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Jeffery L Dangl
文章数:9篇
植物微生物组
Cell:植物微生物组科学面临的突破、挑战和机遇(综述)
跨物种和跨生态系统的植物微生物群的基本定义,加上还原论实验模型的开发以及利用微生物对植物表型的操纵,激发了人们将其应用于农业的兴趣。然而,绝大多数在实验室和温室中表现出植物生产力特征的微生物在田间都失败了。近日,北卡罗来纳大学教堂山分校研究人员在Cell发表最新综述,论述了将有益微生物从实验室转化到田间地头的最新突破、挑战和机遇,值得关注。
植物微生物组
互作
综述
植物免疫系统
多菌株
根际
Nature:Jeff Dangl团队揭示微生物组中的单一细菌属维持根的正常生长的机制
复杂的土壤环境中主要包括植物根系组织、非生物环境因素和丰富的微生物群落三方,其中微生物群落根据与植物的关系又分为有益菌和有害菌,这些菌落会随着根际环境的变化调整与宿主的关系,甚至与其它菌落的相互作用,进而影响植物的健康。微生物群落发挥作用可以是直接的分子互作,也可以通过次级代谢产物或信号分子进行调控,例如生长素。由于复杂的土壤环境,多数微生物种群的功能研究起来比较困难,很多隐藏的分子机制也未可知。2020年9月30日,美国北卡罗来纳大学教堂山分校植物免疫学专家Jeffery L. Dangl教授团队在Nature上发表了题为A single bacterial genus maintains root growth in a complex microbiome的研究论文。该研究经过大规模筛选和功能验证,确定了根际环境贪噬菌属(Variovorax)在植物-微生物-微生物互作网络中的核心地位,并且发现了其调控生长素浓度维持植物根系健康的分子机制,鉴定到广泛分布于其基因组的关键功能位点,加深了我们对根际复杂互作网络的认识,研究结果为开发抗逆、高产作物提供了一种潜在的新策略。
根际
贪噬菌属(Variovorax)
生长素浓度
植物根系健康
关键功能位点
植物微生物组
病原体之外-微生物组与植物免疫系统的相互作用
很多微生物和植物之间的互作关系是非致病的,但微生物中一些表达的分子可能被植物免疫系统识别。因此植物微生物组研究的一个主要问题就是植物是否能识别,或怎样区分共生微生物和病原体。病原微生物规避植物免疫的策略是否适用于微生物组?微生物组可以促进植物免疫吗?环境的变化如何影响植物免疫和微生物组之间的相互关系?这些是新兴领域中的一些关键问题,近期已得到越来越多的关注。本文中,作者回顾了与植物免疫系统和微生物之间的相互作用相关的最新研究和新颖概念,主要侧重于拟南芥及其相关物种作为研究模型的实用性。
植物微生物组
植物免疫
免疫受体
MAMP
MTI
免疫系统
Science:点评背靠背Science,视频揭秘植物如何在与病菌的斗争中取胜?
植物具有复杂、精细调控的免疫系统,用于识别病原微生物、激活防卫反应,从而保护自己免受侵害。植物细胞内数目众多的抗病蛋白,是监控病虫侵害的哨兵,也是动员植物防卫系统的指挥官。抗病蛋白被发现至今已有二十多年,但人们仍然不清楚它们的工作原理。清华大学柴继杰团队、中国科学院遗传与发育生物学研究所周俭民团队和清华大学王宏伟团队最近的联合研究,在植物免疫研究领域取得重大突破。合作团队发现由抗病蛋白组成的抗病小体并解析其电镜结构,从而揭示了抗病蛋白管控和激活的核心分子机制,为更好利用抗病蛋白提供了新的可能。相关成果以两篇长文(Research Article)形式,于4月5日发表在国际学术期刊《科学》(Science,Wang et al., 2019a, b)。Science杂志同期发表了国际植物抗病研究权威科学家Jeffery Dangl和Jonathan Jones撰写的题为High five: a pentangular plant inflammasome 的专文评述,高度评价这一成果。
免疫系统
炎症小体
NLR
ZAR1
病原体
植物菌群
Cell子刊:运用组学方法揭示植物共生菌群功能(综述)
植物-菌群互作对植物的生长具有重要影响,而阐释共生菌群的基因功能对研究植物-菌群互作非常重要。本综述回顾了研究共生菌群功能的多组学方法,比较了各种组学方法在阐释共生菌群基因功能上的优缺点,并总结了目前已发现植物共生菌群功能。本文对研究植物-菌群互作,并以此开发促进作物生长的新手段具有参考价值。
植物菌群
gene function
genomics
metabolomics
Omics
细菌基因组
Nature子刊:微生物如何适应植物的?
是什么使病原和共生菌都能与真核宿主保持密切联系呢? Nature Genetics于发表了美国北卡教堂山的Jeffery L. Dangl团队领衔,美国能源部JGI研究所的Tanja Woyke和Susannah G. Tringe共同通讯的文章"Genomic features of bacterial adaptation to plants",揭示了微生物是如何在与植物的共生、竞争、致病中与植物基因组共进化的历史。同期还配发了Ryan A. Melnyk和Cara H. Haney两位大佬的news & views对文章的导读和重要性评价。重镑成果,值得细读。
细菌基因组
植物
宏基因组
基因家族
同源序列
植物相关菌群
COPB:植物益生菌,新农业时代的生产力担当(综述)
近期关于可利用于农业种植的植物益生菌的最详细综述,非常值得认真阅读,特别推荐。
植物相关菌群
植物益生菌
植物菌群
Nature:植物根系菌群如何平衡营养与免疫?
植物相关菌群,发表在Nature,必定是大发现,值得好好看。
植物菌群
根系菌群
拟南芥
免疫
磷酸盐胁迫
联合微生物组计划
Science:呼吁发起“联合微生物组计划”
这是美国科学家在“国家微生物组计划”启动之前在Science上呼吁启动“联合微生物组计划”的文章,很值得没看过的人看一看,看看这样的大型计划会关注哪些领域,要有什么人参与,需要什么资源。
联合微生物组计划
人类微生物组计划
Kenya Honda
Dan R Littman