宿主-菌群

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宿主-菌群

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Nature子刊：宿主-微生物如何共代谢产生马尿酸

人体肠道菌群产生数十种小分子，这些小分子在血液中循环，积累到与药物相当的水平，可影响宿主生理。尽管这些代谢产物对人类健康和疾病具有重要意义，但这些分子的来源及其在宿主中的命运仍然基本未知。Nature Communications近期发表的文章，揭示了一种宿主-微生物共代谢途径，以产生马尿酸，而马尿酸是哺乳动物尿液中最丰富的有机酸之一。即肠道细菌将苯丙氨酸还原为苯丙酸，宿主通过中链酰基辅酶a脱氢酶(MCAD)对苯丙酸进行β氧化产生马尿酸。

宿主-菌群代谢马尿酸

宿主-菌群蛋白间相互作用捕捉疾病相关通路

为了确定人类相关细菌影响宿主健康的潜在途径，作者利用公开可用的种间蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 数据来寻找与已知人类-蛋白质相互作用物具有高度序列同一性的菌群衍生蛋白质簇，并在九项独立的宏基因组研究中观察到推定的人类相互作用细菌基因的不同靶向，作者表示这种以宿主为中心的分析提供了一个机械假设生成平台，并广泛地将人类功能注释添加到共生细菌蛋白中。总之作者探索了肠道菌群中与结合人类蛋白质的相互作用物具有同源性的蛋白质，为了只研究那些与疾病相关的相互作用，作者检查了它们在九个宏基因组群中的丰度，将数百种菌群蛋白推定为与疾病相关的角色。

宿主-菌群宿主健康蛋白-蛋白相互作用宏基因组研究同源性