Xichuan Zhai

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粪便样本储存缓冲液对下游噬菌体分离或测序的影响

这是发表在Microbiome上的一份工作，作者主要讨论了在不同粪便样本储存缓冲液中，噬菌体的感染活性和核酸稳定性的变化。他们发现不同缓冲液中视具体你的感染性和基因组回收率高度可变，CANVAX或DNA/RNA Shield类缓冲液会快速灭活噬菌体，但它们的宏基因组组成变化最小，同时由于其内含有核酸酶抑制剂，会导致去除游离核酸效率降低，从而引入较多细菌序列污染。其中，在4°C的SM缓冲液存储样品可用于噬菌体分离，-80°C存储可用于测序分析。其他缓冲液存储的样品应在核酸提取前洗涤干净缓冲液残留，以降低影响。