宋云皓

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宋云皓

文章数：6篇

微生物组定义的重新审视:旧概念和新挑战

本文基于2019年3月6日在奥地利举行的研讨会框架中的讨论。其根据1988年Whipps等人提供的简短、清晰和全面的描述，提出了微生物组的定义，并根据最新的技术发展和研究成果，对其进行了一系列新颖的建议。明确区分了微生物组（microbiome）和微生物群（microbiota）的术语，并提供了一个全面的讨论，考虑微生物群的组成，微生物群的异质性和时间和空间动态，微生物网络的稳定性和弹性，核心微生物群的定义，以及功能相关的关键物种。

微生物组微生物群微生物网络核心微生物群关键物种

靶向结直肠癌干细胞的抗菌剂AM404

促进肿瘤的炎症与结直肠癌（CRC）的发展密切相关。然而，在癌症干细胞（CSC）强制分化后，调控抗癌治疗效力的抗生素、抗菌药物和信号通路尚未完全确定。最新发表在Cancers的研究通过筛选NIH临床采集的抗菌抗炎小分子药物库，用以靶向结直肠癌干细胞样细胞（CRC-SC）的分化，确定具有抗菌活性的对乙酰氨基酚代谢物AM404作为潜在候选药物，并揭示了AM404改变FBXL5癌基因介导耐药和CRC侵袭的分子机制。

结直肠癌 AM404 Cancer stem cells colonosphere CRC

肠道菌群演化

Nature子刊：用Hi-C技术追踪人体肠道菌群的演化和水平基因转移

《Nature Microbiology》发表的这项研究，通过Hi-C技术鉴定了肠道微生物组在十年间的变化，包括附属元件（非核心基因元件）的大量交换和核心基因组的适应性进化。

肠道菌群演化 Hi-C 水平基因转移

Nature子刊：活体成像在细胞层面看清小鼠结肠内的动态变化

活体内显微技术可以在动物中以单细胞分辨率观察动态过程，但受限于结肠的自主运动，以及容易引起结肠梗阻，这种技术一直无法在结肠中应用。Nature Communications近期报道了一种新方法，可解决小鼠结肠活体成像时的上述问题，能实现对在若干天内对小鼠结肠同一部位在细胞层面进行一系列的活体成像，可用于研究结肠内的多种生理过程。

活体成像结肠荧光成像 Chrysothemis C Brown Chrysothemis C Brown

宿主-菌群互作

广东海洋大学团队：家猪的宿主-肠道菌群互作（综述）

猪不仅是重要的养殖动物，也是研究菌群-宿主互作的模式生物。Gut Microbes近期发表了来自广东海洋大学团队的综述，回顾了家猪相关的肠道菌群与宿主互作的研究进展。

宿主-菌群互作 Gut Host-microbe interactions Immunity Microbiome

Cell子刊：挖掘菌群天然产物的新工具

核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPP）是一类天然产物，微生物是其重要来源，在医药和食品工业上有广泛应用前景；但目前对这类物质的发掘存在局限性。Cell Systems报道的一种软件工具——MetaMiner，可通过分析同一微生物群落的宏基因组和质谱数据，来挖掘其中的已知和未知RiPP。

天然产物 ribosomally synthesized and post-translationally modified peptides computational mass spectrometry metagenomics natural products discovery