陈卫华+赵兴明+赫丽杰:实现疾病标志物识别和跨数据集比较的人类肠道菌群数据库GMrepo v2
热心肠小伙伴们 2021-12-04
GMrepo 是一个精心设计和一致注释的人类肠道宏基因组数据库,其主要目的是提高人类肠道宏基因组数据的可重用性和可访问性,并实现跨项目和表型比较。华中科技大学陈卫华、复旦大学赵兴明、中国医科大学人民医院赫丽杰作为共同通讯作者,在Nucleic Acids Research发表文章,介绍了 GMrepo 的更新版本GMrepo v2,在这个新版本中,作者收集了更多的项目、运行/样本和表型。

GMrepo 是一个精心设计和一致注释的人类肠道宏基因组数据库,其主要目的是提高人类肠道宏基因组数据的可重用性和可访问性,并实现跨项目和表型比较。华中科技大学陈卫华、复旦大学赵兴明、中国医科大学人民医院赫丽杰作为共同通讯作者,在Nucleic Acids Research发表文章GMrepo v2: a curated human gut microbiome database with special focus on disease markers and cross-dataset comparison,介绍了 GMrepo 的更新版本GMrepo v2,在这个新版本中,作者收集了更多的项目、运行/样本和表型。最重要的是,作者添加了疾病标记识别和已识别标记的跨项目/表型比较。GMrepo v2 可在以下网址免费获得:https://gmrepo.humangut.info。

专家简介
陈卫华
华中科技大学生命科学与技术学院教授、博士生导师
陈卫华,教授、博士生导师;海外引进高层次人才。研究主要方向是肠道菌群精细调控与人、动物健康。通过实验与生物信息学分析相结合,发现肠道微生态异常与疾病的关联;利用噬菌体或小分子物质对特定肠道细菌精准调控,以达到改善微生态、改善和治疗疾病之目的。截止2023年12月,以主要作者(通讯或第一)身份在Science、Gut、Cell Host & Microbe、Cell Metabolism、Nature Communications、Genome Biology、Microbiome、Molecular Systems Biology、Nucleic Acids Research、Advanced Science等杂志发表文章70多篇。引用6400多次,H-因子32。
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