James M Tiedje

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James M Tiedje

文章数：6篇

微生物命名

Nature子刊：命名不可培养的古菌和细菌的两条路径（共识）

随着DNA测序技术的广泛应用，人们发现了大量不可培养的古菌和细菌，对于这些原核生物的命名目前仍缺少清晰、稳定的规则。为解决这一问题，在Nature Microbiology上发表的一篇共识声明文章提出了包含两条路径的路线图，并呼吁学界共同努力来完善和推进相关工作，推荐专业人士参考。

微生物命名细菌古菌共识声明

Nature子刊：气候变暖影响草地菌群的群落演替

Nature Climate Change上发表的一项最新研究结果，气候变暖显著改变了土壤中的菌群群落，并增加了群落的趋异演替，其中来自随机因素的影响较大。

土壤菌群草原生态系统群落生态学 Housheng Hansen He Tae-Hee Kim

宏基因组序列分类

在基因组水平进行分类学和基因多样性分析的新工具

Nucleic Acids Research近期发表文章，介绍了一个新型在线分析工具，以宏基因组等多种基因组数据为输入，对古菌和细菌进行分类学和基因多样性分析，比16S rRNA有更高的分辨率，推荐给有需要的专业人士。

宏基因组序列分类在线工具 Domenico Praticό Antonio Di Meco

抗生素耐药基因

Bioinformatics：在宏基因组中分析ARG的新工具

如何快速地鉴定并分析宏基因组样本中的抗生素耐药基因，近期Bioinformatics[IF：7.307]发表的这篇文章介绍了一种新的在线分析工具，其中包含了一个结构化的抗生素耐药基因数据库，推荐专业人士阅读。

抗生素耐药基因隐马尔科夫模型宏基因组 Martin Laclaustra Martin Laclaustra

土壤微生物组

ISME：如何改善土壤微生物组参考数据库？

人类只了解了土壤微生物组中一小部分的生物多样性，需要有更多投入来丰富相关数据库，ISME特别发出这篇文章，值得看一看。

土壤微生物组参考数据库 Theresa A Laguna Theresa A Laguna

土壤微生物

mBio：每年修剪地上的植物，会改变土壤微生物么？

清华和俄克拉荷马大学周集中教授和团队的一个有意义也有趣的工作，推荐大家阅读。

土壤微生物地上植物 Tarah Lynch Gary Van Domselaar