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Yanqiang Ding
文章数:2篇
于君+佘军军:揭示肠道噬菌体DNA甲基化情况及其作用
肠道噬菌体对人类健康具有重要影响,甲基化在噬菌体的DNA识别、基因表达调控和复制中发挥着关键作用,然而肠道噬菌体DNA甲基化状况很大程度上未知。近日,香港中文大学于君团队联合西安交通大学佘军军团队在Nucleic Acids Research上发表文章,通过对人类粪便样本进行PacBio测序,揭示了肠道噬菌体DNA甲基化情况及其潜在作用,有助于加强对肠道噬菌体生存和人类健康的理解。
人类肠道病毒组
于君团队:人肠道病毒组超深度测序,发现1058种新病毒
缺少病毒参考基因组是病毒组研究面临的一大挑战。香港中文大学于君团队近期在Gastroenterology发表研究,通过改良病毒DNA提取,结合基于三代和二代测序的超深度宏基因组测序,以及配套的生信分析流程,从健康人粪便中解析出1058种基因组完整的新病毒,并对这些病毒基因组进行了多角度分析。这些发现可助力疾病诊断、扩充病毒参考基因组,为进一步开展病毒组研究作出贡献。
人类肠道病毒组
三代测序
PacBio测序
超深度宏基因组测序
诊断标志物