(SCZ)患者的粪菌;② SCZ小鼠有精神运动亢进和认知损伤等SCZ样症状;③ SCZ小鼠的色氨酸(Trp)水平降低,大脑和血液中Trp分解代谢的犬尿氨酸(Kyn)-犬尿喹啉酸(Kyna)通路活性上升,脑内特定区域的神经递质多巴胺和5-羟色胺增多;④ SCZ小鼠的结肠腔滤液可促进Trp-Kyn-Kyna代谢途径关键酶IDO1和KAT II的活性;⑤ HC和SCZ小鼠的肠道菌群组成和功能有差异,可能影响Trp代谢和神经递质水平。
2019-08-07
刘良+贾慧珏等:干酪乳杆菌可改善大鼠关节炎
① 关节炎模型(AIA)大鼠中,从疾病诱导前开始口服干酪乳杆菌ATCC334,可显著改善症状,抑制关节肿胀、降低关节炎严重性评分,具有骨保护作用;② 这些大鼠失调的肠道菌群也得到改善,AIA中丰度减少的乳杆菌(罗伊氏乳杆菌、阴道乳杆菌等)恢复至正常水平、嗜酸乳杆菌丰度上升;③ 干酪乳杆菌治疗的AIA大鼠中,血液中多种促炎细胞因子表达降低,与肠道菌群中特定菌种的变化相关;④ 干酪乳杆菌的疗效与氧化应激的氧化还原平衡维持有关。
2019-07-18
刘良+贾慧珏等:干酪乳杆菌可改善大鼠关节炎
① 关节炎模型(AIA)大鼠中,从疾病诱导前开始口服干酪乳杆菌ATCC334,可显著改善症状,抑制关节肿胀、降低关节炎严重性评分,具有骨保护作用;② 这些大鼠失调的肠道菌群也得到改善,AIA中丰度减少的乳杆菌(罗伊氏乳杆菌、阴道乳杆菌等)恢复至正常水平、嗜酸乳杆菌丰度上升;③ 干酪乳杆菌治疗的AIA大鼠中,血液中多种促炎细胞因子表达降低,与肠道菌群中特定菌种的变化相关;④ 干酪乳杆菌的疗效与氧化应激的氧化还原平衡维持有关。
2019-07-18
深圳华大生命科学研究院生物信息副研究员
华⼤⽣命科学研究院基因组学副高级研究员,澳门科技⼤学博⼠。华大基因学院研究生导师与西北大学研究生导师。聚焦“脑-菌”轴、自身免疫疾病宏基因组与人体共生菌参考集构建等研究⽅向。 在 Nature Biotechnology, Nature Communications,Cell Systems, Molecular Psychiatry , Microbiome 等期刊发表 11 篇科研论⽂,累计影响因子大于150,总引⽤大于1400,H-index:10 ,i10-index:10(Google Scholar, Since 2018), 其中第一作者(含共同))或者通讯作者8篇。 受邀担任学术期刊Frontiers in Microbiome客座专题主编,Frontiers Cellular and Infection Microbiology客座编辑。Journal of Neuroinflammation, BMC Microbiology, Frontiers in Microbiology等杂志审稿人。参与多项澳门科技发展基金项目和深圳市基础创新计划。已授权/申请专利13项,软件著作权4项,技术转产3项。学术兼职包括中国微循环学会-阿尔茨海默病⽣物标志物分会常委委员, 世界中医药学会联合会中医药免疫专业委员会会员,中国生物物理学会肠道菌群分会会员等。
聚焦“脑-菌”轴、自身免疫疾病宏基因组与人体共生菌参考集构建等研究⽅向。