Chirag J Patel

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Chirag J Patel

文章数：5篇

菌群-疾病关联性

菌群与疾病的关联，很多不可靠？

肠道菌群与疾病/表型的关联研究具有重要意义，不仅能为疾病的诊断提供候选标志物，还可指导后续的机制研究。然而，菌群关联研究中常可见到不一致的结果。造成这一现象的原因可能有很多，比如DNA提取方法、生信分析流程、建模策略、混杂因素的校正等，都可能对研究结果产生影响。PLoS Biology发表的这项研究，提出了一种方法，可用于评估菌群关联研究结果的可靠性，并用该方法对已发表的部分微生物-疾病关联进行了系统性的评估。

菌群-疾病关联性

Nature子刊：跨疾病的微生物组诊断指标或可实现！

Nature Communications近期发表的文章，提出微生物组疾病“结构”，即用一个识别模型选择相关联的平台将100万多个微生物特征与13个队列的7个宿主表型联系起来，通过量化微生物组疾病关联的保守性和异质性，并从基因水平的分析鉴定菌株特异性、交叉疾病、正向和负向的关联。研究或推动基于基因的跨疾病微生物组诊断。

疾病诊断跨疾病微生物组诊断指标

膳食指南推荐：可维持红肉或加工肉类摄入水平（指南）

近期Annals of Internal Medicine发表了一项指南，该指南基于同期发表的5篇系统综述，推荐成年人可维持当前红肉和加工肉类摄入水平。针对该指南，有几点需注意：1）该指南基于的队列研究荟萃分析，其结果是认可红肉/加工肉类与疾病的负相关关系，但指南给予高质量队列研究的权重很低。2）该指南基于的随机对照试验系统综述，未发现红肉对疾病的影响，但该系统综述的结论主要来自于一项随机对照试验。这项随机对照试验的目的并不是探究红肉，而是探究脂肪摄入，且该试验两组间红肉摄入量的差别并不大。此外，该系统综述并没有探讨加工肉类（也没有研究加工肉类的随机对照试验）。3）该指南制定时，同时考虑了人们的喜好，这一点不妥。比如吸烟人群不愿意戒烟，并不意味着我们就不应该向他们宣传戒烟。4）该指南未考虑动物福利和环境保护等因素。在追求可持续发展的今天，未将环境保护考虑在内的指南，其可行性存疑。

红肉加工肉类指南膳食营养 Xian-Zheng Zhang

微生物组基因多样性

Cell子刊：人消化道中海量的微生物基因，有一半是“独特的”

人类微生物组中有多少微生物基因？Cell Host and Microbe上周发表的一项研究分析了3600多个人口腔或肠道的宏基因组，鉴定出超过4500万个微生物基因，发现每个人有一半的微生物基因是独特的，这些基因具有多样化的潜在功能，主要存在于稀有菌株中。这些发现揭示了人类微生物组基因巨大的多样性，为进一步分析微生物组基因和功能与宿主健康的关系打下基础。

微生物组基因多样性 Oral microbiome gut microbiome metagenomics gene catalog

参考值范围

JAMA：在诊断和治疗中如何定义“正常”值

JAMA上发表的一篇观点文章，讨论了应如何确定诊疗中某项指标的“正常”值，在精准医疗和大数据的时代，这需要研究者、实验室、医疗机构、杂志和基金多方的协作。

参考值范围 Hannah Clark Hannah Clark