刘星吟:研发微生物绝对丰度变化新方法(QMD)
热心肠小伙伴们 2023-01-19
南京医科大学刘星吟团队发表研究,提出一种基于微生物相对丰度来估计不同条件下各类群中微生物绝对丰度变化的新方法(QMD),同时作者构造了基于QMD开展组间差异菌(DA)识别的统计检验假设模型。研究表明,微生物绝对丰度组间差异可以用其相对丰度加上组间的总微生物丰度的变化来估计。QMD方法得到了真实的微生物绝对丰度变化数据的验证。与其他方法相比,QMD在微生物差异丰度定量、DA识别、运行速度上都表现出较好的性能。

南京医科大学刘星吟团队发表研究QMD: A new method to quantify microbial absolute abundance differences between groups,提出了一种基于微生物相对丰度来估计不同条件下各类群中微生物绝对丰度变化的新方法(quantification of microbial absolute abundance differences,QMD),同时作者构造了基于QMD开展组间差异菌识别(differential abundant taxa,DA)的统计检验假设模型。研究表明,微生物绝对丰度组间差异可以用其相对丰度加上组间的总微生物丰度的变化来估计。QMD方法得到了真实的微生物绝对丰度变化数据的验证。与其他方法相比,QMD在微生物差异丰度定量、DA识别、运行速度上都表现出较好的性能。

专家简介
刘星吟
南京医科大学特聘教授,江苏省特聘教授
南京医科大学肠道微生态创新团队组长
刘星吟 南京医科大学教授,生殖医学与子代健康全国重点实验室A类科学创新PI, 博士生导师,南京医科大学肠道微生态创新团队组长,江苏特聘医学专家,江苏特聘教授,江苏省333高层次中青年领军人才。南京医科大学国际基因工程机器大赛(iGEM)指导老师和社团负责人。任中国医药教育微生态与健康专委副主任委员, 中国优生科学协会医学遗传学专业委员会副主任委员,中国神经科学学会儿童认知与脑功能障碍分会委员,中国生物物理学会肠道菌群分会委员,主要致力于肠道菌群与宿主表观遗传修饰互作对神经发育和生殖衰老发生发展的影响及其调控机制。近年来以通讯作者在 Cell Metabolism, GUT,Cell Host & Microbe、Gut Microbes等知名国际权威期刊共发表了30多篇高水平科研论文,授权专利8项,转化2项。任Cell Host& Microbe, GUT, Science Advance, Microbiome, Nucleic Acids Research, Cell Reports,Cell Medicine Reports, Gut Microbes,mSystem等20多本国际知名期刊的特约审稿人,承担科技部重点研发和国家自然科学基金委项目多项。
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