为阐明非抗生素药物影响菌群的直接机制，通过计算预测细菌源性药物靶标蛋白同源物（BDTPHs），并进行了多尺度实验验证。

中国药科大学李萍、李菁与团队在iMeta发表研究。本研究的发现促进了人类肠道菌群中编码胆盐水解酶的关键乳酸杆菌的分类鉴定，并阐明了它们对胆汁酸肝肠循环调节的贡献，这将有助于未来编码胆盐水解酶的益生菌应用于治疗以改善人类健康。

中国药科大学周伟、李菁团队，联合南京中医药大学李永明、单进军团队，在Gut发表最新研究成果，通过分析RA患者样本和小鼠实验，发现肠道中的狄氏副拟杆菌（Parabacteroides distasonis）可通过产生特定的次级胆汁酸，发挥免疫调节作用，从而改善RA；而中药活性成分人参皂苷Rg2可恢复狄氏副拟杆菌丰度，发挥抗关节炎作用。这些发现表明，狄氏副拟杆菌和人参皂苷Rg2或能作为治疗RA的潜在益生菌和益生元制剂，也为中药成分（如人参皂苷）改善RA提供了新的机制见解。

中国药科大学的李菁、齐炼文和尚靖与团队发表在NPJ Biofilms and Microbiomes上的一项研究系统分析了人类肠道菌群中能产生TMA裂解酶的菌属，并首次报告了一个产生TMA的Lachnoclostridium属细菌L. saccharolyticum WM1，它在动脉粥样硬化患者中大量存在。因此靶向Lachnoclostridium属细菌可能成为治疗动脉粥样硬化的潜在治疗靶点。