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Alvaro Sanchez
文章数:3篇
微生物生态学
Science:深入理解多物种微生物群落中出现的共存现象
生态学研究中要解决的其中一个重要问题是了解维持微生物生物多样性的机制。过去有关微生物共存的研究主要集中在物种对上,但目前还不清楚多物种群落中的共存是否需要孤立的成对共存。为了解决这个问题,Science最近发表的研究,在体外对12个不同富集群落中稳定共存的成员进行了数百次配对竞争实验。为了确定这些实验的结果,研究团队开发了一个自动图像分析流程来量化物种丰度。结果发现,竞争排斥是最常见的结果,而且具有很强的层次性和传递性。由于许多在稳定的多物种群落中共存的物种无法在相同条件下进行成对共培养,所以,多物种共存是一种涌现现象。这项研究强调了群落背景对于理解复杂生态系统中共存起源的重要性。
微生物生态学
微生物生态学
Cell子刊:微生物群落的群落功能景观(综述)
将微生物群落的组成和功能定量地联系起来是微生物生态学要解决的一个主要问题。微生物群落的功能来自于细胞之间复杂的分子互作网络,进而产生菌株和物种之间的种群水平互作。然而,将这种复杂性纳入预测模型极具挑战。Cell Systems近期发表的这篇综述提出,受遗传学中类似问题的启发(从基因型出发定量预测表型),可以定义一个生态群落功能(或结构功能)景观的概念,对群落的组成和功能进行映射。作者概述了目前对这些群落景观的理解、其用途、局限性和待决问题。将进化和遗传学的强大预测方法引入生态学研究,或能为设计和优化微生物群落提供助力。
微生物生态学
微生物群落
合成群落
群落功能景观
群落组装
Science:菌群组装规律中的简单之美
特定条件下菌群结构的形成有什么规律,是菌群研究的一个主要问题。Science本周发表的最新研究,监测了单一碳源条件下形成的上百个菌群,结合数学建模方法,揭示了复杂群落组装中的简单性,值得菌群研究者特别关注。
群落组装
代谢副产物
互养
Ryu Okumura
Kiyoshi Takeda