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Kayla M Williamson
文章数:2篇
下呼吸道感染
儿童下呼吸道感染的新型诊断模型
本研究通过对儿童气管吸取物进行宏基因组检测,构建下呼吸道感染的鉴别诊断分类器,结果提示效果较好。现有的临床诊断试验并不能很好捕捉到病原体、宿主反应之间的关联。因此本研究为儿童的下呼吸道感染的鉴别诊断提供了新的思路。
下呼吸道感染
研究论文
宏基因组检测
患儿
微生物组
16S rRNA基因
修订后的PCR方案可提高测定细菌群落组成的灵敏度
细菌DNA样品的高通量测序使我们能够同时快速的对来自于多个样品的细菌群落进行分析。然而对于具有少量的细菌或低的细菌载量的样品,或者含有大量来源于非细菌源(比如宿主)DNA的样品,这些方法的使用具有局限性。该文章提出了一种改进的方案,可提高检测具有中等或低的细菌载量样品的细菌群落组成的灵敏度。为了测试大范围的细菌载荷,研究人员使用了来自插管儿童患者的重复气管吸出样本,改进后的方案比标准方案多检测了超过30%的样本序列数据,且这两种方案获得了相似的群落多样性和群落组成。这些结果表明这一改进方案允许在不影响整体结果的情况下获得更高的灵敏度,并成为一个能在高背景、少细菌环境下收集更多的菌群数据的可行方法。改进后的扩增方案代表了一种提高细菌群落分析灵敏度的可行方法,这对于研究细菌载量高度可变的人气道菌群非常重要。
16S rRNA基因
菌群
扩增子
机械通气